表面增強(qiáng)拉曼信號放大生物傳感方法在生物活性分子檢測中的應(yīng)用
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更多相關(guān)文章: 信號放大 DNA適體 表面增強(qiáng)拉曼散射 納米金生物條碼
【摘要】:在腫瘤等重大疾病生物檢測方面,蛋白質(zhì)以及核酸都是非常重要的生物分子標(biāo)記物,而在疾病早期這些生物分子的含量很低,難以檢測。建立高靈敏高選擇性的生物分子標(biāo)記物的檢測手段,對于疾病的早期診斷和治療方面將有很大的幫助。本文結(jié)合納米金生物條碼放大技術(shù),采用表面增強(qiáng)拉曼技術(shù),構(gòu)建了雙前體自產(chǎn)生聚合酶剪切循環(huán)、對稱信號放大同時檢測以及不對稱信號放大同時檢測方法,實(shí)現(xiàn)了對血小板衍生因子PDGF-BB、癌癥標(biāo)記物miRNA-203和ATP生物活性分子的高靈敏高選擇性檢測。本工作主要包括以下三個方面:1、根據(jù)適體與靶分子特異性識別的特點(diǎn),本實(shí)驗(yàn)構(gòu)建了一種基于前體自產(chǎn)生的聚合酶鏈取代放大拉曼信號檢測PDGF-BB的方法,該方法根據(jù)PDGF-BB適體的特殊結(jié)構(gòu),當(dāng)適體與靶分子結(jié)合后,可形成發(fā)夾DNA結(jié)構(gòu),同時與適體互補(bǔ)的DNA鏈解旋后自動形成另一條發(fā)卡DNA鏈,兩條發(fā)夾DNA的一端以自身為模板,進(jìn)行聚合酶鏈取代循環(huán)放大反應(yīng),釋放大量的單鏈DNA,進(jìn)而引發(fā)下一步的聚合酶鏈取代循環(huán)放大反應(yīng),最后在作為基底的金片上固定了大量的納米金生物條碼,以達(dá)到再次放大信號的作用,從而提高檢測的靈敏度,其檢測限為0.42 pM。該方法易于操作,具有良好的選擇性和靈敏性,為蛋白質(zhì)等生物活性小分子的檢測提供了新的思路。2、miRNA-203和ATP是癌癥診斷的重要生物分子,我們設(shè)計(jì)了一種對稱信號放大同時檢測的方案,通過雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)以及生物條碼技術(shù)二次放大檢測信號,制備了一種雙功能生物分子拉曼探針同時檢測miR-203和ATP分子,該方法利用磁珠作為載體,將含有兩種分子識別鏈的DNA鏈及其互補(bǔ)鏈固定在磁珠上,當(dāng)兩種分子存在時,分別與識別鏈發(fā)生特異性綁定,同時將兩種引發(fā)鏈釋放到體系中,進(jìn)而引發(fā)下一步的雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng),同時通過堿基互補(bǔ)配對原則將兩種生物條碼大量固定到磁珠上,以金片作為基底檢測拉曼信號,ATP的檢測限為5.6×10-9 M,miRNA-203的檢測限為1.2×10-14 M。本方案對于兩種分子具有較好的選擇性和靈敏度,為同時檢測多組份提供了可行的檢測方法。3、同時檢測多種重大疾病相關(guān)的生物活性分子,可提高疾病早期的檢出率。對于體內(nèi)濃度差異較大的多組分活性分子,高濃度的分子響應(yīng)信號易于掩蓋低濃度的分子響應(yīng)信號,影響低濃度分子檢測的準(zhǔn)確性。為進(jìn)一步提高體內(nèi)濃度水平差異較大的雙組份檢測的穩(wěn)定性和靈敏度,我們在上一部分的基礎(chǔ)上進(jìn)行了不對稱同時放大檢測,對于濃度較高的ATP使用生物條碼技術(shù)進(jìn)行一次信號放大,對于濃度較低的miR-203利用雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)反應(yīng)和生物條碼技術(shù)進(jìn)行二次信號放大。通過對實(shí)際樣品癌癥細(xì)胞和正常細(xì)胞中兩種組份的靈敏檢測,充分說明了該方案具有較好的實(shí)用性。本方法提高了濃度水平差異較大的雙組分檢測的準(zhǔn)確性。ATP的檢測限20 nM,miRNA-203的檢測限為1.5 fM。該方案無需使用工具酶,因此反應(yīng)簡單,易于操作,多組份的同時檢測為癌癥診斷提供了更精確的分析,在腫瘤分析方面具有更廣闊的應(yīng)用前景。
【關(guān)鍵詞】:信號放大 DNA適體 表面增強(qiáng)拉曼散射 納米金生物條碼
【學(xué)位授予單位】:青島科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:TP212.3;O657.37
【目錄】:
- 摘要3-5
- ABSTRACT5-10
- 第一章 前言10-28
- 1.1 DNA生物傳感方法10-16
- 1.1.1 核酸適體10-11
- 1.1.2 生物傳感方法11-12
- 1.1.3 DNA生物傳感方法的分類12-16
- 1.2 DNA循環(huán)放大技術(shù)16-22
- 1.2.1 雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)16-17
- 1.2.2 鏈取代放大反應(yīng)17-18
- 1.2.3 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)18-19
- 1.2.4 聚合酶鏈置換反應(yīng)19-20
- 1.2.5 滾換復(fù)制放大反應(yīng)20-22
- 1.3 表面增強(qiáng)拉曼散射22-26
- 1.3.1 拉曼散射簡介22-23
- 1.3.2 拉曼散射光譜的特點(diǎn)23
- 1.3.3 拉曼散射光譜的應(yīng)用23-24
- 1.3.4 表面增強(qiáng)拉曼散射簡介24-25
- 1.3.5 表面增強(qiáng)拉曼散射的應(yīng)用25-26
- 1.4 本工作的研究內(nèi)容以及研究意義26-28
- 第二章 雙前體自產(chǎn)生表面增強(qiáng)拉曼信號放大分析檢測PDGF-BB28-44
- 2.1 引言28-29
- 2.2 實(shí)驗(yàn)部分29-32
- 2.2.1 試劑29-30
- 2.2.2 儀器30
- 2.2.3 納米金顆粒的制備30-31
- 2.2.4 生物條碼的制備31
- 2.2.5 發(fā)卡DNA鏈在金片上的固定31
- 2.2.6 適體互補(bǔ)DNA在磁性微球上的固定31-32
- 2.2.7 前體自產(chǎn)生表面增強(qiáng)拉曼信號放大反應(yīng)32
- 2.2.8 SERS檢測32
- 2.3 結(jié)果與討論32-42
- 2.3.1 實(shí)驗(yàn)方案原理32-34
- 2.3.2 生物條碼的紫外-可見光表征34-35
- 2.3.3 納米金顆粒的電子透射顯微鏡表征35
- 2.3.4 可行性實(shí)驗(yàn)35-36
- 2.3.5 實(shí)驗(yàn)條件優(yōu)化36-39
- 2.3.5.1 反應(yīng)體系溫度的優(yōu)化37
- 2.3.5.2 緩沖溶液pH的優(yōu)化37-38
- 2.3.5.3 聚合酶和內(nèi)切酶用量的優(yōu)化38
- 2.3.5.4 反應(yīng)時間的優(yōu)化38-39
- 2.3.6 PDGF-BB的靈敏度檢測39-40
- 2.3.7 選擇性實(shí)驗(yàn)40-41
- 2.3.8 檢測PDGF-BB的實(shí)際應(yīng)用41-42
- 2.4 小結(jié)42-44
- 第三章 對稱信號放大同時檢測雙組分癌癥標(biāo)記物44-55
- 3.1 引言44
- 3.2 實(shí)驗(yàn)部分44-47
- 3.2.1 試劑44-45
- 3.2.2 儀器45-46
- 3.2.3 納米金顆粒的制備46
- 3.2.4 生物條碼的制備46
- 3.2.5 發(fā)卡DNA(H1、H7)和適體DNA1在磁珠上的固定46
- 3.2.6 miRNA和ATP的對稱信號放大同時分析46-47
- 3.2.7 SERS檢測47
- 3.3 結(jié)果與討論47-54
- 3.3.1 實(shí)驗(yàn)原理47-48
- 3.3.2 納米金顆粒的TEM表征48
- 3.3.3 生物條碼的紫外-可見光譜表征48-49
- 3.3.4 實(shí)驗(yàn)條件優(yōu)化49-51
- 3.3.4.1 HCR反應(yīng)時間的優(yōu)化49-50
- 3.3.4.2 HCR反應(yīng)溫度的優(yōu)化50
- 3.3.4.3 緩沖溶液pH值的優(yōu)化50-51
- 3.3.5 miRNA和ATP的單獨(dú)SERS檢測51-52
- 3.3.6 miR-203和ATP的同時對稱SERS檢測52-53
- 3.3.7 選擇性實(shí)驗(yàn)53-54
- 3.4 小結(jié)54-55
- 第四章 不對稱信號放大同時檢測雙組份高濃度差異癌癥標(biāo)記物55-65
- 4.1 引言55
- 4.2 實(shí)驗(yàn)部分55-58
- 4.2.1 試劑55-57
- 4.2.2 儀器57
- 4.2.3 納米金顆粒的制備57
- 4.2.4 生物條碼的制備57
- 4.2.5 發(fā)卡DNA(H1、H2)和適體DNA1在磁珠上的固定57
- 4.2.6 miR-203和ATP的同時不對稱檢測57-58
- 4.2.7 SERS檢測58
- 4.3 結(jié)果與討論58-64
- 4.3.1 設(shè)計(jì)方案及工作原理58-60
- 4.3.2 納米金顆粒的TEM表征60
- 4.3.3 生物條碼的紫外-可見光譜表征60
- 4.3.4 實(shí)驗(yàn)條件的優(yōu)化60-62
- 4.3.4.1 雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)時間的優(yōu)化60-61
- 4.3.4.2 雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)比例的優(yōu)化61-62
- 4.3.4.3 HCR反應(yīng)溫度的優(yōu)化62
- 4.3.4.4 緩沖溶液pH值的優(yōu)化62
- 4.3.5 miRNA-203和ATP不對稱同時檢測62-63
- 4.3.6 不對稱同時檢測ATP和miR-203的實(shí)際應(yīng)用63-64
- 4.4 小結(jié)64-65
- 結(jié)論65-66
- 參考文獻(xiàn)66-74
- 致謝74-75
- 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄75-76
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本文編號:991852
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