重金屬和有機(jī)污染物復(fù)合污染是復(fù)合污染中最常見的類型之一,鉻（此指Cr（Ⅵ））和多環(huán)芳烴（PAHs）均具有致畸、致癌、致突變作用,它們的復(fù)合污染對環(huán)境、動植物產(chǎn)生更嚴(yán)重的危害。細(xì)菌作為環(huán)境中最豐富的群體,在污染修復(fù)方面具有極大的優(yōu)勢,獲得高效穩(wěn)定的修復(fù)菌是微生物修復(fù)的關(guān)鍵。測序技術(shù)的革新為生物信息學(xué)的深入研究提供了技術(shù)支持,基因組和宏基因組數(shù)據(jù)庫信息隨之持續(xù)增長。本研究以功能基因rhd和chrA作為標(biāo)記物,通過基因挖掘法分析PAHs-Cr（Ⅵ）修復(fù)潛力菌多樣性和環(huán)境中此類功能基因分布,并以基因挖掘法為指引,通過相應(yīng)功能驗(yàn)證,獲得PAHs-Cr（Ⅵ）修復(fù)菌,進(jìn)而表征菌株的修復(fù)能力并對其進(jìn)行優(yōu)化,最后,從轉(zhuǎn)錄水平出發(fā),初步探究PAHs和Cr（Ⅵ）對相關(guān)基因表達(dá)的影響。本研究得到的主要結(jié)論如下:（1）通過基因挖掘,截至2017年,從IMG/M數(shù)據(jù)庫中,共得到1196個基因組同時(shí)攜帶rhd和chrA基因,它們分布于13個菌門、20個菌綱、58個菌目、123個菌科、401個菌屬和1164個菌種,其中以變形菌門（Proteobacteria）、厚壁菌門（Firmicutes）和放線菌門（Actino... 

【文章來源】：浙江大學(xué)浙江省211工程院校985工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：92 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．５細(xì)菌Ｃｒ（ＶＩ）抵抗機(jī)制［４６］??Ｆｉｇ?１．５?Ｂａｃｔｅｒｉａｌ?ｒｅｓｉｓｔａｎｔ?ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ?ｏｆ?Ｃｒ（ＶＩ）１４６１??粒上都有存在，在同一操縱子中，通常有其他功能基因分布在ｃ／；ｒ／（兩側(cè)，如圖??

Ｃｒ０４Ｊ－?？?Ｓ０４Ｊ－??＼Ｊ＼Ｊ??圖１．５細(xì)菌Ｃｒ（ＶＩ）抵抗機(jī)制［４６］??Ｆｉｇ?１．５?Ｂａｃｔｅｒｉａｌ?ｒｅｓｉｓｔａｎｔ?ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ?ｏｆ?Ｃｒ（ＶＩ）１４６１??粒上都有存在，在同一操縱子中，通常有其他功能基因分布在ｃ／；ｒ／（兩側(cè)，如圖??１．６，側(cè)翼基因的功能目前沒有完全確定，例如，ｃ／？Ｍ雖在Ｍｒ操縱子中很常見，??在不同的菌中作用不同，在（９ｃ／？ｒａ６ａｃ？ｒｗｗ的Ｙ／ｃ／?５ｂｖ?１１中，它調(diào)控Ｃｒ（?ＶＩ）敏感性，??并且只對有?Ｃｒ（ＶＩ）特異性，但在?Ｃ？／７ｒ／ａｖ／ｉ／ｗｓｗｅ／ｏ／／／ｃ／ＨｒａＡＭ■中可以被?Ｃｒ（ＩＩＩ）、Ｃｒ（ＶＩ）??和硫酸鹽激活；ｃ／ｚＨ：和可能參與調(diào)控菌株的Ｃｒ（ＶＩ）耐受能力，在Ｃ．??／＾／（＾／／／（＾？＾＾?ＡＥ１２６中，這兩個基因的缺失使菌株耐受能力下降，但在（９．?＾ｖ７／ｃ／??５ｂｖｌｌ，它們與鉻耐受能力并無相關(guān)性［１｜１。??ｃｈｒＢ２?ｃｈｒＡ２?ｃｈｒＦ２??Ｃ．?ｍｅｔａｌｌｉｄｕｒａｎｓ?ＣＨ３４???ｃｈｒｌ?ｃｈｒＢＩ?ｃｈｒＡｌ?ｃｈｒＣ?ｃｈｒＥ?ｃｈｒＦｌ??Ｃ．?ｎｔｅｌａｌｌｕｈｉｒａｎｓ?ｐＭＯＬ２８??ｔｎｐＲ?ｃｈｒＢ?ｃｈｒＡ?ｃｈｒＣ?ｃｈｒＦ?ｔｎｐＡ??Ｏ．?ｔｒｉｌｉｃｉ?５ｂｖｌ?Ｉ?－＜＾￣￣ｈ￣Ｗ＾??圖１．６ｃ／＾操縱子主要部分的基因組成情況ｆ１１］??Ｆｉｇ?１．６?Ｇｅｎｅ?ａｒｒａｎｇｅｍｅｎｔｓ?ｏｆ?ｃｈｒ?ｏｐｅｒｏｎｓ１１１１??ＣｈｒＡ蛋白可按照長度分為長鏈和短鏈ＣｈｒＡ蛋白

圖２．１?ＰＡＨｓ－Ｃｒ（ＶＩ）修復(fù)潛力菌各個菌屬ｒ／／ｄ基因、ｃ／ｚｄ基因和菌種數(shù)量熱點(diǎn)圖??（９ｔ?Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ，?Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ，?Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ）??Ｆｉｇ?２．１?Ｈｅａｔ?ｍａｐ?ｏｆ?ｒｈｄ，?ｃｈｒＡ，?ａｎｄ?ｓｐｅｃｉｅｓ７?ｎｕｍｂｅｒｓ?ｉｎ?ｅａｃｈ?ｐｏｔｅｎｔｉａｌ??ｄｕｏ－ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ?ｇｅｎｅｒａ??（Ｅｘｃｌｕｄｉｎｇ?Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ，?Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ，?Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ）??２２??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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[2]河流沉積物中重金屬與有機(jī)物的復(fù)合污染研究[D]. 高茜.華北電力大學(xué) 2012
[3]基于宏基因組的芳烴加氧酶獲取及特性研究[D]. 茍敏.大連理工大學(xué) 2011
[4]我國土壤和大氣中多環(huán)芳烴分布特征和大尺度數(shù)值模擬[D]. 馬萬里.哈爾濱工業(yè)大學(xué) 2010
[5]土壤典型PPCPs污染及與重金屬Cd的聯(lián)合毒性及機(jī)理[D]. 陳翠紅.南開大學(xué) 2010

碩士論文
[1]中國多環(huán)芳烴排放清單[D]. 穆璽龍.中國石油大學(xué)(北京) 2016
[2]Massilia sp.WF1對菲的降解特性研究[D]. 羅小艷.浙江大學(xué) 2015



本文編號：3620809