ABEEM-7P浮動電荷模型下液態(tài)水的動力學(xué)模擬
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【摘要】:應(yīng)用ABEEM-7P水分子模型,對由216個和500個水分子構(gòu)成的液態(tài)水體系,使用周期性邊界條件,在NVT、NPT系綜下,進(jìn)行分子動力學(xué)模擬。在前人的基礎(chǔ)上研究相同的溫度弛豫時間τ_T=0.01 ps,壓力弛豫時間分別為τ_P=2.0 ps、τ_P=2.5 ps、τ_p=3.0 ps、τ_p=4.0 ps時,不同水分子體系中,氧原子上的孤對電子lp與氫原子H間的距離在小于何值時開始形成氫鍵,對分子動力學(xué)模擬性質(zhì)的影響,距離分別為8.1?、1.9?、2.0?、2.1?、2.2?和2.3?。分析數(shù)據(jù),密度隨氫鍵形成距離的增加而增加,隨著壓力弛豫時間τ_P的增加而增加。壓力在目標(biāo)壓力1atm附近上下波動,而偶極矩隨壓力弛豫時間τ_P增大而減小,隨氫鍵形成距離增加而增加。500水分子體系模擬得到的性質(zhì)明顯好于216個水分子體系。改變水盒子的初始盒長,216個水分子體系的密度隨著初始盒長的增加有減小的趨勢。當(dāng)初始盒長不超過21cm時,對壓力的影響較小,壓力值在1atm附近波動。初始盒長超過21cm時,偶極矩逐漸增加。由于模擬數(shù)據(jù)較少,還需我們進(jìn)行下一步模擬;谏鲜鲅芯拷Y(jié)果,為了更加體現(xiàn)ABEEM-7P浮動電荷模型的有點(diǎn),選擇進(jìn)一步計(jì)算AMBER力場下的動力學(xué)性質(zhì)。分別計(jì)算壓力弛豫時間τ_P=2.0 ps、τ_P=2.5 ps、τ_P=3.0 ps、τ_P=4.0 ps情況下的動力學(xué)性質(zhì)。AMBER力場的密度隨著溫度的增加而逐漸減小,ABEEM計(jì)算得到的密度隨溫度的變化更為接近實(shí)際情況下的水體系,并且隨著壓力弛豫時間τ_P的增加而增加。相比之下,AMBER固定電荷力場計(jì)算得到壓力偏差小于ABEEM-7P水分子模型。但是從整體上來說,ABEEM力場模擬得到的性質(zhì)與實(shí)驗(yàn)值有很好的一致性。上述結(jié)果為日后的研究提供一定的參考。
【學(xué)位授予單位】:遼寧師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:O641.1
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,本文編號:1266970
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