兩種鞘酯單胞菌的rsh基因缺失對(duì)群體感應(yīng)信號(hào)分子積累的影響
發(fā)布時(shí)間:2022-01-06 00:48
鞘酯單胞菌(sphingomonads)作為能夠降解廣泛的芳香族化合物(如各類多環(huán)芳烴)的一類細(xì)菌,具有良好的生物修復(fù)潛力。然而,細(xì)菌在環(huán)境中常常面臨高溫、干旱、鹽堿和營(yíng)養(yǎng)貧乏等環(huán)境壓力,因此可能影響菌體生長(zhǎng)和存活,導(dǎo)致污染修復(fù)效率降低。由鳥(niǎo)苷四(五)磷酸(guanosinetetraphosphate和guanosine pentaphosphate,統(tǒng)稱(p)ppGpp)介導(dǎo)的應(yīng)激反應(yīng)能夠協(xié)調(diào)細(xì)菌的生理代謝活動(dòng),從而保證細(xì)菌可在脅迫條件下生存。在sphingomonads中,(p)ppGpp由Rsh蛋白合成和水解。鑒于細(xì)菌的群體感應(yīng)(Quorum sensing,QS)能夠調(diào)控細(xì)菌的一系列生理活性,研究sphingomonads的rsh基因?qū)S信號(hào)分子積累的影響可為今后在惡劣環(huán)境中將sphingomonads作為降解污染物的生物材料提供理論依據(jù)。sphingomonads的QS信號(hào)分子主要為;呓z氨酸內(nèi)酯(acyl-homoserinelactone,AHL)。目前,對(duì)sphingomonads的rsh基因和AHL的關(guān)系的探究存在著大片空白,雖然sphingomonads的基因...
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1?(p)ppGpp分子結(jié)構(gòu)[1]??Fig?1.1?The?molecular?structure?of?(p)ppGpp??
酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到GTP/GDP上,啟動(dòng)(p)ppGpp合成^SpoT主要響應(yīng)缺乏脂肪酸[6]、??鐵離子[7]和碳源[8]的情況。和RelA不同,SpoT能把(p)ppGpp水解為GTP/GDP和焦??酸鹽,同時(shí)也具備微弱的(p)ppGpp合成能力(圖1.2)。??,(GTPorGDP)、??〇:〇^??ppGpp?Z??jr?N?o?〇?〇?o??(GTP?orCDP)?+?PP?o?o?〇?〇?〇??_?〇°〇〇??〇?o??圖1.2?RelA/SpoT同源蛋白調(diào)控(p)ppGpp代謝的途徑[9]??Fig?1.2?RelA/SpoT?homolog?enzymes?^controlling?(p)ppGpp?metabolism??除了5e/oproteoZwc/er/a和Gawwapro/eoZwCerfcr,大部分細(xì)菌的(p)ppGpp濃度??是由RelA/SpoT同源蛋白質(zhì)Rsh調(diào)控的,Rsh大^由750個(gè)氨基酸俎成,結(jié)構(gòu)和SpoT??相似,同時(shí)具有合成和水解的功能。在不同菌株中,Rsh響應(yīng)的營(yíng)養(yǎng)條件具有較??大差異。在以,eracocaw為eco/W10],Afyxococcro?和57/%加所>^以??coe//co/ortl2]等菌中,氨基酸饑餓可以誘發(fā)應(yīng)激反應(yīng)。在cracewms中,??僅僅是氨基酸饑餓不足以產(chǎn)生由Rsh調(diào)控的應(yīng)激反應(yīng),'還需要額外的刺激因素如??礙源或氮源饑餓[13]。AfycoMc/er/麵mAercw/os/s在能促進(jìn)空載tRNA積累的絲氨酸??、■*??羥肟酸的作用下沒(méi)有積累(p)ppG。
Rsh蛋白具有多個(gè)結(jié)構(gòu)域,可分為N末端結(jié)構(gòu)域和C末端結(jié)構(gòu)域[9]。N末端結(jié)??構(gòu)域由水解酶結(jié)構(gòu)域(HD)和合成酶結(jié)構(gòu)域(Syn)組成,C末端結(jié)構(gòu)域由TGS??結(jié)構(gòu)域和ACT結(jié)構(gòu)域組成(圖1.3)。??Hydrolase?(HD)?Synthetase?(Syn??HD1?HD2?HD3?HD4?HD5?HD6?Syn1?Syn2?Syn3?Syn4?Syn5??53H?77HD?81ED144DR/K148N?241RxKxxxSxxxK?264DxxxxR?308YxxxH?321ExQIRT??12?3?4?5?6?1?2?3?45??W\/?\/?ll?II/??rsh?;?an?i?i?rii?mi?_?現(xiàn)_i??RelA?;?l?II?Mil?i?i?\?\?11?1??SpoT?an?n?ii?m!??圖1.3RelA/SpoT同源蛋白的結(jié)構(gòu)域和催化模體??Fig?1.3?Domain?architecture?and?catalytic?motifs?of?RelA/SpoT?homolog?enzymes??Rsh、RelA、SpoT都具有Syn結(jié)構(gòu)域,其中包含5個(gè)保守的模體(Synl-5)。??Synl與ATP底物互相作用,Syn2的天冬氨酸和精氨酸分別與鎂離子和ATP作用,??Syn3的酪氨酸和組氨酸和GDP/GTP的鳥(niǎo)嘌呤部分作用,Syn4的谷氨酸和鎂離子??作用,同時(shí)谷氨酸有助于ATP結(jié)合,Syn5的組氨酸則和ATP的核糖部分互相作用。??Rsh和SpoT具有HD結(jié)構(gòu)域,而RelA缺乏HD結(jié)構(gòu)域,因此沒(méi)有水解活性。??HD結(jié)構(gòu)域是一個(gè)依賴金屬離子的磷酸水解酶結(jié)構(gòu)域
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]枯草芽孢桿菌的群體感應(yīng)信號(hào)系統(tǒng)及其在環(huán)境領(lǐng)域的應(yīng)用前景[J]. 陳瑞,王大力,林志芬,尹大強(qiáng). 安全與環(huán)境學(xué)報(bào). 2012(06)
本文編號(hào):3571375
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1?(p)ppGpp分子結(jié)構(gòu)[1]??Fig?1.1?The?molecular?structure?of?(p)ppGpp??
酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到GTP/GDP上,啟動(dòng)(p)ppGpp合成^SpoT主要響應(yīng)缺乏脂肪酸[6]、??鐵離子[7]和碳源[8]的情況。和RelA不同,SpoT能把(p)ppGpp水解為GTP/GDP和焦??酸鹽,同時(shí)也具備微弱的(p)ppGpp合成能力(圖1.2)。??,(GTPorGDP)、??〇:〇^??ppGpp?Z??jr?N?o?〇?〇?o??(GTP?orCDP)?+?PP?o?o?〇?〇?〇??_?〇°〇〇??〇?o??圖1.2?RelA/SpoT同源蛋白調(diào)控(p)ppGpp代謝的途徑[9]??Fig?1.2?RelA/SpoT?homolog?enzymes?^controlling?(p)ppGpp?metabolism??除了5e/oproteoZwc/er/a和Gawwapro/eoZwCerfcr,大部分細(xì)菌的(p)ppGpp濃度??是由RelA/SpoT同源蛋白質(zhì)Rsh調(diào)控的,Rsh大^由750個(gè)氨基酸俎成,結(jié)構(gòu)和SpoT??相似,同時(shí)具有合成和水解的功能。在不同菌株中,Rsh響應(yīng)的營(yíng)養(yǎng)條件具有較??大差異。在以,eracocaw為eco/W10],Afyxococcro?和57/%加所>^以??coe//co/ortl2]等菌中,氨基酸饑餓可以誘發(fā)應(yīng)激反應(yīng)。在cracewms中,??僅僅是氨基酸饑餓不足以產(chǎn)生由Rsh調(diào)控的應(yīng)激反應(yīng),'還需要額外的刺激因素如??礙源或氮源饑餓[13]。AfycoMc/er/麵mAercw/os/s在能促進(jìn)空載tRNA積累的絲氨酸??、■*??羥肟酸的作用下沒(méi)有積累(p)ppG。
Rsh蛋白具有多個(gè)結(jié)構(gòu)域,可分為N末端結(jié)構(gòu)域和C末端結(jié)構(gòu)域[9]。N末端結(jié)??構(gòu)域由水解酶結(jié)構(gòu)域(HD)和合成酶結(jié)構(gòu)域(Syn)組成,C末端結(jié)構(gòu)域由TGS??結(jié)構(gòu)域和ACT結(jié)構(gòu)域組成(圖1.3)。??Hydrolase?(HD)?Synthetase?(Syn??HD1?HD2?HD3?HD4?HD5?HD6?Syn1?Syn2?Syn3?Syn4?Syn5??53H?77HD?81ED144DR/K148N?241RxKxxxSxxxK?264DxxxxR?308YxxxH?321ExQIRT??12?3?4?5?6?1?2?3?45??W\/?\/?ll?II/??rsh?;?an?i?i?rii?mi?_?現(xiàn)_i??RelA?;?l?II?Mil?i?i?\?\?11?1??SpoT?an?n?ii?m!??圖1.3RelA/SpoT同源蛋白的結(jié)構(gòu)域和催化模體??Fig?1.3?Domain?architecture?and?catalytic?motifs?of?RelA/SpoT?homolog?enzymes??Rsh、RelA、SpoT都具有Syn結(jié)構(gòu)域,其中包含5個(gè)保守的模體(Synl-5)。??Synl與ATP底物互相作用,Syn2的天冬氨酸和精氨酸分別與鎂離子和ATP作用,??Syn3的酪氨酸和組氨酸和GDP/GTP的鳥(niǎo)嘌呤部分作用,Syn4的谷氨酸和鎂離子??作用,同時(shí)谷氨酸有助于ATP結(jié)合,Syn5的組氨酸則和ATP的核糖部分互相作用。??Rsh和SpoT具有HD結(jié)構(gòu)域,而RelA缺乏HD結(jié)構(gòu)域,因此沒(méi)有水解活性。??HD結(jié)構(gòu)域是一個(gè)依賴金屬離子的磷酸水解酶結(jié)構(gòu)域
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]枯草芽孢桿菌的群體感應(yīng)信號(hào)系統(tǒng)及其在環(huán)境領(lǐng)域的應(yīng)用前景[J]. 陳瑞,王大力,林志芬,尹大強(qiáng). 安全與環(huán)境學(xué)報(bào). 2012(06)
本文編號(hào):3571375
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