本文選題：番茄曲葉病毒 + 番茄褪綠病毒��； 參考：《山東農(nóng)業(yè)大學(xué)》2016年碩士論文

【摘要】：番茄及辣椒都是重要的經(jīng)濟(jì)作物,近年來病毒病的爆發(fā)導(dǎo)致了番茄和辣椒產(chǎn)量減少和品質(zhì)的降低,造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。隨著各種檢測手段的發(fā)展,我們可以更迅速、更便捷的鑒定病毒病的種類,并采取相關(guān)措施挽回經(jīng)濟(jì)損失。本研究以番茄黃花曲葉病毒(Tomato yellow leaf curl virus, TYLCV)、番茄褪綠病毒(Tomato chlorosis virus, ToCV)及辣椒輕斑駁病毒(Pepper mild mottle virus, PMMoV)為對象,用分子檢測方法完成山東、安徽兩省病原的鑒定。我們選取山東、安徽兩個省7個地區(qū),針對3種病毒病進(jìn)行田間調(diào)查,采集疑似樣品擴(kuò)增序列,對其進(jìn)行同源性比對和遺傳進(jìn)化樹等分析,進(jìn)一步了解山東、安徽兩省蔬菜產(chǎn)區(qū)3種病毒病的發(fā)生情況。主要研究結(jié)果如下：1、通過對山東省、安徽省TYLCV發(fā)生情況的調(diào)查及檢測可知,目前TYLCV在山東省大部及安徽省局部已經(jīng)發(fā)生擴(kuò)散。構(gòu)建的TYLCV系統(tǒng)進(jìn)化樹可以分為IL、IR、 Mid、Gez4組,其中本研究的4個分離物和中國所有的分離物一起聚類在IL組。對感病TYLCV樣品進(jìn)行衛(wèi)星DNA的檢測,沒有獲得明顯目的條帶。2、通過RT-PCR檢測及序列分析,首次確定ToCV在安徽地區(qū)發(fā)生,且統(tǒng)計發(fā)現(xiàn)兩省六個地區(qū)ToCV、TYLCV存在單獨侵染及復(fù)合侵染。分別基于ToCV CP和ToCV HSP70構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果發(fā)現(xiàn)ToCV分離物都可分為兩個大組,其中本研究所得到的分離物均與中國其他地區(qū)的分離物聚類到Ⅰ組。通過計算分離物ToCV的CP與HSP70兩個基因的同義突變(dS)和非同義突變(dN)的比率(dN/dS),結(jié)果顯示,CP與HSP70基因均處于負(fù)向(或凈化)選擇的壓力之下且所承受的壓力不同。3、通過對山東濟(jì)寧辣椒的田間調(diào)查發(fā)現(xiàn),PMMoV在辣椒葉片上呈現(xiàn)輕微的褪綠或者斑駁癥狀。對山東濟(jì)寧辣椒病株進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,經(jīng)鑒定,確定其病原為PMMoV,表明感病的濟(jì)寧辣椒樣品確系被PMMoV感染。并與日本分離物(AB062054)、廣西分離物(KP877405)2個序列同源性最高均達(dá)到99.2%。基于CP構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn)濟(jì)寧分離物與中國其他分離物聚類到Ⅰ組,與中國北京分離物(PMMoV-CN)最為相近。
[Abstract]:Tomato and capsicum are important cash crops. In recent years, the outbreak of virus disease has led to the decrease of tomato and pepper yield and quality, resulting in serious economic losses.With the development of various detection methods, we can identify the virus disease more quickly and conveniently, and take relevant measures to recover the economic loss.In this study, Tomato yellow yellow leaf curl virus, TYLCV, Tomato chlorosis virusand Pepper mild mottle virus. were used to identify the pathogens in Shandong and Anhui provinces by molecular detection.We selected 7 regions of Shandong and Anhui provinces to carry out field investigation on three kinds of virus diseases, collected suspected sample amplification sequences, analyzed their homology comparison and genetic evolution tree, and further understood Shandong Province.Occurrence of three kinds of virus diseases in vegetable production areas of two provinces in Anhui Province.The main results are as follows: 1. By investigating the occurrence of TYLCV in Shandong Province and Anhui Province, we can see that TYLCV has spread in most of Shandong Province and Anhui Province at present.The TYLCV phylogenetic tree can be divided into 4 groups, I. e., ILR, Midge, and Gez. The four isolates in this study are clustered together with all the Chinese isolates in the IL group.The detection of susceptible TYLCV samples by satellite DNA showed that there was no obvious target band. By RT-PCR detection and sequence analysis, it was determined for the first time that ToCV occurred in Anhui area, and it was found that there was single infection and compound infection in six regions of two provinces.Phylogenetic tree was constructed based on ToCV CP and ToCV HSP70. The results showed that the ToCV isolates could be divided into two groups.By calculating the ratio of CP and HSP70 gene synonymous mutation (DS) and non-synonymous mutagenesis (DN) of isolate ToCV, the results show that both CP and HSP70 genes are under negative (or purifying) selective pressure and the pressure is different.A field investigation of Jining pepper in Shandong Province showed that PMMoV showed slight chlorotic or mottled symptoms on pepper leaves.The pathogen of Jining pepper was confirmed as PMMoV by RT-PCR amplification, which indicated that the susceptible pepper sample was infected by PMMoV.The highest homology was found between the two isolates, AB062054 and KP877405, respectively, and the highest homology was 99.2% with the Japanese isolate AB062054 and the Guangxi isolate KP877405.The phylogenetic tree constructed based on CP showed that Jining isolates were clustered to group I with other Chinese isolates, which was most similar to PMMoV-CNS isolated from Beijing, China.
【學(xué)位授予單位】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S436.3

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本文編號：1757320