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應用定量蛋白組學技術篩選不同生存期食管癌患者血清差異蛋白

發(fā)布時間:2017-03-25 16:15

  本文關鍵詞:應用定量蛋白組學技術篩選不同生存期食管癌患者血清差異蛋白,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:背景 食管癌具有極強的“中國特色”,仍是我國與腫瘤相關死亡的主要原因,呈明顯地域性分布。預后極差,5年生存率只有15%左右。目前,食管癌臨床預后評價仍以TNM分期為標準。然而,大規(guī)模流行病學調查時發(fā)現(xiàn)一些腫瘤組織分期與預后不一致的病例,即屬于同一TNM分期患者具有不同的預后。這些提示,單純使用形態(tài)學改變作為判斷預后的指標存在一定的局限性。因此,尋找與食管癌預后相關預后評價分子指標具有重要的理論意義。 目的 篩選與食管癌生存期相關的差異表達蛋白,為指導臨床治療和判斷預后風險提供參考。 方法 1.收集食管癌患者的術前血清標本及臨床病理資料,并跟蹤隨訪,明確患者術后生存時間,隨訪時間截止到2013年10月。根據(jù)生存期進行分組:生存期3年組;3年≤生存期≤5年組;生存期5年組。每組隨機篩選10例血清樣品,同時收集正常對照組血清10例。 2.去除血清中的高豐度蛋白質,進行8標同位素相對和絕對定量標記(iTRAQ),之后聯(lián)合液相色譜串聯(lián)質譜(LC-MS/MS)進行分析得到多肽片段定量信息。 3.多肽質譜分析結果經(jīng)Mascot2.2軟件查庫及Proteome Discovererl.3軟件分析,得到蛋白的定性信息以及其在各組的相對定量。 4.四組樣品進行單因素方差分析,采用生物信息學對顯著差異表達蛋白進行分類注釋。通過EMBI-EBI蛋白質數(shù)據(jù)庫獲取詳細蛋白質信息,篩選出與生存期相關的候選蛋白。 結果 1.在食管癌不同生存期患者血清中經(jīng)質譜分析查庫搜索共鑒定出556種蛋白,具有明顯表達差異的蛋白253種(P0.05) 2.鑒定的556種蛋白分別參與18種生物學過程:蛋白代謝、刺激反應、分子轉運、細胞轉化等;參與17種細胞組成,如:細胞外基質、細胞膜、細胞質、細胞器、細胞核等;共有14種分子功能,包括蛋白結合、金屬離子結合、酶活性調節(jié)、核苷酸結合等。 3.以正常對照組為參照,在食管癌患者血清中有52種蛋白與食管癌生存期呈正相關,如載脂蛋白D、a-2巨球蛋白隨生存期延長其表達明顯上調;與生存期呈負相關的蛋白有48種,如血管緊張肽原、碳酸酐酶Ⅱ隨生存期延長其表達明顯下降。 結論 本研究提示應用iTRAQ技術尋找食管癌血清腫瘤標記物具有較好的應用前景,血管緊張肽原、碳酸酐酶Ⅱ、載脂蛋白D、a-2巨球蛋白有可能作為食管癌判斷預后風險的生物標記。
【關鍵詞】:食管癌 定量蛋白組學 iTRAQ LC-MS/MS
【學位授予單位】:新鄉(xiāng)醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R473.73
【目錄】:
  • 摘要5-7
  • Abstract7-9
  • 前言9-10
  • 材料與方法10-17
  • 結果17-22
  • 討論22-30
  • 小結30
  • 今后研究方向30-31
  • 參考文獻31-37
  • 綜述:iTRAQ技術在消化系統(tǒng)腫瘤中的應用37-48
  • 參考文獻44-48
  • 附錄48-56
  • 攻讀學位期間發(fā)表文章情況56-57
  • 致謝57-58
  • 個人簡歷58

【參考文獻】

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本文編號:267457

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