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稗草SSR分析及鎘脅迫下抗氧化酶的研究

發(fā)布時(shí)間:2020-11-03 17:44
   稗草為常見田間雜草,隨著稗草更多的優(yōu)點(diǎn)和應(yīng)用價(jià)值的發(fā)現(xiàn),對稗草的研究方向越來越廣泛。近些年來有研究顯示,稗草可作為土壤重金屬鎘污染的修復(fù)植物。本試驗(yàn)基于SSR結(jié)果、利用Popgene 1.32和NTsys 2.1e軟件對黑龍江地區(qū)43份稗草進(jìn)行遺傳多樣性分析并分類;用濃度分別為0mg/L、50mg/L、100mg/L、150mg/L的鎘離子對稗草種子進(jìn)行脅迫處理,計(jì)算稗草種子萌發(fā)率、萌發(fā)指數(shù)和活力指數(shù);從中挑選出對重金屬鎘耐受能力強(qiáng)的品種放入溫室中培養(yǎng),在稗草分蘗期用0mg/kg、50mg/kg、100mg/kg和150mg/kg 4個(gè)濃度的鎘離子處理,測定稗草的丙二醛(MDA)含量及抗氧化酶(SOD,POD,CAT)活性。本研究為黑龍江地區(qū)稗草資源的應(yīng)用和分類提供參考依據(jù)。(1)利用13對SSR引物對43份稗草的基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增,每條引物擴(kuò)增出的條帶數(shù)為3~14個(gè),共擴(kuò)增出101個(gè)條帶,其中78個(gè)條帶具有多態(tài)性,占總條帶數(shù)的77.23%,引物EG_1、EG_2和EG_320,分別擴(kuò)增出11個(gè)、12個(gè)和5個(gè)條帶,多態(tài)性比例均為100%。43份稗草有著較豐富的遺傳多樣性,聚類分析將它們分為了3大類。(2)本試驗(yàn)用不同濃度的鎘離子脅迫43份稗草種子,結(jié)果表明當(dāng)鎘離子濃度為150mg/L時(shí),2號米稗、29號鎖鏈稗和42號鵝頭稗萌發(fā)率均為96.7%,43號大粒稗萌發(fā)率為98.3%;2號米稗的萌發(fā)指數(shù)最高,為12.75;29號鎖鏈稗活力指數(shù)最高,為190.13。(3)稗草幼苗在鎘離子脅迫下生理指標(biāo)測定結(jié)果顯示,4種稗草丙二醛(MDA)含量先逐漸下降,在處理15天或20天時(shí)降到最低,后又小幅度升高;4種稗草過氧化酶(SOD、POD、CAT)活性變化的趨勢均為持續(xù)上升,在處理25天時(shí)活性達(dá)到最高,說明這4種稗草對重金屬鎘有較強(qiáng)的耐受力。
【學(xué)位單位】:哈爾濱師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S451;X503.233
【部分圖文】:

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帶為止;(4) 終止顯色:取出玻璃板放入 0.1%醋酸溶液終止反應(yīng);??(5) 拍照。2.4 結(jié)果與分析2.4.1 DNA 的提取與檢測如圖 2-1 所示,提取的稗草基因組 DNA 條帶清晰明亮,極少出現(xiàn)拖尾。用紫外分光光度儀對 DNA 純度進(jìn)行檢測,43 份稗草的 DNA 樣本 A260與 A280的比值最高為 2.1 最低為 1.8,表明所有 DNA 樣品可作為 SSR 擴(kuò)增的模板。

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EC_5 5 0 0.00總計(jì) 101 78 -平均 7.77 6 77.232.4.3 43 份稗草的遺傳多樣性分析如表 2-9 所示,用 Popgene 1.32 軟件對 43 份稗草的遺傳多樣性進(jìn)行分析可知,平均等位基因數(shù)(Na)為 1.7426±0.4394,平均有效等位基因數(shù)(Ne)為1.4846±0.3936,平均 Ne′s 基因多樣性(H)為 0.2626±0.1715,平均 Shannon′s 信息指數(shù)(I)為 0.3891±0.2797。以上結(jié)果表明 43 份稗草的種間遺傳變異較大,黑龍江地區(qū)稗草有著較豐富的遺傳多樣性。表 2-9 遺傳多樣性參數(shù)Table 2-9 Parameters of genetic diversityLous Sample Size Na* Ne* H* I*Mean 43 1.7426 1.4846 0.2626 0.3891St.Dev 0.4394 0.3936 0.1715 0.2797

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圖 2-3 引物 EC3 的 SSR-PCR 電泳圖Fig. 2-3 Electrophoresis map of SSR-PCR products amplified with primers EC3注:M 為 DL500 DNAmarker;從左至右 43 份稗草按順序排列Note: M: DL500 DNAmarker; from left to right, 43 pieces of barnyard grass were arranged in order2.4.4 43 份稗草的聚類分析用 NTSYS 2.1e 軟件對 43 份稗草 SSR 標(biāo)記進(jìn)行統(tǒng)計(jì)后分析,計(jì)算遺傳相似系數(shù)(SM),構(gòu)建基于 SSR 標(biāo)記的 UPGMA 親緣關(guān)系聚類圖(圖 2-4)。由圖 2-4可知,參試稗草的相似系數(shù)為 0.70~0.97。當(dāng)以遺傳相似性系數(shù)為 0.75 作為闕值時(shí),能夠?qū)?43 份稗草分為三大類。第Ⅰ類包括 1 號、2 號、15 號、19 號、16 號、27 號、28 號、40 號、30 號、32號、32 號、31 號、33 號、6 號、20 號、39 號、13 號、14 號、34 號、41 號、35號、9 號、12 號,共 22 種;第Ⅱ類包括 3 號、4 號、5 號、10 號、11 號、6 號、7號、8 號,共 8 種;第Ⅲ類包括 17 號、18 號、25 號、29 號、38 號、21 號、22 號、38 號、21 號、22 號、23 號、24 號、26 號、42 號 43 號、37 號,共 13 種。
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