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基于環(huán)介導(dǎo)等溫擴增轉(zhuǎn)基因成分可視化檢測技術(shù)研究

發(fā)布時間:2017-03-23 21:00

  本文關(guān)鍵詞:基于環(huán)介導(dǎo)等溫擴增轉(zhuǎn)基因成分可視化檢測技術(shù)研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(Loop-mediated Isothermal Amplification,LAMP)是一種快速、靈敏度高、特異性強的等溫核酸擴增技術(shù),已被廣泛用于各領(lǐng)域。同時,LAMP的高靈敏度也使擴增產(chǎn)物開蓋檢測極易出現(xiàn)污染,而利用閉管檢測技術(shù)能有效降低污染機率。目前,LAMP結(jié)果檢測方法主要有電泳、濁度分析、熒光染料、LFD、微流控等,其中應(yīng)用較多的是電泳、濁度分析、HNB以及SYBR Green I指示劑,F(xiàn)有方法存在需開蓋、材料昂貴、顏色變化均屬同一色系等不足,為此本實驗進行了三項獨立的研究,主要研究成果如下:(1)LAMP-ACBK檢測系統(tǒng):本實驗引入一種新型的金屬指示劑-酸性絡(luò)藍K(Acid Chrome Blue K,ACBK)建立了閉管LAMP結(jié)果可視化檢測技術(shù)。首先,我們在LAMP擴增的起始體系中,分別測試了ACBK與緩沖液、dNTPs、引物、Mg2+等組分的反應(yīng),確定了含ACBK的LAMP體系其顏色變化由Mg2+決定,化學(xué)方法也進一步驗證了這一結(jié)論。隨后以花椰菜花葉病毒35S啟動子(CAMV35S,35S)為靶基因,建立了35S LAMP-ACBK檢測體系。該體系的檢測靈敏度針對轉(zhuǎn)基因水稻的檢測限為100拷貝,在分別含有50 ng的水稻、大豆、油菜和玉米基因組中能檢測出0.1%的轉(zhuǎn)基因含量。同時,利用不同轉(zhuǎn)化事件及不同轉(zhuǎn)基因作物為材料驗證了其檢測特異性,結(jié)果表明構(gòu)建的35S LAMP-ACBK檢測系統(tǒng)具有很強的檢測特異性。最終,將該檢測體系成功用于對實際玉米樣品轉(zhuǎn)基因成分的檢測,檢測結(jié)果既可以裸眼直接判斷也可以借助紫外可見光譜分析。(2)LAMP-G-四聯(lián)體過氧化物酶檢測系統(tǒng):以G-四聯(lián)體過氧化物酶實驗所產(chǎn)生的綠色為基礎(chǔ)建立了LAMP擴增和結(jié)果可視化檢測技術(shù)。首先,在LAMP擴增體系中分別加入(FIP/BIP,FLP/BLP),(FIP/BIP-G4,FLP/BLP),(FIP/BIP,FLP/BLP-G4),(FIP/BIP-G4,FLP/BLP-G4)四組引物組合,在63°C(12,24,36,48,60)min,85°C 2 min擴增條件下擴增,確定了(FIP/BIP,FLP/BLP-G4)為LAMP擴增引物。隨后以含35S的轉(zhuǎn)基因材料模板,建立了35S LAMP-G-四聯(lián)體過氧化物酶檢測系統(tǒng),且該系統(tǒng)針對轉(zhuǎn)基因水稻的檢測限為32 ng/μL。同時,利用不同轉(zhuǎn)化事件及不同作物的轉(zhuǎn)基因材料驗證了其檢測特異性,結(jié)果表明構(gòu)建的35S LAMP-G-四聯(lián)體過氧化物酶檢測系統(tǒng)具有很強的檢測特異性。(3)LAMP-試紙條檢測系統(tǒng):本研究旨在建立一種基于試紙條的35S或TNOS的LAMP擴增結(jié)果檢測方法,該方法在LAMP擴增結(jié)束后2-3 min內(nèi)即可用肉眼判讀結(jié)果。首先對修飾后的LAMP引物做了可用性檢測,隨后,對試紙條的特異性及靈敏度進行了評價。結(jié)果顯示,評價所用的5種陽性樣品均出現(xiàn)質(zhì)控線與檢測線,電泳呈特異的梯狀條帶,與普通PCR結(jié)果一致。表明該試紙條可用于35S及TNOS LAMP擴增結(jié)果的檢測,且有較高的特異性,兩種試紙條的靈敏度分別為5.4 ng/μL、27.2 ng/μL。
【關(guān)鍵詞】:環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(LAMP) 酸性絡(luò)藍K(ACBK) G-四聯(lián)體過氧化物酶 試紙條 可視化
【學(xué)位授予單位】:沈陽師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:Q78
【目錄】:
  • 摘要3-4
  • Abstract4-9
  • 第一章 引言9-18
  • 1.1 國內(nèi)外研究概況9-12
  • 1.1.1 電泳10
  • 1.1.2 熒光染料法10-11
  • 1.1.3 基于鎂離子、焦磷酸根的檢測技術(shù)11-12
  • 1.1.4 與其他技術(shù)結(jié)合的檢測技術(shù)12
  • 1.2 本論文研究目的、意義與主要研究內(nèi)容12-14
  • 1.2.1 研究目的和意義12-13
  • 1.2.2 主要研究內(nèi)容13-14
  • 1.3 實驗原理14-18
  • 1.3.1 LAMP-ACBK檢測系統(tǒng)14-16
  • 1.3.2 LAMP-G-四聯(lián)體過氧化物酶檢測系統(tǒng)16
  • 1.3.3 LAMP-試紙條檢測系統(tǒng)16-18
  • 第二章 ACBK可視化檢測LAMP擴增結(jié)果18-27
  • 2.1 材料和方法18-20
  • 2.1.1 材料18-19
  • 2.1.1.1 實驗材料18
  • 2.1.1.2 實驗試劑18
  • 2.1.1.3 主要儀器設(shè)備18
  • 2.1.1.4 引物18-19
  • 2.1.2 方法19-20
  • 2.1.2.1 DNA提取19
  • 2.1.2.2 DNA擴增19
  • 2.1.2.3 擴增結(jié)果分析19
  • 2.1.2.4 ACBK在LAMP體系中的可行性分析與濃度篩選19-20
  • 2.1.2.5 LAMP-ACBK體系優(yōu)化20
  • 2.1.2.6 LAMP-ACBK特異性與靈敏度實驗20
  • 2.1.2.7 LAMP-ACBK對實際樣品的檢測20
  • 2.2 結(jié)果與分析20-25
  • 2.2.1 ACBK指示劑在LAMP體系中的可行性分析20-21
  • 2.2.2 LAMP擴增體系確定21-22
  • 2.2.3 特異性22-23
  • 2.2.4 靈敏度23-24
  • 2.2.5 對實際樣品的檢測24-25
  • 2.3 討論25-27
  • 第三章 G四聯(lián)體可視化檢測LAMP擴增結(jié)果27-34
  • 3.1 材料27-28
  • 3.1.1 實驗材料27
  • 3.1.2 試劑27
  • 3.1.3 主要儀器設(shè)備27
  • 3.1.4 引物27-28
  • 3.2 方法28-29
  • 3.2.1 DNA提取28
  • 3.2.2 DNA擴增28
  • 3.2.3 G-四聯(lián)體過氧化物酶實驗28
  • 3.2.4 hemin指示濃度及檢測液加樣量篩選28-29
  • 3.2.5 特異性與靈敏度實驗29
  • 3.3 結(jié)果與分析29-32
  • 3.3.1 引物G4序列對LAMP擴增影響29-30
  • 3.3.2 hemin指示濃度及檢測液加樣量篩選30-31
  • 3.3.3 特異性31
  • 3.3.4 靈敏度31-32
  • 3.4 討論32-34
  • 第四章 試紙條可視化檢測LAMP擴增結(jié)果34-39
  • 4.1 材料和方法34-35
  • 4.1.1 材料34-35
  • 4.1.1.1 實驗材料34
  • 4.1.1.2 實驗試劑34
  • 4.1.1.3 主要儀器設(shè)備34
  • 4.1.1.4 引物34-35
  • 4.1.2 實驗方法35
  • 4.1.2.1 DNA提取35
  • 4.1.2.2 DNA擴增35
  • 4.1.2.3 試紙條檢測LAMP擴增結(jié)果35
  • 4.1.2.4 特異性與靈敏度實驗35
  • 4.2 結(jié)果與分析35-37
  • 4.2.1 特異性35-36
  • 4.2.2 靈敏度36-37
  • 4.3 討論37-39
  • 結(jié)論39-40
  • 參考文獻40-44
  • 個人簡歷44-45
  • 致謝45

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