發(fā)布時(shí)間：2017-08-14 03:28

  本文關(guān)鍵詞：精氨酸側(cè)鏈和核酸堿基間離子氫鍵作用強(qiáng)度分析

  更多相關(guān)文章： 精氨酸側(cè)鏈 核酸堿基 離子氫鍵 結(jié)合能 質(zhì)子化反應(yīng)焓變

【摘要】：采用MP2/6-31+G(d,p)方法優(yōu)化得到了22個(gè)由精氨酸側(cè)鏈與堿基尿嘧啶、胸腺嘧啶、胞嘧啶、鳥嘌呤及腺嘌呤形成的氫鍵復(fù)合物的氣相穩(wěn)定結(jié)構(gòu),使用包含BSSE校正的MP2/aug-cc-p VTZ方法計(jì)算得到了復(fù)合物的氣相結(jié)合能,通過(guò)MP2/6-31+G(d,p)方法和PCM模型優(yōu)化得到了復(fù)合物的水相穩(wěn)定結(jié)構(gòu),采用MP2/aug-cc-p VTZ方法和PCM模型計(jì)算得到了復(fù)合物的水相結(jié)合能.研究發(fā)現(xiàn),精氨酸側(cè)鏈與堿基間的離子氫鍵作用強(qiáng)度與單體間電荷轉(zhuǎn)移量、氫鍵臨界點(diǎn)電子密度及二階作用穩(wěn)定化能密切相關(guān).與中性氫鍵相比,離子氫鍵作用具有更顯著的共價(jià)作用成分.研究還發(fā)現(xiàn),精氨酸側(cè)鏈和堿基間形成的氫鍵復(fù)合物的穩(wěn)定性次序可以通過(guò)氫鍵受體堿基分子上氧原子和氮原子的質(zhì)子化反應(yīng)焓變進(jìn)行預(yù)測(cè),質(zhì)子化反應(yīng)焓變?cè)截?fù),形成的氫鍵復(fù)合物越穩(wěn)定.
【作者單位】： 遼寧師范大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 精氨酸側(cè)鏈 核酸堿基 離子氫鍵 結(jié)合能 質(zhì)子化反應(yīng)焓變
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(批準(zhǔn)號(hào):21173109;21573098) 大連市領(lǐng)軍人才項(xiàng)目資助~~
【分類號(hào)】：O641.1
【正文快照】： 離子氫鍵是蛋白質(zhì)-核酸間的一種重要?dú)滏I作用[1,2],在基因表達(dá)和調(diào)控[3,4]、蛋白質(zhì)-核酸分子識(shí)別[5~11]等過(guò)程中具有重要作用.Seeman等[12]和Lehmann等[13]通過(guò)X射線衍射和中子衍射實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)精氨酸側(cè)鏈可與鳥嘌呤形成氫鍵復(fù)合物.Luscombe等[14]對(duì)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中129個(gè)蛋白-DNA復(fù)

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本文編號(hào)：670552