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食源性與醫(yī)源性大腸埃希菌相關性分析

發(fā)布時間:2018-12-12 03:09
【摘要】:目的:1.采集本地區(qū)食品,評估其大腸埃希菌污染情況。2.了解本地區(qū)食源性和醫(yī)源性大腸埃希菌中致腹瀉大腸埃希菌的分布情況。3.根據(jù)相關毒力基因的檢測,了解兩種來源大腸埃希菌中腸外致病性大腸埃希菌的分布情況。4.應用PFGE方法比較兩種來源腸外致病性大腸埃希菌相似性,初步建立本地區(qū)腸外致病性大腸埃希菌PFGE數(shù)據(jù)庫。方法:1.參照GB4789.38-2012方法采集、檢測本地區(qū)5所超市市售生鮮、蔬菜等共128份;參照《全國臨床檢驗操作規(guī)程》相關方法,收集本地區(qū)醫(yī)源性大腸埃希菌86株。2.應用玻片凝集法鑒定食源性和醫(yī)源性大腸埃希菌的致腹瀉大腸埃希菌血清型;應用PCR法檢測腸外致病大腸埃希菌特征性毒力基因,鑒定食源性和醫(yī)源性菌株中的腸外致病大腸埃希菌。3.參照Pulse Net推薦方法建立腸外致病性大腸埃希菌PFGE分子分型圖譜,初步建立本地區(qū)腸外致病性大腸埃希菌PFGE數(shù)據(jù)庫。結果:1.在128份食品樣品中,共40份樣品檢出大腸埃希菌,檢出率31.3%,以肉類和豆制品為主。2.經血清學鑒定,共檢出致腹瀉大腸埃希菌17株:食源性菌株檢出腸侵襲型大腸埃希菌6株、腸毒素型大腸埃希菌3株、腸致病性大腸埃希菌1株;醫(yī)源性菌株檢出腸侵襲型大腸埃希菌1株、腸毒素型大腸埃希菌2株、腸致病性大腸埃希菌4株。3.經PCR技術鑒定出腸外致病性大腸埃希菌42株,其中食源性菌株4株,醫(yī)源性菌株38株。4.應用PFGE方法對食源性和醫(yī)源性共42株腸外致病性大腸埃希菌進行分子分型,根據(jù)電泳產生的條帶的位置和數(shù)量的不同,應用Quantity One軟件對電泳圖譜進行相似度分析,相似值在19%-95%。結論:1.本地區(qū)部分食品均不同程度受到大腸埃希菌的污染。2.致腹瀉大腸埃希菌污染了本地區(qū)食品,也導致了本地區(qū)患者腸道外不同組織、器官的感染,推測食品可能存在致腹瀉大腸埃希菌致腸道外疾病的潛在風險。3.根據(jù)毒力基因的檢測結果,食品與病患樣本中存在腸外致病性大腸埃希菌菌株,推測食品也可能是腸外致病性大腸埃希菌致病的傳播媒介。4.應用PFGE技術對42株腸外致病性大腸埃希菌分子分型后相似度分析發(fā)現(xiàn),食源性菌株與醫(yī)源性菌株表現(xiàn)出較大的遺傳多樣性且存在相關性。運用該方法初步建立了本地腸外致病性大腸埃希菌的PFGE數(shù)據(jù)庫,為今后該類細菌的公共衛(wèi)生學調查提供了依據(jù)。
[Abstract]:Objective: 1. Collect the food in our area and evaluate the contamination of Escherichia coli. 2. To understand the distribution of Escherichia coli caused by diarrhea in this area. 3. 3. According to the detection of virulence genes, the distribution of two kinds of Escherichia coli was studied. 4. The PFGE method was used to compare the similarity of two kinds of Escherichia coli from different sources, and the PFGE database of Escherichia coli was preliminarily established in this area. Methods: 1. Referring to the GB4789.38-2012 method, 128 fresh and vegetable samples were collected from 5 supermarkets in this area, and 86 strains of iatrogenic Escherichia coli were collected according to the relevant methods of the National procedure for Clinical examination. The serotypes of Escherichia coli caused by food and iatrogenic Escherichia coli were identified by slide agglutination. PCR method was used to detect the characteristic virulence genes of Escherichia coli and to identify the pathogenic Escherichia coli in food and iatrogenic strains. 3. According to the method recommended by Pulse Net, the PFGE molecular typing map of Escherichia coli was established, and the PFGE database of Escherichia coli in this area was preliminarily established. Results: 1. Escherichia coli was detected in 40 out of 128 food samples, and the detection rate was 31.3%, mainly in meat and soybean products. A total of 17 strains of Escherichia coli were identified by serology: 6 strains of enteroinvasive Escherichia coli, 3 strains of enterotoxin Escherichia coli and 1 strain of enteropathogenic Escherichia coli. One strain of enteroinvasive Escherichia coli, 2 strains of enterotoxin type Escherichia coli and 4 strains of enteropathogenic Escherichia coli were identified by iatrogenic strains. 42 strains of Escherichia coli were identified by PCR, including 4 foodborne strains and 38 iatrogenic strains. A total of 42 strains of Escherichia coli from food and iatrogenic were classified by PFGE. According to the location and quantity of the bands produced by electrophoresis, the similarity of the electrophoretic patterns was analyzed by Quantity One software. The similarity is between 19 and 95. Conclusion: 1. Some foods in this area were contaminated by Escherichia coli to varying degrees. 2. 2. Diarrhea caused by Escherichia coli contamination of food in the region, but also caused by patients in the region outside the intestinal tissue, organ infection, food may have the potential risk of diarrhoeal Escherichia coli caused extraintestinal diseases. 3. According to the detection results of virulence genes, there is a pathogenic Escherichia coli strain in food and patient samples, and it is speculated that food may also be the transmission vector of pathogenic Escherichia coli. 4. The similarity analysis of 42 strains of Escherichia coli by PFGE showed that there were significant genetic diversity and correlation between foodborne strains and iatrogenic strains. Using this method, the PFGE database of local Escherichia coli was established, which provided the basis for the public health investigation of this kind of bacteria in the future.
【學位授予單位】:貴陽醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R446.5

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5 吳

本文編號:2373787


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