青風藤（Sinomenium acutum）又有楓風藤、青藤、滇防己等之稱,它是一種傳統(tǒng)中藥,也被認為是一味重要的名族藥,用青風藤來治療類風濕性關節(jié)炎以及其他相似疾病已經(jīng)延續(xù)了一千多年。近年來,藥企和公司大量收購青風藤,青風藤野生資源的損壞程度極為嚴重,其種群數(shù)量急劇下降。本研究旨在一步步推測出青藤堿生物合成的完整通路,并對通路中可能起到關鍵調(diào)控作用的基因進行挖掘與驗證,為后期通過基因工程實現(xiàn)青風藤青藤堿的合成生物學及產(chǎn)業(yè)化應用奠定堅實的基礎。主要研究結(jié)果如下:1、運用分子生物學系統(tǒng)分類把全國各地收集的共63份野生青風藤植株分為了15種cp-DNA單倍型（C1-C15）,2018年挑選三年生15個cpDNA單倍型青風藤植株（根和莖均�。�,進行轉(zhuǎn)錄組測序,建立了青風藤轉(zhuǎn)錄組池庫。結(jié)果顯示:測序共獲得108.95Gb Clean Data,每個樣品的Clean Data都達到6 Gb以上,滿足分析要求,Q30堿基比≥92.98%;共拼接得到363104個轉(zhuǎn)錄本,其中包括281923個Unigene;根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測序得到的異喹啉生物堿KEGG通路圖,發(fā)現(xiàn)青風藤內(nèi)一共注釋到247個基因在這條通路... 

【文章來源】：湖南農(nóng)業(yè)大學湖南省

【文章頁數(shù)】：80 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

生物信息分析流程

圖 2-1 生物信息分析流程Fig. 2-1 Bioinformation analysis process2.3 結(jié)果與分析2.3.1 總 DNA 電泳檢測結(jié)果電泳檢測 DNA 質(zhì)量，結(jié)果如圖 2-2，可見電泳條帶為單一、清晰的亮帶，說明 DNA濃度較高能滿足后續(xù)實驗要求，可以滿足后續(xù) PCR 擴增反應的要求。

湖南農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文20圖2-3Nr統(tǒng)計圖Fig.2-3Nrstatistics注：為Nr庫比對上的物種分布圖。Note:ThespeciesdistributionmaponNrdatabasecomparison.2.3.7GO分類圖2-4GO分類圖Fig.2-4GOclassificationdiagram注：橫坐標為GO三個大類的下一層級的GOterm，縱坐標為注釋到該term下(包括該term的子term)的基因個數(shù)。Note:theabscissaistheGOtermofthenextlevelinthethreecategoriesofGO,andtheordinateisthenumberofgenesannotatedtothisterm(includingsub-termsofthisterm).GO數(shù)據(jù)庫包含三種基本分類，即：生物學過程（BiologicalProcess），細胞組分（CellularComponent）和分子功能（MolecularFunction）。對基因進行GO注釋，對注釋成功的基因根據(jù)GO三個大類的下一層級類別進行歸類統(tǒng)計。在青風藤中，注釋

【參考文獻】：
期刊論文
[1]傳統(tǒng)藥用植物轉(zhuǎn)錄組研究進展[J]. 李慧,馬德志,姜明,劉溪,陳曉婷,劉振艷.  中醫(yī)藥信息. 2018(06)
[2]青風藤藥用成分、藥理作用及栽培繁育研究進展[J]. 曾茜垚,楊華.  湖南生態(tài)科學學報. 2018(01)
[3]青藤堿抗炎鎮(zhèn)痛藥效作用及其機制研究[J]. 李鑫,魏艷霞,謝志忻,林也,蔡雄,仇萍.  中藥材. 2017(10)
[4]博落回中芐基異喹啉類生物堿生物合成與代謝工程研究概況[J]. 劉金鳳,黃鵬,唐昭山,曾建國.  中國現(xiàn)代中藥. 2017(10)
[5]轉(zhuǎn)錄組測序及其在藥用植物上的應用[J]. 趙振宇,王仕玉,郭鳳根,尹冬梅,朱旭海,杜玉霞.  基因組學與應用生物學. 2017(02)
[6]青藤堿抑制類風濕關節(jié)炎滑膜細胞增殖與誘導凋亡的研究[J]. 張群燕,趙智明,姚茹冰,郭郡浩,蔡輝.  中華中醫(yī)藥學刊. 2017(01)
[7]芐基異喹啉類生物堿生物合成與代謝工程研究進展[J]. 劉金鳳,黃鵬,卿志星,柳亦松,唐其,曾建國.  基因組學與應用生物學. 2016(08)
[8]青藤堿藥理作用研究進展[J]. 秦峰,蔡輝.  現(xiàn)代中藥研究與實踐. 2016(04)
[9]轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在生物測序中的應用研究進展[J]. 賈昌路,張瑤,朱玲,張銳.  分子植物育種. 2015(10)
[10]中藥青風藤種質(zhì)資源研究進展[J]. 楊華,熊興耀,仇萍.  生物技術(shù)世界. 2015(09)

博士論文
[1]基于同位素標記L-酪氨酸研究博落回中血根堿生源合成途徑[D]. 劉秀斌.湖南農(nóng)業(yè)大學 2017

碩士論文
[1]博落回屬植物中芐基異喹啉類生物堿代謝組學研究[D]. 陳應莊.湖南師范大學 2008
[2]風濕性關節(jié)炎藥物青藤堿的結(jié)構(gòu)修飾[D]. 王菲.天津大學 2007



本文編號：3440562