范數(shù)描述符在定量構效關系中的研究
發(fā)布時間:2021-02-25 19:11
分子描述符的計算是定量構效關系(QSAR)研究的基礎,也是化學計量學研究的重要內容,在藥物化學、環(huán)境科學等領域應用廣泛。目前可計算的各種分子描述符已超過4000種,如何選擇合適的分子描述符成為QSAR研究中首先要做的事。范數(shù)指數(shù)描述符由本課題組提出,主要是從原子水平上找到描述分子結構的一種方法。為了探究和驗證范數(shù)描述符的廣義性和普適性,本工作主要進行以下五個方面的研究:1.將范數(shù)描述符應用于抗HIV整合酶抑制劑和逆轉錄酶抑制劑的構效關系研究。所涉及到的抑制劑包括抗HIV整合酶抑制劑、逆轉錄酶抑制劑、整合酶和逆轉錄酶抑制劑;所建立plC50和pCC50模型的統(tǒng)計參數(shù)為:整體回歸的相關系數(shù)平方值分別為0.8750和0.9109,留一法交叉驗證的相關系數(shù)平方值分別為0.8702和0.8914。驗證結果表明,所建立的模型在統(tǒng)計質量和預測能力上都是穩(wěn)定可靠的,并從所建立的模型中推導出具有高活性和低毒性的潛在雙靶標抑制劑;分子對接結果表明,這些抑制劑可以通過氫鍵與整合酶和逆轉錄酶中的一些重要殘基相互作用,因此,本課題組提出的范數(shù)描述符以及雙靶點模型在雙靶點抗HIV藥物的研究與開發(fā)具有一定的指導意義...
【文章來源】:天津科技大學天津市
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 分子描述符
1.2 定量構效關系
1.3 本課題研究內容
1.3.1 抗HIV抑制劑的構效關系研究
1.3.2 碳納米管的構效關系研究
1.3.3 糖基表面活性劑的構效關系研究
1.3.4 納米材料的構效關系研究
1.3.5 混合物閃點的構效關系研究
2 范數(shù)描述符在抗HIV抑制劑構效關系中的研究
2.1 研究進展
2.2 方法
2.2.1 數(shù)據(jù)集
2.2.2 范數(shù)描述符的提出
2.2.3 模型驗證
2.3 結果與討論
2.3.1 模型建立
2.3.2 驗證結果分析
2.3.3 與單靶點模型對比分析
2.3.4 文獻對比
2.4 分子對接
2.5 小結
3 范數(shù)描述符在碳納米管構效關系中的研究
3.1 研究進展
3.2 QNPR模型的建立
3.3 結果與討論
3.3.1 碳納米管終點值的預測結果
3.3.2 描述符有效性解釋
3.3.3 留一法交叉驗證
3.3.4 Y隨機驗證
3.3.5 應用域分析
3.4 小結
4 范數(shù)描述符在糖基表面活性劑構效關系中的研究
4.1 研究進展
4.2 方法
4.2.1 數(shù)據(jù)集
4.2.2 模型建立
4.3 結果與討論
4.3.1 logCMC的預測結果
4.3.2 交叉驗證
4.3.3 應用域
4.3.4 MAE檢驗
4.4 小結
5 范數(shù)描述符在納米材料構效關系中的研究
5.1 研究進展
5.2 研究方法
5.2.1 數(shù)據(jù)集的選擇以及描述符的產生
5.2.2 模型的統(tǒng)計結果
5.3 模型的驗證結果
5.4 小結
6 范數(shù)描述符在混合物閃點構效關系中的研究
6.1 研究背景及意義
6.2 方法
6.2.1 數(shù)據(jù)集的選擇
6.2.2 描述符和模型的提出
6.2.3 模型的統(tǒng)計結果
6.3 模型驗證
6.4 小結
7 結論
8 展望
9 參考文獻
10 攻讀碩士學位期間發(fā)表論文情況
11 致謝
本文編號:3051445
【文章來源】:天津科技大學天津市
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 分子描述符
1.2 定量構效關系
1.3 本課題研究內容
1.3.1 抗HIV抑制劑的構效關系研究
1.3.2 碳納米管的構效關系研究
1.3.3 糖基表面活性劑的構效關系研究
1.3.4 納米材料的構效關系研究
1.3.5 混合物閃點的構效關系研究
2 范數(shù)描述符在抗HIV抑制劑構效關系中的研究
2.1 研究進展
2.2 方法
2.2.1 數(shù)據(jù)集
2.2.2 范數(shù)描述符的提出
2.2.3 模型驗證
2.3 結果與討論
2.3.1 模型建立
2.3.2 驗證結果分析
2.3.3 與單靶點模型對比分析
2.3.4 文獻對比
2.4 分子對接
2.5 小結
3 范數(shù)描述符在碳納米管構效關系中的研究
3.1 研究進展
3.2 QNPR模型的建立
3.3 結果與討論
3.3.1 碳納米管終點值的預測結果
3.3.2 描述符有效性解釋
3.3.3 留一法交叉驗證
3.3.4 Y隨機驗證
3.3.5 應用域分析
3.4 小結
4 范數(shù)描述符在糖基表面活性劑構效關系中的研究
4.1 研究進展
4.2 方法
4.2.1 數(shù)據(jù)集
4.2.2 模型建立
4.3 結果與討論
4.3.1 logCMC的預測結果
4.3.2 交叉驗證
4.3.3 應用域
4.3.4 MAE檢驗
4.4 小結
5 范數(shù)描述符在納米材料構效關系中的研究
5.1 研究進展
5.2 研究方法
5.2.1 數(shù)據(jù)集的選擇以及描述符的產生
5.2.2 模型的統(tǒng)計結果
5.3 模型的驗證結果
5.4 小結
6 范數(shù)描述符在混合物閃點構效關系中的研究
6.1 研究背景及意義
6.2 方法
6.2.1 數(shù)據(jù)集的選擇
6.2.2 描述符和模型的提出
6.2.3 模型的統(tǒng)計結果
6.3 模型驗證
6.4 小結
7 結論
8 展望
9 參考文獻
10 攻讀碩士學位期間發(fā)表論文情況
11 致謝
本文編號:3051445
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