本文關(guān)鍵詞：甘氨酸二肽分子酰胺-Ⅰ帶光譜與結(jié)構(gòu)相關(guān)性

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【摘要】：系統(tǒng)探索了蛋白質(zhì)二肽模型分子——甘氨酸二肽(GLYD)在氣相與水溶液中的結(jié)構(gòu)與光譜特性。從分子動力學(xué)軌跡中提取具有代表性結(jié)構(gòu)的GLYD-D_2O聚集體的瞬態(tài)結(jié)構(gòu)開展簡正模式分析,獲取了對蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)敏感的酰胺-Ⅰ帶的振動光譜參數(shù),建立起振動光譜與特征基團(tuán)結(jié)構(gòu)間的相關(guān)性。將溶劑作用以靜電勢場的形式投影至二肽分子骨架中,與酰胺-Ⅰ帶在氣/液相中的頻率差相關(guān)聯(lián),并引入酰胺-Ⅰ帶簡正模式隨二級結(jié)構(gòu)變化的規(guī)律,將各個構(gòu)象態(tài)可能存在的振動耦合包含在內(nèi),構(gòu)建具有二級結(jié)構(gòu)敏感性的靜電頻率轉(zhuǎn)換圖,實(shí)現(xiàn)溶液相中多肽骨架酰胺-Ⅰ帶的快速準(zhǔn)確預(yù)測。
【作者單位】： 福建師范大學(xué)化學(xué)與化工學(xué)院;福建省理論與計(jì)算化學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 甘氨酸二肽 酰胺-Ⅰ帶 振動光譜 靜電頻率圖
【基金】：國家自然科學(xué)基金(21103021) 福建省高校杰出青年科學(xué)人才培育計(jì)劃(JA13063)資助項(xiàng)目~~
【分類號】：O621.13
【正文快照】： 1引言要發(fā)揮正常的物理、化學(xué)以及生物學(xué)功能,蛋白質(zhì)需要通過大量氫鍵、范德華力和疏水作用等非共價(jià)相互作用來正確折疊形成一個特定構(gòu)型。組織中特定蛋白質(zhì)如果發(fā)生錯誤折疊,將會引起空間構(gòu)象變化,進(jìn)而發(fā)生自組裝形成難溶的 纖維聚集體,引發(fā)如阿爾茨海默病、II型糖尿病、漢，

本文編號：812846