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普羅威登斯屬細(xì)菌的重金屬吸附行為及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析

發(fā)布時(shí)間:2020-11-01 16:21
   目前,隨著我國(guó)工農(nóng)業(yè)化水平的提升,導(dǎo)致重金屬污染土壤更加嚴(yán)重。由于微生物修復(fù)具有無(wú)二次污染、生長(zhǎng)周期短、成本低且治理效果好的優(yōu)勢(shì),因此利用微生物修復(fù)土壤重金屬污染成為研究熱點(diǎn)。本文從湖南省株洲市某冶煉廠周圍重金屬污染土壤中,分離出一株新的耐受Mn(II)的細(xì)菌菌株普羅威登斯菌屬(Providencia sp.)。通過(guò)生物化學(xué)和分子技術(shù)手段證明了LLDRA6菌株具有高M(jìn)n(II)耐受性和生物吸附能力。再通過(guò)多種表征方法和等溫模型研究了菌株對(duì)重金屬的吸附機(jī)理。利用菌株液體對(duì)原始重金屬污染土壤進(jìn)行生物淋洗,以驗(yàn)證菌株在實(shí)際使用中修復(fù)重金屬污染土壤的能力。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和分析,找出其差異表達(dá)的基因,實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)用于驗(yàn)證差異表達(dá)的基因,并鑒定其抗性基因。1、重金屬耐性菌株的篩選與鑒定。從湖南株洲清水塘某冶煉廠周圍重金屬污染區(qū)采集土壤和污泥中,篩選出一株對(duì)Mn(II)具有較高耐受性的細(xì)菌菌株。目的菌株被鑒定為普羅威登斯菌屬,并命名為Providencia sp.LLDRA6。其GenBank登錄號(hào)為MH644827.1。2、目的菌株的生長(zhǎng)曲線及表征。研究了目的菌株的生長(zhǎng)曲線,測(cè)定其最適的pH和最適的生長(zhǎng)溫度分別為7,35℃。同時(shí)詳細(xì)的研究了目的菌株對(duì)六種重金屬的耐受性。結(jié)果顯示Cd~(2+)、Pb~(2+)、Cu~(2+)、Cr~(6+)、Zn~(2+)和Mn~(2+)的最大抗性分別為2、4、4、10、200和500 mM,其中對(duì)Mn~(2+)的抗性最大。SEM-EDS,TEM數(shù)據(jù)證實(shí)菌株對(duì)Mn~(2+)具有表面吸附和胞內(nèi)富集作用,FT-IR數(shù)據(jù)證實(shí),在細(xì)胞表面上吸附錳之后,O-H,C-H,N-H,C-N,O-C-O和C-O的峰發(fā)生位移。XPS和XRD證實(shí)了LLDRA6菌株能夠?qū)n(II)氧化為Mn(III)和Mn(IV)。3、溶液的初始濃度(范圍從25 mM到200 mM),pH和溫度對(duì)Mn(II)的生物吸附的影響。根據(jù)準(zhǔn)二級(jí)動(dòng)力學(xué)和Langmuir等溫線模型,在最優(yōu)條件下定量吸附Mn(II),其生物吸附最大容量為291.438mg/g。菌株吸附熱力學(xué)分析表明,菌株吸附過(guò)程是非自發(fā)的和吸熱的。從生物淋洗獲得的數(shù)據(jù)顯示,土壤中的Pb,Cr,Cd,Cu,Mn和Zn被去除了66.3%、49.1%、56%、62.7%、50.7%和45%。4、菌株的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和分析。結(jié)果表明:菌株基因組大小為4,34Mb,共有3956個(gè)基因,而差異表達(dá)的基因數(shù)量為543個(gè),其中上調(diào)基因257個(gè),下調(diào)基因286個(gè)。并對(duì)這些差異表達(dá)基因進(jìn)行了GO功能注釋和KEGG生物通路分類。從差異基因中精選出24個(gè)顯著差異基因進(jìn)行了RT-qPCR驗(yàn)證,結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果保持一致,證實(shí)了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性。
【學(xué)位單位】:湖南工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:X172;X53;Q933
【部分圖文】:

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主要技術(shù)路線圖

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土壤樣品的采集地點(diǎn)

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A.菌株17QA6DNA提取凝膠電泳結(jié)果,B.PCR產(chǎn)物凝膠電泳結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】

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