稗草SSR分析及鎘脅迫下抗氧化酶的研究
【學(xué)位單位】:哈爾濱師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S451;X503.233
【部分圖文】:
帶為止;(4) 終止顯色:取出玻璃板放入 0.1%醋酸溶液終止反應(yīng);??(5) 拍照。2.4 結(jié)果與分析2.4.1 DNA 的提取與檢測(cè)如圖 2-1 所示,提取的稗草基因組 DNA 條帶清晰明亮,極少出現(xiàn)拖尾。用紫外分光光度儀對(duì) DNA 純度進(jìn)行檢測(cè),43 份稗草的 DNA 樣本 A260與 A280的比值最高為 2.1 最低為 1.8,表明所有 DNA 樣品可作為 SSR 擴(kuò)增的模板。
EC_5 5 0 0.00總計(jì) 101 78 -平均 7.77 6 77.232.4.3 43 份稗草的遺傳多樣性分析如表 2-9 所示,用 Popgene 1.32 軟件對(duì) 43 份稗草的遺傳多樣性進(jìn)行分析可知,平均等位基因數(shù)(Na)為 1.7426±0.4394,平均有效等位基因數(shù)(Ne)為1.4846±0.3936,平均 Ne′s 基因多樣性(H)為 0.2626±0.1715,平均 Shannon′s 信息指數(shù)(I)為 0.3891±0.2797。以上結(jié)果表明 43 份稗草的種間遺傳變異較大,黑龍江地區(qū)稗草有著較豐富的遺傳多樣性。表 2-9 遺傳多樣性參數(shù)Table 2-9 Parameters of genetic diversityLous Sample Size Na* Ne* H* I*Mean 43 1.7426 1.4846 0.2626 0.3891St.Dev 0.4394 0.3936 0.1715 0.2797
圖 2-3 引物 EC3 的 SSR-PCR 電泳圖Fig. 2-3 Electrophoresis map of SSR-PCR products amplified with primers EC3注:M 為 DL500 DNAmarker;從左至右 43 份稗草按順序排列Note: M: DL500 DNAmarker; from left to right, 43 pieces of barnyard grass were arranged in order2.4.4 43 份稗草的聚類分析用 NTSYS 2.1e 軟件對(duì) 43 份稗草 SSR 標(biāo)記進(jìn)行統(tǒng)計(jì)后分析,計(jì)算遺傳相似系數(shù)(SM),構(gòu)建基于 SSR 標(biāo)記的 UPGMA 親緣關(guān)系聚類圖(圖 2-4)。由圖 2-4可知,參試稗草的相似系數(shù)為 0.70~0.97。當(dāng)以遺傳相似性系數(shù)為 0.75 作為闕值時(shí),能夠?qū)?43 份稗草分為三大類。第Ⅰ類包括 1 號(hào)、2 號(hào)、15 號(hào)、19 號(hào)、16 號(hào)、27 號(hào)、28 號(hào)、40 號(hào)、30 號(hào)、32號(hào)、32 號(hào)、31 號(hào)、33 號(hào)、6 號(hào)、20 號(hào)、39 號(hào)、13 號(hào)、14 號(hào)、34 號(hào)、41 號(hào)、35號(hào)、9 號(hào)、12 號(hào),共 22 種;第Ⅱ類包括 3 號(hào)、4 號(hào)、5 號(hào)、10 號(hào)、11 號(hào)、6 號(hào)、7號(hào)、8 號(hào),共 8 種;第Ⅲ類包括 17 號(hào)、18 號(hào)、25 號(hào)、29 號(hào)、38 號(hào)、21 號(hào)、22 號(hào)、38 號(hào)、21 號(hào)、22 號(hào)、23 號(hào)、24 號(hào)、26 號(hào)、42 號(hào) 43 號(hào)、37 號(hào),共 13 種。
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