拓撲指數(shù)主要應用于兩個方面:構(gòu)效關(guān)系研究;化學信息管理。其中化學信息管理要求拓撲指數(shù)具有高選擇性,需要用含有大量化合物的數(shù)據(jù)集檢驗其唯一性�；诖饲肮ぷ鳎ㄈ缃Y(jié)構(gòu)生成器）所產(chǎn)生的虛擬數(shù)據(jù)集,本論文中開展了拓撲指數(shù)的生成、唯一性驗證和應用研究,具體如下:1.高選擇性分子拓撲指數(shù)研究有時一個化合物可以采用不同的化學結(jié)構(gòu)圖來表示,對于化學家來說這些圖是化學等價的,他們常常希望能用一個描述符表示這些結(jié)構(gòu)。為了解決此問題,本論文基于3-EAID指數(shù)提出了一個高選擇性分子拓撲指數(shù)—ATID（adjacent topology identification）。首先,采用兩個虛擬數(shù)據(jù)集檢驗該指數(shù)的唯一性,未出現(xiàn)簡并,即ATID具有高區(qū)分能力。這兩個虛擬數(shù)據(jù)集是:1)含1-25個碳原子的6000多萬個鏈烷烴異構(gòu)體;2)含1-14個苯環(huán)的1900多萬個苯環(huán)型化合物。然后,將ATID應用于實際數(shù)據(jù)庫中重復結(jié)構(gòu)的檢索。結(jié)果顯示,在含20多萬個化學結(jié)構(gòu)的NCI數(shù)據(jù)庫中有13對等價化學結(jié)構(gòu);在含2000多萬個結(jié)構(gòu)的ZINC數(shù)據(jù)庫中有8萬多對等價化學結(jié)構(gòu)。這些等價化學結(jié)構(gòu)主要是由某個共軛體系或電荷分布不同所形成。2.... 

【文章來源】：河南大學河南省

【文章頁數(shù)】：77 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

C7H16的窮舉結(jié)果

2圖 1-3 結(jié)構(gòu)生成器的特點當分子比較簡單時，化學家可以手動畫出同分異構(gòu)體，但是這種方法僅僅對小分子有效。隨著碳原子數(shù)量增加，其同分異構(gòu)體的數(shù)量迅速增加，就鏈烷烴 C20H42為例，其同分異構(gòu)體數(shù)量已經(jīng)達到 36 萬多，顯然，這已經(jīng)不是人力所能解決的問題，而結(jié)構(gòu)生成器為我們提供了一種可行的技術(shù)手段。目前的結(jié)構(gòu)生成器是以中國科學院長春應化所所建立的結(jié)構(gòu)解析系統(tǒng)ESESOC[17-18

圖 1-5 化學鍵的分層示意圖nce Matrix)的生成示分子中的每個原子，其中，Z 是原子δV= 4 - 2 = 2。CVM 矩陣的衍生，見公0,1,...,Vkd D 為 d 的原子集合；D 為 i 與分子中任意d Matrix)的生成）計算。 ;1,...,kmm nda d D 原子 i 距離為 d 和 d-1 的原子集合；分

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
[1]二維空間中苯環(huán)型化合物手性的圖論描述研究[D]. 趙談封.河南大學 2014



本文編號：3291426