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基于GPU的光柵相襯成像的相位恢復(fù)和CT重建算法的研究

發(fā)布時間:2017-06-08 01:00

  本文關(guān)鍵詞:基于GPU的光柵相襯成像的相位恢復(fù)和CT重建算法的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:本論文的研究內(nèi)容是基于光柵相襯成像系統(tǒng)CT重建的并行加速計算。主要包括兩大方面內(nèi)容:一為整套光柵相襯成像系統(tǒng)的實現(xiàn)以及該系統(tǒng)相襯成像的優(yōu)勢;二為數(shù)據(jù)處理過程中使用在GPU上執(zhí)行的CUDA C編程模型來實現(xiàn)并行加速。 整套光柵相襯成像系統(tǒng)的搭建是在上海光源的X射線成像與生物醫(yī)學應(yīng)用線站即13W線站進行。該系統(tǒng)主要共包括三大部分:樣品臺及其控制、光柵干涉儀位移臺及其相關(guān)控制、數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)。其中第一部分中樣品臺的移動及旋轉(zhuǎn)主要通過Nport5610串口來與Kohzu電機連接來操作。在實驗開始之初,可以運用水平儀初步調(diào)整樣品放上去之后的高度,盡量保證待拍攝樣品部分的高度與X射線光源等高。光柵系統(tǒng)包括兩塊光柵:相位光柵G1和分析光柵G2。在光柵相襯實驗的過程中,兩塊光柵分別通過光柵位移臺能夠做橫向、縱向或旋轉(zhuǎn)移動以便調(diào)整光柵位置。數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)包括探測器以及與之連接的計算機外圍設(shè)備等,主要包括一個CCD探測器,一塊數(shù)據(jù)采集卡和一臺計算機機構(gòu)成。根據(jù)需要,有時候?qū)嶒炓彩褂肧CMOS相機進行拍攝。 跟傳統(tǒng)吸收成像方式相比,光柵相襯成像系統(tǒng)根據(jù)X射線波前的相位信息進行CT重建,對于弱吸收物質(zhì)如血管或軟組織來說,相位信息明顯比吸收信息明顯。因而對于弱吸收物質(zhì)而言,相襯成像的圖像空間分辨率和密度分辨率會優(yōu)于傳統(tǒng)吸收成像。相比于基于傳播距離的相襯成像更適用于比較薄的樣品,光柵相襯成像適用的樣品范圍會更廣。而衍射增強相襯成像和晶體干涉法對晶體要求特別高,因而光柵相襯成像系統(tǒng)的應(yīng)用開始越來越廣泛。 光柵相襯成像的實驗過程中,按照實驗原理,需要得到強度曲線。一般而言采用相位步進法來進行相位恢復(fù),在這個過程中會產(chǎn)生比較大的數(shù)據(jù)量。同時,CT重建的濾波反投影算法(Filtered Back Projection,FBP)需要完整角度的投影數(shù)據(jù)進行重建。因而,基于光柵相襯成像系統(tǒng)的CT重建的數(shù)據(jù)處理量是比較大的。GPU(GraphicProcessor Unit)作為一種多重流處理器多線程處理單元,能夠很好的進行并行運算。使用基于GPU的CUDA C程序來完成此CT重建,相比于基于CPU的標準C程序,將會得到比較好的加速比效果。 在重建過程中,本論文采用GPU并行加速的方法來進行相位恢復(fù)和FBP濾波反投影重建,,根據(jù)數(shù)據(jù)尺寸的不同,在保障圖像質(zhì)量的情況下,與同Visual Studio2010平臺下的標準C程序相比,實現(xiàn)了一定程度的加速比。并且,隨著圖像尺寸的增加即數(shù)據(jù)量的增加,加速比也呈現(xiàn)出上升的趨勢。這意味著,基于GPU的并行加速尤其適合于做大規(guī)模的數(shù)據(jù)處理,數(shù)據(jù)量越大,多線程處理的結(jié)構(gòu)能發(fā)揮出更大的優(yōu)勢。
【關(guān)鍵詞】:光柵相襯成像 GPU并行加速 CUDA C 濾波反投影
【學位授予單位】:上海交通大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:TP391.41;TP332
【目錄】:
  • 摘要6-8
  • ABSTRACT8-10
  • 縮略詞表10-13
  • 第一章 緒論13-22
  • 1.1 X 射線相襯成像的方法15-18
  • 1.1.1 干涉法15-16
  • 1.1.2 同軸相襯成像16-17
  • 1.1.3 衍射增強成像17
  • 1.1.4 光柵相襯成像17-18
  • 1.2 GPU 并行計算18-20
  • 1.3 上海光源20
  • 1.4 本文結(jié)構(gòu)20-22
  • 第二章 光柵相襯成像實驗原理和方法22-38
  • 2.1 基于塔爾博特(Talbot)效應(yīng)的光柵相襯成像22-24
  • 2.2 相位光柵和分析光柵24-27
  • 2.3 光柵相襯成像的相位恢復(fù)27-29
  • 2.4 光柵相襯成像的 CT 重建29-34
  • 2.5 GPU 加速的理論根據(jù)34-37
  • 2.6 本章小結(jié)37-38
  • 第三章 光柵相襯成像實驗過程和結(jié)果38-62
  • 3.1 光柵相襯成像系統(tǒng)38-40
  • 3.2 實驗樣品的準備和實驗過程40-41
  • 3.3 運用 CUDA C 編程模型的光柵相襯成像 CT 重建41-55
  • 3.4 實驗結(jié)果與分析55-61
  • 3.5 本章小結(jié)61-62
  • 第四章 總結(jié)與展望62-64
  • 第五章 參考文獻64-67
  • 攻讀碩士學位期間發(fā)表的論文67-68
  • 致謝68-69

【共引文獻】

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10 周e

本文編號:430814


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