采用DFT方法研究了烯�；�-輔酶A(ECH)催化的4-(N,N-二甲氨基)-肉桂酰-輔酶A(DAC-CoA)和巴豆�；�-輔酶A(Crotonyl-CoA)水合反應.計算表明:水合反應以分步機理進行,經(jīng)歷一個烯醇負離子中間體.Glu164殘基作為唯一的催化堿/酸參與水合反應,而Glu144雖然沒有直接參與反應,但是它能通過氫鍵作用誘使水分子以合適的朝向活化底物.Crotonyl-CoA底物的水加成活性高于DAC-CoA.Ala98和Gly141與底物羰基之間的氫鍵作用既有利于底物的準確結合,也能有效穩(wěn)定反應中形成的過渡態(tài)和中間體.另外,Glu144和Glu164周圍的氫鍵網(wǎng)絡對于合理維持活性位點排布進而有效促進底物活化也很重要.

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【文章目錄】：
1 引言
2 計算方法與模型
    2.1 計算方法
    2.2 活性位點模型
3 結果與討論
    3.1 DAC-Co A水合反應
    3.2 Crotonyl-Co A水合反應
    3.3 活性位點氨基酸作用
4 結論



本文編號：3959982