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咖啡酸與小牛胸腺DNA的相互作用

發(fā)布時(shí)間:2018-05-08 10:26

  本文選題:咖啡酸 + 小牛胸腺DNA; 參考:《南昌大學(xué)學(xué)報(bào)(理科版)》2017年04期


【摘要】:在生理酸度條件下(pH 7.4),運(yùn)用紫外-可見吸收光譜、多元曲線分辨-交替最小二乘法(MCR-ALS)、圓二色譜(CD)、傅立葉紅外光譜(FT-IR)并結(jié)合分子模擬,研究了咖啡酸(CA)與小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,CA與ctDNA的結(jié)合未引起ctDNA的熔點(diǎn)和粘度產(chǎn)生明顯變化,NaCl濃度的增加,對(duì)CA-ctDNA體系紫外吸光度無明顯影響,且單鏈DNA與CA的結(jié)合常數(shù)大于雙鏈DNA,表明二者是以溝槽方式結(jié)合。計(jì)算出的熱力學(xué)參數(shù)表明,疏水作用是CA與ctDNA相互作用的主要驅(qū)動(dòng)力。FT-IR和分子模擬結(jié)果顯示,CA主要與胸腺嘧啶(T堿基)結(jié)合。CD光譜分析結(jié)果表明,CA誘導(dǎo)ctDNA構(gòu)象發(fā)生由B型向A型轉(zhuǎn)變。
[Abstract]:The interaction between caffeic acid (CA) and calf thymus DNA (ctDNA) was studied under physiological acidity condition by UV-Vis absorption spectrum, multivariate curve resolution, alternating least square method (MCR-ALS), circular dichroism (CD), Fourier infrared spectroscopy (FTIR) and molecular simulation. The experimental results showed that the combination of CA and ctDNA did not cause obvious changes in the melting point and viscosity of ctDNA, but had no obvious effect on the UV absorbance of CA-ctDNA system. The binding constant of single strand DNA and CA was higher than that of double strand DNA, which indicated that the binding between single strand DNA and CA was grooved. The calculated thermodynamic parameters show that, Hydrophobic interaction is the main driving force for the interaction between CA and ctDNA. FT-IR and molecular simulation results show that CA mainly binds to thymidine T base. The results of CD spectra show that CA induces the conformation of ctDNA from type B to type A.
【作者單位】: 南昌大學(xué)食品科學(xué)與技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(3146042,221167013) 江西省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(20143ACB20006,20171BAB204029) 食品科學(xué)與技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室目標(biāo)導(dǎo)向課題(SKLF-ZZA-201612)
【分類號(hào)】:O641.3

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本文編號(hào):1861029

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