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若干小分子對大分子構(gòu)象影響的研究

發(fā)布時間:2023-11-12 15:17
  溶液中的一些小分子例如尿素、鹽離子和配體分子等對大分子特別是生物大分子的行為有著重要影響。富含鳥嘌呤堿基的DNA、RNA在鹽離子或者小分子配體的作用下,可以折疊成為一種特殊的二級結(jié)構(gòu),稱為G-四鏈體。這種結(jié)構(gòu)在細(xì)胞復(fù)制過程中起到調(diào)節(jié)作用。另外,在添加劑(例如,尿素或者醇)的作用下,蛋白質(zhì)變性并喪失其功能。在本論文中,我們主要使用分析型超速離心(AUC)中的沉降速率法(AUC-SV)和差示掃描量熱法(DSC)研究了若干小分子對溶液中生物大分子構(gòu)象的影響。本論文主要結(jié)果如下:1.人類端粒DNA片段(AGGG(TTAGGG)3,Tel22)可以在一些單價陽離子存在的情況下折疊成為G-四鏈體。這些陽離子可以通過非特異性和特異性相互作用分別與DNA的磷酸基團(tuán)和鳥嘌呤的06結(jié)合。實(shí)驗表明,當(dāng)鉀離子濃度高于10.0 μM時,Tel22在特異性相互作用的影響下開始逐漸折疊成為G-四鏈體,表現(xiàn)為標(biāo)準(zhǔn)沉降系數(shù)(s20.w)隨鉀離子濃度的增加而增大。然而,只有當(dāng)體系中陽離子濃度大于1.0 mM時,非特異性相互作用才起作用。另外,鉀離子合適的大小以及其較易脫水化的性質(zhì)使得其比其它離子如鋰離子、鈉離子和銫離子更...

【文章頁數(shù)】:127 頁

【學(xué)位級別】:博士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
符號說明
第1章 緒論
    1.1 前言
    1.2 G-四鏈體
        1.2.1 DNA的特殊結(jié)構(gòu)
        1.2.2 G-四鏈體的形成與結(jié)構(gòu)
        1.2.3 G-四鏈體的功能
        1.2.4 人類端粒與端粒G-四鏈體
    1.3 蛋白質(zhì)
        1.3.1 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能
        1.3.2 聚(N-異丙基丙烯酰胺)的相變研究
        1.3.3 大豆蛋白
    1.4 我們要解決的問題
    參考文獻(xiàn)
第2章 分析型超速離心
    2.1 分析型超速離心機(jī)組成
        2.1.1 離心機(jī)組件
        2.1.2 檢測系統(tǒng)
    2.2 分析型超速離心原理
        2.2.1 Svedberg方程
        2.2.2 Lamm方程
    2.3 沉降速度實(shí)驗
        2.3.1 數(shù)據(jù)獲得
        2.3.2 沉降系數(shù)(s)的確定
        2.3.3 標(biāo)準(zhǔn)條件下的s
        2.3.4 徑向稀釋效應(yīng)
        2.3.5 偏比容
    參考文獻(xiàn)
第3章 分析型超速離心研究堿金屬離子對人類端粒DNA構(gòu)象的影響
    3.1 前言
    3.2 實(shí)驗部分
        3.2.1 實(shí)驗原料
        3.2.2 實(shí)驗儀器
    3.3 結(jié)果與討論
        3.3.1 鉀離子對Tel22構(gòu)象的影響
        3.3.2 不同堿金屬離子對Tel22構(gòu)象的影響
        3.3.3 不同堿金屬離子對Tel22分子量的影響
    3.4 本章小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
第4章 沉降速度法對TMPyP4和人類端粒G-四鏈體相互作用的研究
    4.1 前言
    4.2 實(shí)驗部分
        4.2.1 DNA溶液的制備
        4.2.2 實(shí)驗儀器
    4.3 結(jié)果和討論
        4.3.1 TMPyP4與Tel22的結(jié)合
        4.3.2 TMPyP4可以促進(jìn)二聚體復(fù)合物的形成
        4.3.3 TMPyP4/Tel22的結(jié)合形式對二聚體復(fù)合物形成的影響
    4.4 本章小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
第5章 尿素及其衍生物對聚(N-異丙基丙烯酰胺)相轉(zhuǎn)變的影響
    5.1 前言
    5.2 差示掃描量熱法
    5.3 尿素對聚(N-異丙基丙烯酰胺)相轉(zhuǎn)變的影響
        5.3.1 實(shí)驗原料
        5.3.2 實(shí)驗步驟
        5.3.3 結(jié)果與討論
    5.4 甲基化尿素對聚(N-異丙基丙烯酰胺)相轉(zhuǎn)變的影響
        5.4.1 實(shí)驗原料
        5.4.2 實(shí)驗步驟
        5.4.3 結(jié)果與討論
    5.5 本章小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
第6章 分析型超速離心對11S球蛋白的研究
    6.1 前言
    6.2 實(shí)驗部分
        6.2.1 實(shí)驗試劑
        6.2.2 大豆蛋白11S的提取
        6.2.3 ConA-瓊脂糖4B的裝柱
        6.2.4 11S蛋白的提純
        6.2.5 電泳實(shí)驗
        6.2.6 分析型超速離心法
    6.3 結(jié)果與討論
        6.3.1 溶解條件對大豆蛋白提取的影響
        6.3.2 還原劑2-ME對11S蛋白的影響
        6.3.3 ConA-瓊脂糖4B對11S粗產(chǎn)物的純化
        6.3.4 離子強(qiáng)度和pH對溶液中11S蛋白的影響
    6.4 本章小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
結(jié)論
致謝
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本文編號:3863414

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