小麥粒重基因TaGW2-6A編碼區(qū)不同等位變異系灌漿特性、轉(zhuǎn)錄水平及蛋白組學(xué)分析
本文關(guān)鍵詞:小麥粒重基因TaGW2-6A編碼區(qū)不同等位變異系灌漿特性、轉(zhuǎn)錄水平及蛋白組學(xué)分析,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:近些年來,小麥粒重基因TaGW2-6A得到了廣泛的研究。實驗室前期在TaGW2-6A編碼區(qū)第八外顯子977bp處發(fā)現(xiàn)有一“T”堿基的插入,關(guān)聯(lián)分析表明,該插入能夠顯著增加小麥的粒寬和粒重。本研究利用中國春(野生型)及其近等基因系(near isogenic line,NIL)材料NIL-31(T堿基插入型,簡稱突變型)進一步分析了不同等位變異在花后3,6,9,12,15,20,25天的灌漿特性、轉(zhuǎn)錄模式及蛋白組學(xué)差異,得到以下主要結(jié)論:1.中國春與NIL-31籽粒發(fā)育過程中粒長、粒寬和粒重相關(guān)分析表明,NIL-31較中國春的粒長、粒寬(花后3天除外)和粒重在花后3,6,9,12,15,20,25天呈極顯著差異(P≤0.01)。同時,突變型在花后3-15天的鮮重積累速率高于野生型,尤其是在花后6-12天,而在花后15-25天的鮮重積累速率二者相當。這表明TaGW2-6A突變型增加小麥的粒寬、粒長和粒重,其發(fā)揮作用的時期主要在籽粒發(fā)育的前期。2.中國春及NIL-31粒重基因TaGW2-6A的qRT-PCR分析表明該基因與籽粒大小呈負相關(guān),并且二者在轉(zhuǎn)錄水平上呈數(shù)量級上的顯著差異。在籽粒發(fā)育的7個時期中,不同基因型的第一次轉(zhuǎn)錄高峰均出現(xiàn)在花后6天,這正好與胚乳細胞開始分化的時間一致。可見,TaGW2-6A可能參與調(diào)控胚乳細胞的分化。突變型在花后12天到達第二個轉(zhuǎn)錄高峰,這正好與籽粒開始灌漿的節(jié)點一致。而野生型在花后20天到達第二次轉(zhuǎn)錄高峰。推測TaGW2-6A可能協(xié)同調(diào)控胚乳細胞和籽粒灌漿這兩個過程來影響小麥粒重。3.雙向電泳結(jié)果表明,中國春與NIL-31在花后6,12,20天,共鑒定出228個差異蛋白。其中,NIL-31較中國春上調(diào)的蛋白點有48個,下調(diào)的蛋白有67個;NIL-31中的特異蛋白點有63個;中國春中的特異蛋白點有50個。質(zhì)譜鑒定及生物信息學(xué)分析表明這些蛋白涉及14個代謝過程,即碳代謝,氨基酸合成,細胞發(fā)育,能量的轉(zhuǎn)化,脂肪酸合成,泛素降解,激素調(diào)控,光合作用,蛋白合成/組成/降解,信號轉(zhuǎn)導(dǎo),儲藏蛋白合成,抗逆防衛(wèi),轉(zhuǎn)錄翻譯及其它功能未知蛋白。4.26S蛋白酶體能夠解除DELLA蛋白對赤霉素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的抑制,促進赤霉素在植物體內(nèi)的轉(zhuǎn)導(dǎo)。在本實驗中,我們發(fā)現(xiàn)4個α-蛋白酶體蛋白點,該酶體是20S和26S重要的識別元件。同時,我們發(fā)現(xiàn)一個在NIL-31高豐度表達的赤霉素受體蛋白GID1L2(蛋白點4211),這可能是由于26S蛋白酶體高效降解DELLA蛋白有關(guān)。因此,我們推測突變型TaGW2-6A能夠通過調(diào)控26S蛋白酶體正向調(diào)控赤霉素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。5.突變型TaGW2-6A誘導(dǎo)產(chǎn)生的一些蛋白酶體能夠增強植株的抗逆能力。功能分析表明這些蛋白酶體在細胞分化過程中起著重要作用,這表明在籽粒發(fā)育過程中TaGW2-6A突變蛋白能夠通過誘導(dǎo)細胞的分化來增強植物的抗逆能力。
【關(guān)鍵詞】:小麥 籽粒發(fā)育 蛋白組學(xué) TaGW2-6A 雙向電泳
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S512.1
【目錄】:
- 摘要6-8
- ABSTRACT8-13
- 第一章 文獻綜述13-24
- 1.1 粒重基因的研究進展13-17
- 1.1.1 擬南芥中粒重基因的研究進展13-14
- 1.1.2 水稻中粒重基因的研究進展14-15
- 1.1.3 小麥中粒重基因及相關(guān)QTL的研究進展15-16
- 1.1.4 TaGW2-6A的研究進展16-17
- 1.2 泛素/26S蛋白酶體途徑的研究進展17-19
- 1.2.1 泛素/26S蛋白酶體途徑的代謝模式17
- 1.2.2 泛素/26S蛋白酶體途徑在植物體中對環(huán)境脅迫的調(diào)控17-18
- 1.2.3 泛素/26S蛋白酶體途徑對植物激素的調(diào)控18
- 1.2.4 泛素/26S蛋白酶體途徑在植物體中對籽粒大小的調(diào)控18-19
- 1.3 Real-time PCR技術(shù)簡介19-21
- 1.3.1 Real-time PCR原理19
- 1.3.2 Real-time PCR技術(shù)的標記物19-20
- 1.3.3 Real-time PCR技術(shù)的特點20
- 1.3.4 Real-time PCR定量類型20-21
- 1.3.5 內(nèi)參基因的選擇21
- 1.4 蛋白組學(xué)研究技術(shù)簡介21-22
- 1.4.1 蛋白質(zhì)雙向電泳技術(shù)原理21
- 1.4.2 蛋白質(zhì)雙向電泳技術(shù)的優(yōu)點及局限性21
- 1.4.3 蛋白質(zhì)雙向電泳技術(shù)的應(yīng)用21-22
- 1.5 本研究的目的與意義22-23
- 1.6 本研究的技術(shù)路線圖23-24
- 第二章 TaGW2-6A編碼區(qū)不同等位變異灌漿特性分析24-29
- 2.1 實驗材料24-25
- 2.1.1 近等基因系的構(gòu)建24-25
- 2.1.2 材料種植與取材25
- 2.2 實驗方法25
- 2.2.1 小麥籽粒表型性狀的測定25
- 2.2.2 數(shù)據(jù)分析25
- 2.3 結(jié)果25-28
- 2.3.1 TaGW2-6A編碼區(qū)不同等位變異與粒寬、粒長、粒重的相關(guān)性分析25-27
- 2.3.2 TaGW2-6A編碼區(qū)不同等位變異灌漿特性分析27-28
- 2.4 討論28-29
- 第三章 TaGW2-6A編碼區(qū)不同等位變異轉(zhuǎn)錄水平的分析29-35
- 3.1 實驗材料29
- 3.2 實驗方法29-31
- 3.2.1 小麥總RNA的提取29-30
- 3.2.2 cDNA第一鏈的合成及熒光定量PCR30-31
- 3.2.3 TaGW2-6A編碼區(qū)不同等位變異轉(zhuǎn)錄水平的測定31
- 3.3 結(jié)果31-33
- 3.3.1 RNA質(zhì)量檢測31-32
- 3.3.2 目的基因與內(nèi)參基因擴增條件的優(yōu)化32
- 3.3.3 TaGW2-6A編碼區(qū)不同等位變異的轉(zhuǎn)錄水平的差異分析32-33
- 3.4 討論33-35
- 第四章 TaGW2-6A編碼區(qū)不同等位變異蛋白組學(xué)分析35-64
- 4.1 實驗材料35
- 4.2 實驗方法35-40
- 4.2.1 蛋白樣品的制備35-36
- 4.2.2 蛋白樣品的溶解及定量36
- 4.2.3 固相PH梯度雙向電泳及圖譜分析36-39
- 4.2.4 差異蛋白的質(zhì)譜鑒定39-40
- 4.3 結(jié)果40-47
- 4.3.1 蛋白標準曲線的制作40-41
- 4.3.2 TaGW2-6A編碼區(qū)不同等位變異間的蛋白質(zhì)組學(xué)差異41-43
- 4.3.3 差異蛋白的數(shù)據(jù)庫檢索及同源比對43
- 4.3.4 差異蛋白質(zhì)的功能分類43-44
- 4.3.5 差異蛋白的生物信息學(xué)分析44-47
- 4.4 討論47-64
- 4.4.1 與泛素代謝過程有關(guān)的蛋白47-48
- 4.4.2 與激素調(diào)控有關(guān)的蛋白48
- 4.4.3 與抗逆脅迫有關(guān)的蛋白48-50
- 4.4.4 與淀粉合成有關(guān)的蛋白50-51
- 4.4.5 與碳代謝有關(guān)的蛋白51-64
- 第五章 結(jié)論64-65
- 參考文獻65-72
- 附錄 1.TaGW2-6A編碼區(qū)不同等位變異材料基因序列的比對72-76
- 附錄 2.TaGW2-6A編碼區(qū)不同等位變異材料蛋白質(zhì)氨基酸序列的比對76-77
- 附錄 3. 差異蛋白GO及KEGG分類結(jié)果77-94
- 致謝94-95
- 作者簡介95
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