【摘要】：利用隱馬可鏈夫模型(HMM)對(duì)芝麻全基因組Hsp70基因進(jìn)行了系統(tǒng)分析,共鑒定出21個(gè)Hsp70基因,其中17個(gè)屬于Dnak基因亞家族,4個(gè)屬于Hsp110/SSE基因亞家族。根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化樹分析和亞細(xì)胞定位結(jié)果,將芝麻21個(gè)Hsp70基因分為6個(gè)亞組,其中I亞組3個(gè),定位于葉綠體;II亞組2個(gè),定位于線粒體;III亞組5個(gè),定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng);IV亞組6個(gè),定位于細(xì)胞質(zhì)基質(zhì);V亞組4個(gè),屬于Hsp110/SSE基因家族;VI亞組1個(gè)。芝麻Hsp70基因啟動(dòng)子區(qū)域順式作用元件功能預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,Hsp70基因參與芝麻的生長(zhǎng)發(fā)育和逆境脅迫響應(yīng)等生理過程。
[Abstract]:The whole genome Hsp70 gene of sesame seeds was systematically analyzed by using the hidden Ma Ke chaff model (HMM). A total of 21 Hsp70 genes were identified, of which 17 belonged to the Dnak gene subfamily and 4 belonged to the Hsp110/SSE gene subfamily. According to phylogenetic tree analysis and subcellular localization, 21 Hsp70 genes of Sesame were divided into 6 subgroups, of which 3 were subgroups I, 2 were located in mitochondria, 2 were located in mitochondria, 5 were located in endoplasmic reticulum (ER), 2 in II subgroup and 5 in endoplasmic reticulum (ER). Six subgroups of IV were located in the cytoplasmic matrix, four in subgroup V, belonging to the Hsp110/SSE gene family, and one in the VI subgroup. The predicted function of cis-acting elements in the promoter region of sesame Hsp70 gene showed that Hsp70 gene was involved in the physiological processes such as growth and development of sesame seeds and stress response.
【作者單位】： 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所;
【基金】：江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新基金項(xiàng)目[CX(14)2038]
【分類號(hào)】：S565.3

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2301479