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表面增強拉曼光譜研究DNA堿基與農藥相互作用及適配體傳感器的應用

發(fā)布時間:2018-09-14 19:14
【摘要】:本研究主要利用SERS研究了DNA堿基、堿基與農藥的相互作用以及應用核酸配適體傳感器檢測馬拉硫磷。堿基是脫氧核糖核酸(DNA)的主要組成部分,與生物的生長、發(fā)育、繁殖等正常生命活動及突變、癌變等異常生命活動密切相關。因此,堿基的性質一直是生物和化學領域的重要研究內容之一。研究DNA堿基與農藥相互作用有助于從分子水平上認識農藥分子對DNA作用的細節(jié),對了解致毒、致癌、致基因突變產生的機理具有一定的意義。同時可為農藥適配體傳感器的篩選和構建提供依據,應用農藥適配體與表面增強拉曼光譜(SERS)法相結合可以對農藥殘留分子進行特異性檢測,以此為基礎建立對農藥分子的特異性快速檢測方法,是一項具有實際應用價值的工作。首先,通過化學還原法制備出了具有SERS活性的金、銀納米粒子,粒子形貌規(guī)整,接近球形。對四種DNA堿基(腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶)在銀上的SERS譜進行研究,運用密度泛函理論(DFT)/B3LYP泛函方法對堿基分子內鍵振動模擬計算其理論拉曼光譜,并與實驗NRS、SERS進行對比,對其峰進行了詳細的歸屬。進一步從理論上研究了銀金屬團簇對腺嘌呤振動光譜的影響。結果表明,隨著銀原子數目的增加,腺嘌呤N與Ag距離隨Ag原子數的增加而距離變小,模擬光譜和實驗SERS能更好地相符合,且其靜態(tài)極化率值增大,與模擬的拉曼光譜峰強度的變化趨勢顯現相關性。結合實驗SERS譜,說明腺嘌呤環(huán)上的N原子與金屬銀發(fā)生了電荷轉移。為進一步利用拉曼光譜研究單堿基分子與農藥分子的相互作用研究奠定了理論和實驗基礎。其次,采用SERS方法詳細研究了胞嘧啶(Cy)在銀上的吸附行為和規(guī)律。從理論計算結合實測值探討了Cy在基底Ag上的增強效應和吸附行為?疾炝薈y分子在Ag納米粒子上的不同吸附時間、濃度、pH等條件對SERS光譜的影響,發(fā)現pH影響最大,Cy分子存在兩種不同的異構體和三種不同的存在形態(tài),并隨酸度變化相互轉化而達動態(tài)平衡;贑y在不同pH時的形態(tài)分布和相應的SERS變化規(guī)律,結合DFT算得的Cy分子中的電荷分布及在銀基底表面的吸附機制,詳細探討了酸堿對Cy分子的SRES光譜影響的內因和吸附機理,在中性和弱堿性時,Cy中的N3和O與Ag形成配位吸附,在pH大于11時,N與Ag形成配位吸附,而O與Ag形成共價吸附。在此基礎上,采用UV(紫外光譜)和SERS研究了四種DNA堿基與農藥倍硫磷分子在溶液中的相互作用,主要對其作用位點、相互作用強弱進行了研究,結果表明,在腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶含氨基的三種堿基,主要是倍硫磷與這三種堿基的氨基作用是其主要結合位點,而在胸腺嘧啶中,作用對其的影響主要是對其環(huán)呼吸振動的影響。根據倍硫磷的分子表面靜電勢圖,11位的S原子是其分子電子密度集中區(qū)域,是與堿基作用的主要位點。結合DFT計算表明,以不同位點結合對其環(huán)呼吸振動的影響不同,作用位點越靠近堿基環(huán)的位置,對環(huán)振動拉曼峰的影響越大。最后,利用銀溶膠和適配體,發(fā)展了一種針對馬拉硫磷的特異性檢測的SERS方法。通過適配體-馬拉硫磷結合靶標物1089、1112 cm-1兩處特征峰中1112 cm-1的強度來檢測馬拉硫磷,結果表明在5×10-7~1×10-5 mol·L-1范圍內具有線性,其線性程為I=58.37C(×10-7 mol·L-1)+197.97,R2=0.9920。且通過模擬樣品測試和特異性實驗驗證了該方法的可行性和特異性,該方法測定簡單,且具有特異性,有一定的應用價值,可實現樣品中馬拉硫磷的快速無損檢測。
[Abstract]:In this study, SERS was used to study the interaction between DNA bases and pesticides, and the detection of malathion by nucleic acid ligand biosensor. Bases are the main components of DNA, which are closely related to normal life activities such as growth, development, reproduction, mutation, canceration and other abnormal life activities. The study of the interaction between DNA bases and pesticides is helpful to understand the details of the interaction between pesticides and DNA at the molecular level. It is also helpful to understand the mechanism of toxicity, carcinogenesis and gene mutation. It is a valuable work to establish a rapid and specific method for the detection of pesticide residues by combining the aptamer with surface-enhanced Raman spectroscopy (SERS). Firstly, the SERS active pesticide residues were prepared by chemical reduction method. The SERS spectra of four DNA bases (adenine, guanine, cytosine, thymine) on silver were studied. The theoretical Raman spectra of the intramolecular bond vibrations were calculated by density functional theory (DFT) / B3LYP functional method, and compared with experimental NRS and SERS. The results show that the distance between adenine N and Ag decreases with the increase of the number of silver atoms, and the simulated spectra and experimental SERS are in better agreement with each other, and the static polarizability increases with the increase of the number of silver atoms. The results show that the N atoms on the adenine ring have charge transfer with silver. It lays a theoretical and experimental foundation for the further study of the interaction between single base molecule and pesticide molecule by Raman spectroscopy. Secondly, the cytosine is studied in detail by SERS method. The enhancement effect and adsorption behavior of Cy on Ag substrate were discussed by theoretical calculation and measured values. The effects of different adsorption time, concentration and pH on SERS spectra of Cy on Ag nanoparticles were investigated. It was found that pH had the greatest influence on SERS spectra. Cy molecules had two different isomers and three different types. Based on the morphological distribution of Cy molecule at different pH and the corresponding SERS variation law, combined with the charge distribution of Cy molecule calculated by DFT and the adsorption mechanism on the surface of silver substrate, the internal cause and adsorption mechanism of acid-base effect on the SRES spectrum of Cy molecule were discussed in detail. When the pH is higher than 11, N and Ag form coordination adsorption, while O and Ag form covalent adsorption. On this basis, UV (ultraviolet spectroscopy) and SERS were used to study the interaction between four DNA bases and thiophosphorus pesticide molecules in solution, mainly the interaction site and interaction strength were studied. The results showed that the amino-binding sites of the three amino groups in adenine, guanine and cytosine were mainly the amino-binding sites of thiophosphorus and the amino-binding sites of the three amino groups. In thymine, the effect of the amino-binding sites on the cyclic respiratory vibrations was mainly the effect of the amino-binding sites. The results of DFT calculation show that the closer the binding site to the base ring, the greater the influence on the Raman peak of ring vibration. Finally, a special kind of malathion was developed by using silver sol and aptamer. SERS method for anisotropy detection. Malathion was detected by the intensity of 1112 cm-1 in the two characteristic peaks of the aptamer-malathion binding target 1089,1112 cm-1. The results showed that it was linear in the range of 5 *10-7~1 *10-5 mol.L-1, and the linear equation was I=58.37C (*10-7 mol.L-1)+197.97, R2=0.9920. The feasibility and specificity of this method are verified by experiments. The method is simple, specific and has certain application value. It can be used for rapid and nondestructive detection of malathion in samples.
【學位授予單位】:浙江工業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:O657.37;TQ450.1

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本文編號:2243628

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