皮氏羅爾斯頓菌鑒定藥物敏感性及多位點(diǎn)序列分型分析
發(fā)布時(shí)間:2018-01-22 11:29
本文關(guān)鍵詞: 羅爾斯頓菌屬 細(xì)菌鑒定 藥物敏感實(shí)驗(yàn) 多位點(diǎn)基因序列研究 出處:《中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院》2015年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:1、目的:(1)建立基于PCR的細(xì)菌鑒定方法,為準(zhǔn)確鑒定羅爾斯頓菌提供新的方法。(2)測(cè)定菌株的藥物敏感性,了解其耐藥表型,為臨床合理應(yīng)用抗生素提供依據(jù)。(3)選擇利用6個(gè)基因位點(diǎn)進(jìn)行分析,初步建立羅爾斯頓菌屬細(xì)菌的MLST體系,為其分型分析提供參考。(4)國(guó)內(nèi)首次報(bào)道一例羅爾斯頓菌屬中危險(xiǎn)羅爾斯頓菌所致感染的病例。2、方法:(1)收集2008年1月至2013年12月我院經(jīng)VITEK 2細(xì)菌鑒定系統(tǒng)鑒定為皮氏羅爾斯頓菌的非重復(fù)菌株48株,以細(xì)菌特異PCR實(shí)驗(yàn)進(jìn)行重新鑒定,并以16S rDNA鑒定結(jié)果為標(biāo)準(zhǔn),比較三者差異。(2)分別以K-B法及MIC法測(cè)定菌株的藥物敏感性,并通過(guò)Carba NP法檢測(cè)菌株中碳?xì)涿瓜┟浮?3)通過(guò)測(cè)定菌株6個(gè)基因位點(diǎn)各片段的核苷酸序列,對(duì)菌株進(jìn)行多位點(diǎn)序列分型分析。(4)回顧性分析1例危險(xiǎn)羅爾斯頓菌所致感染患者的臨床資料及病原學(xué)資料。3、結(jié)果:(1)經(jīng)VITEK 2細(xì)菌鑒定系統(tǒng)鑒定,48株細(xì)菌均為皮氏羅爾斯頓菌;經(jīng)細(xì)菌特異PCR實(shí)驗(yàn)鑒定,上述48株細(xì)菌中,1株危險(xiǎn)羅爾斯頓菌,8株解甘露醇羅爾斯頓菌,30株皮氏羅爾斯頓茵;經(jīng)16S rDNA鑒定,上述48株細(xì)菌中,1株危險(xiǎn)羅爾斯頓菌,7株解甘露醇羅爾斯頓菌,34株皮氏羅爾斯頓菌,1株木糖氧化無(wú)色桿菌,2株洋蔥伯克霍爾德菌,3株嗜麥芽寡養(yǎng)單胞菌。(2)皮氏羅爾斯頓菌對(duì)β-內(nèi)酰胺類/β-內(nèi)酰胺酶、左氧氟沙星、米諾環(huán)素、甲氧芐氨嘧啶/磺胺甲嗯唑等抗生素敏感性較高,對(duì)氨曲南、美羅培南、氨基糖甙類、多粘菌素B、呋喃妥因等抗生素的耐藥率較高。解甘露醇羅爾斯頓菌一般對(duì)氨曲南、氨基糖甙類、多粘菌素B等高度耐藥,對(duì)環(huán)丙沙星、左氧氟沙星、甲氧芐氨嘧啶/磺胺甲嗯唑等一般均敏感,Carpa NP實(shí)驗(yàn)檢測(cè)菌株中碳?xì)涿赶┟附Y(jié)果為陰性。(3)MLST分析顯示我院42株羅爾斯頓菌共包含18個(gè)ST序列型,其中ST9序列型最多,共22株,為優(yōu)勢(shì)型別,其次為ST2型和ST4型各2株,其余ST型均僅1株。UPGMA法進(jìn)行聚類分析顯示42株羅爾斯頓菌屬細(xì)菌共分為2個(gè)群(A和B)和18個(gè)基因型,A群含8個(gè)基因型,共10株菌,其中4株經(jīng)16SrDNA鑒定為皮氏羅爾斯頓菌,6株為解甘露醇羅爾斯頓菌,B群含10個(gè)基因型,共32株菌,其中1株為解甘露醇羅爾斯頓菌,1株為危險(xiǎn)羅爾斯頓菌,余均為皮氏羅爾斯頓菌。(4)一名93歲女性患者痰標(biāo)本中發(fā)現(xiàn)危險(xiǎn)羅爾斯頓菌,初始被錯(cuò)誤鑒定為皮氏羅爾斯頓菌,藥敏提示菌株對(duì)β-內(nèi)酰胺類/β-內(nèi)酰胺酶、部分頭孢類類、喹諾酮類以及磺胺類敏感性較好,對(duì)氨曲南、呋喃要因、多粘菌素B以及氨基糖甙類抗生素耐藥,經(jīng)頭孢他啶、環(huán)丙沙星抗感染治療后好轉(zhuǎn)。4、結(jié)論:(1)利用細(xì)菌特異PCR實(shí)驗(yàn)來(lái)鑒定羅爾斯頓菌屬中的臨床致病菌簡(jiǎn)便、快捷、準(zhǔn)確度和特異度較高。(2)皮氏羅爾斯頓菌菌株對(duì)β-內(nèi)酰胺類/β-內(nèi)酰胺酶抑制劑、左氧氟沙星、米諾環(huán)素、甲氧芐氨嘧射磺胺甲嗯唑等抗生素敏感性較高。解甘露醇羅爾斯頓菌菌株對(duì)對(duì)環(huán)丙沙星、左氧氟沙星、甲氧芐氨嘧對(duì)磺胺甲嗯唑等一般均敏感;羅爾斯頓菌株中可能存在碳?xì)涿赶┟竿獾钠渌麢C(jī)制介導(dǎo)耐碳青霉烯類抗生素菌株的耐藥性。(3)利用atpD、gltB、gyrB、lepA、phaC、recA6個(gè)基因位點(diǎn)可初步對(duì)羅爾斯頓菌屬細(xì)菌進(jìn)行多位點(diǎn)序列分型研究。(4)臨床危險(xiǎn)羅爾斯頓菌所引起的感染較少見,臨床癥狀無(wú)特異性,確診依賴于微生物學(xué)的準(zhǔn)確鑒定,治療可結(jié)合藥敏實(shí)驗(yàn)結(jié)果來(lái)選擇敏感抗生素。
[Abstract]:1 . Objective : ( 1 ) To establish a PCR - based method of bacterial identification to provide a new method for the accurate identification of Ralstonia . ( 4 ) A retrospective analysis of the clinical data and pathogenic information of 1 case of patients with infection caused by dangerous Ralstonia . The results were as follows : ( 1 ) The results were as follows : ( 1 ) The 48 strains were identified by VITEK 2 bacteria identification system . ( 3 ) The results showed that 42 strains of Ralstonia were divided into 2 groups ( A and B ) and 18 genotypes . ( 3 ) Using atpD , gltB , gyrB , lepA , phaC and recA6 gene loci , we can carry out a multi - site sequence typing on the bacteria of the genus Ralstonia .
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R446.5
【共引文獻(xiàn)】
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1 Mingjun Li;Li Nan;Dake Xu;Guogang Ren;Ke Yang;;Antibacterial Performance of a Cu-bearing Stainless Steel against Microorganisms in Tap Water[J];Journal of Materials Science & Technology;2015年03期
2 Tsz Wai Ng;Guocheng Huang;Po Keung Wong;;Investigation of drinking water bacterial community through high-throughput sequencing[J];Journal of Environmental Sciences;2015年11期
,本文編號(hào):1454541
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