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螺旋手性SWCNT的尺寸對(duì)賴氨酸分子手性轉(zhuǎn)變反應(yīng)的限域影響

發(fā)布時(shí)間:2018-10-23 07:32
【摘要】:采用量子力學(xué)與分子力學(xué)組合的ONIOM方法,研究了兩種構(gòu)象的賴氨酸分子限域在螺旋手性單壁碳納米管內(nèi)的手性轉(zhuǎn)變機(jī)理.結(jié)構(gòu)分析表明:納米管管徑越小,限域在其中的賴氨酸分子骨架形變?cè)矫黠@,手性碳上的氫原子與氨基上氮的氮原子距離越小.勢(shì)能面計(jì)算表明,兩種構(gòu)象的賴氨酸分子限域在SWCNT(6,4)時(shí),旋光異構(gòu)反應(yīng)決速步的吉布斯自由能壘分別是194.72和170.08kJ·mol~(-1),分別由質(zhì)子從手性碳向氨基氮和質(zhì)子從手性碳向氨基氮與氨基上的質(zhì)子向羰基氧雙質(zhì)子協(xié)同遷移的過(guò)渡態(tài)產(chǎn)生的.與裸反應(yīng)的此通道決速步能壘252.6kJ·mol~(-1)相比較有顯著降低.兩種構(gòu)象的賴氨酸分子限域在SWCNT(6,4)內(nèi)旋光異構(gòu)反應(yīng)的表觀能壘分別是160.00和178.59kJ·mol~(-1).他們限域在SWCNT(7,4)內(nèi)時(shí),旋光異構(gòu)反應(yīng)決速步的能壘分別是238.28和217.18kJ·mol~(-1);限域在SWCNT(8,4)內(nèi)時(shí),旋光異構(gòu)反應(yīng)決速步的能壘分別是253.00和250.11kJ·mol~(-1).結(jié)果表明:螺旋手性單壁碳納米管的孔徑越小,對(duì)賴氨酸分子手性轉(zhuǎn)變反應(yīng)的限域催化作用越好;限域在SWCNT(6,4)內(nèi)的賴氨酸分子構(gòu)象1更容易旋光異構(gòu).
[Abstract]:The chiral transition mechanism of two conformational lysine molecular limiting regions in spiral chiral single-walled carbon nanotubes was studied by using ONIOM method combined with quantum mechanics and molecular mechanics. The structure analysis shows that the smaller the diameter of nanotubes, the more apparent the deformation of lysine molecular skeleton in the limiting region, and the smaller the distance between the hydrogen atom on the chiral carbon and the nitrogen atom on the amino group. The potential energy surface calculation shows that the Lysine molecular limiting region of the two conformations is at SWCNT _ (6 ~ (4). The Gibbs free energy barrier of the reaction is 194.72 and 170.08kJ mol~ (-1), respectively, resulting from the transition of protons from chiral carbon to amino nitrogen and from protons on amino groups to carbonyl oxygen diprotons. Compared with the bare reaction, the 252.6kJ mol~ (-1) of the fast step barrier in this channel is significantly reduced. The apparent energy barriers of the two conformational Lysine molecular limiter reactions in SWCNT (6 ~ 4) are 160.00 and 178.59kJ mol~ (-1), respectively. The energy barriers of the fast step of optically isomerism reaction are 238.28 and 217.18kJ mol~ (-1), respectively, and the energy barriers of the fast step of the reaction of optically isomerism reaction are 253.00 and 250.11kJ mol~ (-1), respectively, when the limiting region is in SWCNT (7 ~ 4), and the energy barrier of the fast step of the reaction is 253.00 and 250.11kJ mol~ (-1), respectively, when the limiting region is within SWCNT (8 ~ (4). The results show that the smaller the pore size of the helical chiral carbon nanotubes, the better the limited catalytic effect on the chiral transition reaction of lysine molecules, and the easier the optical rotation isomerization of lysine molecular conformation 1 in SWCNT (6N4).
【作者單位】: 白城師范學(xué)院物理學(xué)院;
【基金】:吉林省科技發(fā)展計(jì)劃自然科學(xué)基金(20130101308JC) 吉林省高等學(xué)校大學(xué)生創(chuàng)新項(xiàng)目(2016002)
【分類號(hào)】:O629.71

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本文編號(hào):2288513

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