應(yīng)用定量蛋白組學(xué)技術(shù)篩選不同生存期食管癌患者血清差異蛋白
本文關(guān)鍵詞:應(yīng)用定量蛋白組學(xué)技術(shù)篩選不同生存期食管癌患者血清差異蛋白,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:背景 食管癌具有極強(qiáng)的“中國(guó)特色”,仍是我國(guó)與腫瘤相關(guān)死亡的主要原因,呈明顯地域性分布。預(yù)后極差,5年生存率只有15%左右。目前,食管癌臨床預(yù)后評(píng)價(jià)仍以TNM分期為標(biāo)準(zhǔn)。然而,大規(guī)模流行病學(xué)調(diào)查時(shí)發(fā)現(xiàn)一些腫瘤組織分期與預(yù)后不一致的病例,即屬于同一TNM分期患者具有不同的預(yù)后。這些提示,單純使用形態(tài)學(xué)改變作為判斷預(yù)后的指標(biāo)存在一定的局限性。因此,尋找與食管癌預(yù)后相關(guān)預(yù)后評(píng)價(jià)分子指標(biāo)具有重要的理論意義。 目的 篩選與食管癌生存期相關(guān)的差異表達(dá)蛋白,為指導(dǎo)臨床治療和判斷預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)提供參考。 方法 1.收集食管癌患者的術(shù)前血清標(biāo)本及臨床病理資料,并跟蹤隨訪,明確患者術(shù)后生存時(shí)間,隨訪時(shí)間截止到2013年10月。根據(jù)生存期進(jìn)行分組:生存期3年組;3年≤生存期≤5年組;生存期5年組。每組隨機(jī)篩選10例血清樣品,同時(shí)收集正常對(duì)照組血清10例。 2.去除血清中的高豐度蛋白質(zhì),進(jìn)行8標(biāo)同位素相對(duì)和絕對(duì)定量標(biāo)記(iTRAQ),之后聯(lián)合液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)進(jìn)行分析得到多肽片段定量信息。 3.多肽質(zhì)譜分析結(jié)果經(jīng)Mascot2.2軟件查庫(kù)及Proteome Discovererl.3軟件分析,得到蛋白的定性信息以及其在各組的相對(duì)定量。 4.四組樣品進(jìn)行單因素方差分析,采用生物信息學(xué)對(duì)顯著差異表達(dá)蛋白進(jìn)行分類(lèi)注釋。通過(guò)EMBI-EBI蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)獲取詳細(xì)蛋白質(zhì)信息,篩選出與生存期相關(guān)的候選蛋白。 結(jié)果 1.在食管癌不同生存期患者血清中經(jīng)質(zhì)譜分析查庫(kù)搜索共鑒定出556種蛋白,具有明顯表達(dá)差異的蛋白253種(P0.05) 2.鑒定的556種蛋白分別參與18種生物學(xué)過(guò)程:蛋白代謝、刺激反應(yīng)、分子轉(zhuǎn)運(yùn)、細(xì)胞轉(zhuǎn)化等;參與17種細(xì)胞組成,如:細(xì)胞外基質(zhì)、細(xì)胞膜、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞器、細(xì)胞核等;共有14種分子功能,包括蛋白結(jié)合、金屬離子結(jié)合、酶活性調(diào)節(jié)、核苷酸結(jié)合等。 3.以正常對(duì)照組為參照,在食管癌患者血清中有52種蛋白與食管癌生存期呈正相關(guān),如載脂蛋白D、a-2巨球蛋白隨生存期延長(zhǎng)其表達(dá)明顯上調(diào);與生存期呈負(fù)相關(guān)的蛋白有48種,如血管緊張肽原、碳酸酐酶Ⅱ隨生存期延長(zhǎng)其表達(dá)明顯下降。 結(jié)論 本研究提示應(yīng)用iTRAQ技術(shù)尋找食管癌血清腫瘤標(biāo)記物具有較好的應(yīng)用前景,血管緊張肽原、碳酸酐酶Ⅱ、載脂蛋白D、a-2巨球蛋白有可能作為食管癌判斷預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)的生物標(biāo)記。
【關(guān)鍵詞】:食管癌 定量蛋白組學(xué) iTRAQ LC-MS/MS
【學(xué)位授予單位】:新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類(lèi)號(hào)】:R473.73
【目錄】:
- 摘要5-7
- Abstract7-9
- 前言9-10
- 材料與方法10-17
- 結(jié)果17-22
- 討論22-30
- 小結(jié)30
- 今后研究方向30-31
- 參考文獻(xiàn)31-37
- 綜述:iTRAQ技術(shù)在消化系統(tǒng)腫瘤中的應(yīng)用37-48
- 參考文獻(xiàn)44-48
- 附錄48-56
- 攻讀學(xué)位期間發(fā)表文章情況56-57
- 致謝57-58
- 個(gè)人簡(jiǎn)歷58
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
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本文關(guān)鍵詞:應(yīng)用定量蛋白組學(xué)技術(shù)篩選不同生存期食管癌患者血清差異蛋白,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):267457
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