酶及小分子誘導(dǎo)的短肽自組裝行為在限域空間的研究和應(yīng)用
發(fā)布時間:2021-09-30 04:17
分子自組裝是自然界進化過程中普遍存在的現(xiàn)象,核酸、蛋白質(zhì)、細胞甚至生命的形成都是通過自組裝實現(xiàn)的,而生物體內(nèi)的大多數(shù)自組裝活動均是在各種各樣的限域環(huán)境中進行的,如細胞、脂質(zhì)膜、酶囊、囊泡、膠束生物有機骨架等。短肽分子本質(zhì)上是一種低分子量的生物活性蛋白,因其內(nèi)在的生物相容性、生物降解性以及低免疫原等特點成為當(dāng)下的研究熱點。作為一種自下而上構(gòu)建超分子納米材料的結(jié)構(gòu)基元,短肽分子的組裝基礎(chǔ)是各種分子間協(xié)同的相互作用力,這些作用力可通過一些常用的動力學(xué)參數(shù)進行調(diào)制,包括pH、溫度、金屬離子、酶以及小分子等;诖,我們從仿生學(xué)的角度出發(fā),通過改變共價鍵、非共價鍵以及組裝環(huán)境,以溫和的生物刺激來觸發(fā)分子的自組裝活動,并通過模擬生物體內(nèi)的受限環(huán)境來探究限域空間對短肽自組裝的影響。首先,設(shè)計了一系列N-芴基-9-甲氧羰基(Fmoc)修飾的二肽及氨基酸來探索嗜熱菌蛋白酶的催化作用。實驗和計算模擬結(jié)果表明,氨基酸的疏水性和序列與嗜熱菌蛋白酶催化反應(yīng)的結(jié)合能力和催化效率有顯著的相關(guān)性。根據(jù)不同的底物設(shè)計,嗜熱菌蛋白酶可以催化反應(yīng)向水解或縮合方向發(fā)展。利用嗜熱菌蛋白酶的雙向催化作用設(shè)計了一個兩步反應(yīng),完成了...
【文章來源】:中國科學(xué)院大學(xué)(中國科學(xué)院過程工程研究所)北京市
【文章頁數(shù)】:135 頁
【學(xué)位級別】:博士
【圖文】:
圖1.1?(a)芳香環(huán)的分子結(jié)構(gòu);(b)兩親性肽的典型分子結(jié)構(gòu)示意圖及相應(yīng)的??
?第1章引言???和天冬氨酸)以及堿性氨基酸(組氨酸、精氨酸和賴氨酸)在生理pH值下分別??帶正電和負電。此外,還有三種特殊的氨基酸:甘氨酸是最具柔韌性的氨基酸,??它是唯一的非手性氨基酸;脯氨酸的剛性與甘氨酸柔韌性的協(xié)同結(jié)合在形成P轉(zhuǎn)??角時起重要作用;半胱氨酸易被氧化形成二硫鍵(圖1.2)?這些具有不同??結(jié)構(gòu)和功能的氨基酸通過排列組合的方式形成具有不同序列的肽,這為基于肽組??裝的超分子納米材料提供了充足且多樣的結(jié)構(gòu)基元=??Hydrophobic?“剛??(A)?alarlne?(V)?valine?(l)?feucine?(I)?iso。澹酰悖椋颍椋?(M)?methionine?;?、!,-)?v?x,c-?i、:?Y?'、■':心崎^?w?.??^?\?|?So??Charged?.丄??碩iw——?j?—ms??T??口““d??(D)?aspsrtx:?acid?(£}?glutamic?acid?|?|?(K)?{?)?argin?r???|?…!??h7vIoh?¥1oh?|?hvlOHH,%l0M?卜、義_?|?%????VH?1?II?\?\?I?V)H???i?j?,,痛人?_,?|???Hydrophilic?Other??<S)貨ri■液?(T)熱refine?(N)?aspsm§i?ve?(Q)?giufef^ne?(P)?fxo^ne?(Q)?^ycim?(C)?ty&l&s??H>Ny^〇H?^-^oh?^y^oH^y^oH?(^〇??H>N^oh^Y^oh??^?OH?^-OH?L??Vsh???°?O^NH,??
?第1章引言???氧基酸;負電荷)的合理設(shè)計,另一種四肽,即Fmoc-Phe-Arg-Gly-Asp?(Fmoc-??FRGD),也被篩選到具有相同的穩(wěn)定Fmoc-TAEA納米球的能力。此外,穩(wěn)定的??納米粒子能夠封裝疏水性染料(尼羅紅)和靶向乳腺癌細胞。這種通過逐步的芳??香環(huán)驅(qū)動的自組裝策略可以提供一個簡潔的方法來構(gòu)建具有不同的潛在應(yīng)用(如??靶向藥物輸送和定向診斷)的具有生物活性納米結(jié)構(gòu)(圖1.4)?f3化??A??)I??Fmoc-TAEA?^??##?//??Fmoc-TAEA?nanospheres??hydrophobic?drug?*?mm??fFmoc-F?紙5??RGD??Functionalized?drug??deliver}r?nanocarricrs??圖1.4?Fmoc-FRGD穩(wěn)定及功能化的Fmoc-TAEA自組裝納米微球的結(jié)構(gòu)示意圖,以及用于藥??物傳遞的疏水分子的包封??Figure?1.4?Schematic?diagram?of?the?construction?of?Fmoc-FRGD?stabilized?and?functionalized??Fmoc-TAEA?self-assembling?nanospheres,?and?the?entrapment?of??hydrophobic?molecules?for?drug?delivery??1.3酶觸發(fā)的肽自組裝??自組裝是構(gòu)建超分子材料的有效方法,超分子材料主要是通過實驗室的物理??或化學(xué)刺激產(chǎn)生的,這些方法大多只能在體外緩沖溶液中使用,與生物體內(nèi)環(huán)境??7??
本文編號:3415108
【文章來源】:中國科學(xué)院大學(xué)(中國科學(xué)院過程工程研究所)北京市
【文章頁數(shù)】:135 頁
【學(xué)位級別】:博士
【圖文】:
圖1.1?(a)芳香環(huán)的分子結(jié)構(gòu);(b)兩親性肽的典型分子結(jié)構(gòu)示意圖及相應(yīng)的??
?第1章引言???和天冬氨酸)以及堿性氨基酸(組氨酸、精氨酸和賴氨酸)在生理pH值下分別??帶正電和負電。此外,還有三種特殊的氨基酸:甘氨酸是最具柔韌性的氨基酸,??它是唯一的非手性氨基酸;脯氨酸的剛性與甘氨酸柔韌性的協(xié)同結(jié)合在形成P轉(zhuǎn)??角時起重要作用;半胱氨酸易被氧化形成二硫鍵(圖1.2)?這些具有不同??結(jié)構(gòu)和功能的氨基酸通過排列組合的方式形成具有不同序列的肽,這為基于肽組??裝的超分子納米材料提供了充足且多樣的結(jié)構(gòu)基元=??Hydrophobic?“剛??(A)?alarlne?(V)?valine?(l)?feucine?(I)?iso。澹酰悖椋颍椋?(M)?methionine?;?、!,-)?v?x,c-?i、:?Y?'、■':心崎^?w?.??^?\?|?So??Charged?.丄??碩iw——?j?—ms??T??口““d??(D)?aspsrtx:?acid?(£}?glutamic?acid?|?|?(K)?{?)?argin?r???|?…!??h7vIoh?¥1oh?|?hvlOHH,%l0M?卜、義_?|?%????VH?1?II?\?\?I?V)H???i?j?,,痛人?_,?|???Hydrophilic?Other??<S)貨ri■液?(T)熱refine?(N)?aspsm§i?ve?(Q)?giufef^ne?(P)?fxo^ne?(Q)?^ycim?(C)?ty&l&s??H>Ny^〇H?^-^oh?^y^oH^y^oH?(^〇??H>N^oh^Y^oh??^?OH?^-OH?L??Vsh???°?O^NH,??
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本文編號:3415108
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