絲氨酸構(gòu)象異構(gòu)化機(jī)理的密度泛函理論研究
發(fā)布時間:2021-04-09 00:23
采用M06/6-31++G**方法研究了絲氨酸構(gòu)象異構(gòu)化機(jī)理,得到15種絲氨酸穩(wěn)定構(gòu)象和15個過渡態(tài)。構(gòu)象間可以通過分子內(nèi)化學(xué)鍵的旋轉(zhuǎn)相互轉(zhuǎn)化,氨基旋轉(zhuǎn)的能壘低于10.16 kJ?mol-1;C-C鍵旋轉(zhuǎn)的能壘低于23.31 kJ?mol-1,側(cè)鏈羥基旋轉(zhuǎn)的能壘低于24.13 kJ?mol-1,羧羥基的旋轉(zhuǎn)能壘在39.68~54.80 kJ?mol-1之間。最穩(wěn)定構(gòu)象A轉(zhuǎn)化為次穩(wěn)定構(gòu)象B的路徑為A→A-O→O→N-O→N→I-N→I→I-J→J→D-J→D→D-H→H→G-H→G→B-G→B,該路徑的最高能壘為54.80 kJ?mol-1。
【文章來源】:唐山師范學(xué)院學(xué)報. 2020,42(06)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
絲氨酸構(gòu)象及其轉(zhuǎn)化途徑
圖1 絲氨酸構(gòu)象及其轉(zhuǎn)化途徑C1-O1鍵的旋轉(zhuǎn)導(dǎo)致J經(jīng)由過渡態(tài)D-J轉(zhuǎn)變?yōu)镈,二面角ΦH1–O1–C1–O2相應(yīng)地變化,由-0.6°到-97.7°再到176.5°,能量先升高49.72 k J?mol-1,再降低54.80 k J?mol-1。C3—C2鍵的旋轉(zhuǎn)導(dǎo)致D經(jīng)由D-H變?yōu)镠,二面角ΦO3–C3–C2–C1由64.8°到123.1°再到103.9°,能量先升高23.31 k J?mol-1,再降低18.64 k J?mol-1。O3-C3鍵的旋轉(zhuǎn)導(dǎo)致H經(jīng)由過渡態(tài)G-H轉(zhuǎn)變?yōu)镚,二面角ΦH4–O3–C3–C2由-123.3°到3.4°再到179.6°,能量先升高14.87 k J?mol-1,再降低15.49 k J?mol-1。構(gòu)象G通過C3-C2鍵的旋轉(zhuǎn)經(jīng)由B-G變?yōu)锽,二面角ΦO3–C3–C2–C1由-179.3°到4.5°再到-63.3°,能量先升高7.49 k J?mol-1,再降低14.43 k J?mol-1。
本文編號:3126550
【文章來源】:唐山師范學(xué)院學(xué)報. 2020,42(06)
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絲氨酸構(gòu)象及其轉(zhuǎn)化途徑
圖1 絲氨酸構(gòu)象及其轉(zhuǎn)化途徑C1-O1鍵的旋轉(zhuǎn)導(dǎo)致J經(jīng)由過渡態(tài)D-J轉(zhuǎn)變?yōu)镈,二面角ΦH1–O1–C1–O2相應(yīng)地變化,由-0.6°到-97.7°再到176.5°,能量先升高49.72 k J?mol-1,再降低54.80 k J?mol-1。C3—C2鍵的旋轉(zhuǎn)導(dǎo)致D經(jīng)由D-H變?yōu)镠,二面角ΦO3–C3–C2–C1由64.8°到123.1°再到103.9°,能量先升高23.31 k J?mol-1,再降低18.64 k J?mol-1。O3-C3鍵的旋轉(zhuǎn)導(dǎo)致H經(jīng)由過渡態(tài)G-H轉(zhuǎn)變?yōu)镚,二面角ΦH4–O3–C3–C2由-123.3°到3.4°再到179.6°,能量先升高14.87 k J?mol-1,再降低15.49 k J?mol-1。構(gòu)象G通過C3-C2鍵的旋轉(zhuǎn)經(jīng)由B-G變?yōu)锽,二面角ΦO3–C3–C2–C1由-179.3°到4.5°再到-63.3°,能量先升高7.49 k J?mol-1,再降低14.43 k J?mol-1。
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