本文關鍵詞：基于XML的種豬遺傳評估系統(tǒng)的應用研究

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【摘要】：養(yǎng)豬業(yè)在畜牧業(yè)中占據(jù)著核心地位,豬肉是肉食品中蛋白質的主要來源,養(yǎng)豬業(yè)的生產效益影響著整個國家畜牧業(yè)的經濟效益乃至人民的生活水平。隨著飼料、人工、防疫和物流成本的提高,養(yǎng)豬業(yè)已經進入高投入、高成本、高風險、微利的發(fā)展時期,有效提高養(yǎng)豬業(yè)的產量和豬的質量成為科研人員的一個重要研究課題。目前世界上養(yǎng)豬業(yè)發(fā)達的國家都在大力發(fā)展遺傳育種技術,通過改良豬的遺傳基因,持續(xù)地選擇出優(yōu)良的遺傳個體繁殖后代,從而提高養(yǎng)豬業(yè)的生產效益。與其他遺傳育種方法相比,Henderson提出的BLUP法能夠充分利用候選個體及父母、同胞、后代等所有親屬信息,顯著提高種豬遺傳育種進展。現(xiàn)有的大多數(shù)種豬遺傳評估系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫基于關系模式,但關系模式在養(yǎng)豬管理存在如下不足之處:(1)每頭豬的管理內容整齊劃一,難以滿足個體精細化管理;(2)基于數(shù)據(jù)表結構的操作,一頭豬的有關數(shù)據(jù)分布在不同的數(shù)據(jù)表中,訪問某頭豬的數(shù)據(jù)需要通過多重連接,嚴重影響了數(shù)據(jù)操作的效率。隨著互聯(lián)網的快速發(fā)展,XML廣泛應用于數(shù)據(jù)交換、電子商務交易和Internet信息傳輸?shù)阮I域,已成為Web上信息表示和數(shù)據(jù)交換的一個重要標準。與傳統(tǒng)關系數(shù)據(jù)庫相比,XML的簡易性、靈活性和自我描述性使其易于在任何應用程序中讀寫數(shù)據(jù),更適合于半結構化數(shù)據(jù)的存取。本研究對基于關系模式的種豬遺傳評估系統(tǒng)進行分析,針對關系模式在種豬數(shù)據(jù)管理方面的不足之處,提出了采用XML文檔取代關系數(shù)據(jù)庫的方案。一個XML文檔集中保存一頭豬從出生至死亡的所有數(shù)據(jù),通過外部DTD定義XML文檔結構的規(guī)則,同時引入樹形種豬譜系,設計出基于XML的種豬遺傳評估系統(tǒng)。通過設計XML文檔集的樹形目錄管理,并且構建標志號生成器生成唯一的標志號作為XML文檔的文件名,加快在XML文檔集的索引速度。并且向XML文檔中引入種豬譜系信息,在使用BLUP方法計算種豬遺傳育種估計值過程中,利用樹形譜系能夠加快數(shù)據(jù)提取速度和改進分子血緣相關矩陣的計算方法。本研究根據(jù)用戶的需求,采用B/S開發(fā)模式與XML技術,結合MVC三層架構思想,開發(fā)出基于XML的種豬遺傳評估系統(tǒng),實現(xiàn)種豬信息管理、譜系查詢、親緣關系查詢、數(shù)據(jù)傳輸、遺傳評估等基本功能。本研究主要通過采用XML文檔集管理種豬數(shù)據(jù),簡化管理員管理數(shù)據(jù)難度,實現(xiàn)個體精細化管理以及提高育種計算效率。
【關鍵詞】：XML文檔 遺傳評估 種豬管理 親緣關系 種豬譜系
【學位授予單位】：華南農業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：TP311.52
【目錄】：

• 摘要3-4
• Abstract4-9
• 1 緒論9-14
• 1.1 研究背景和意義9-10
• 1.2 國內外相關研究10-12
• 1.2.1 國外相關研究10-11
• 1.2.2 國內相關研究11-12
• 1.3 主要研究內容12-13
• 1.4 章節(jié)安排13-14
• 2 種豬遺傳育種相關研究14-25
• 2.1 遺傳育種理論14-20
• 2.1.1 遺傳評估方法14
• 2.1.2 動物模型BLUP14-15
• 2.1.3 方差組分估計15-17
• 2.1.4 分子血緣相關矩陣17-19
• 2.1.5 近交系數(shù)19-20
• 2.2 種豬數(shù)據(jù)管理20-24
• 2.2.1 種豬數(shù)據(jù)管理模式20-21
• 2.2.2 關系數(shù)據(jù)庫21-23
• 2.2.3 關系數(shù)據(jù)庫在養(yǎng)豬應用及其不足之處23-24
• 2.3 本章小結24-25
• 3 系統(tǒng)關鍵技術研究25-36
• 3.1 XML技術25-30
• 3.1.1 XML25
• 3.1.2 XML文檔結構25-26
• 3.1.3 XML文檔驗證26-27
• 3.1.4 XML解析27-29
• 3.1.5 XML的優(yōu)勢29-30
• 3.2 XML在種豬管理的應用30-31
• 3.3 Web開發(fā)技術31-35
• 3.3.1 Java EE應用31-32
• 3.3.2 MVC模式32-34
• 3.3.3 Web技術在本系統(tǒng)中的應用34-35
• 3.4 本章小結35-36
• 4 基于XML的種豬遺傳評估系統(tǒng)的分析與設計36-54
• 4.1 系統(tǒng)需求分析36-39
• 4.1.1 業(yè)務需求36
• 4.1.2 用戶需求36-37
• 4.1.3 開發(fā)規(guī)程37-38
• 4.1.4 系統(tǒng)性能需求38
• 4.1.5 系統(tǒng)功能需求38-39
• 4.2 系統(tǒng)總框架設計39-42
• 4.2.1 系統(tǒng)架構分析39-40
• 4.2.2 系統(tǒng)架構設計40-41
• 4.2.3 系統(tǒng)特點41-42
• 4.3 系統(tǒng)功能設計42-43
• 4.4 數(shù)據(jù)庫設計43-50
• 4.4.1 XML文檔集管理43-44
• 4.4.2 數(shù)據(jù)庫概念設計44-46
• 4.4.3 DTD設計46-47
• 4.4.4 XML文檔標志號47-48
• 4.4.5 XML文檔設計48-49
• 4.4.6 XML譜系設計49-50
• 4.5 在遺傳育種方面應用XML50-53
• 4.5.1 動物模型BLUP法計算過程50-51
• 4.5.2 基于XML改進的數(shù)據(jù)提取51-52
• 4.5.3 基于XML改進的分子血緣相關矩陣求法52-53
• 4.6 本章小結53-54
• 5 基于XML的種豬遺傳評估系統(tǒng)的實現(xiàn)54-62
• 5.1 系統(tǒng)環(huán)境54
• 5.2 系統(tǒng)功能實現(xiàn)54-59
• 5.2.1 系統(tǒng)管理模塊54
• 5.2.2 種豬管理模塊54-57
• 5.2.3 遺傳育種模塊57-59
• 5.2.4 XML文檔實現(xiàn)59
• 5.3 系統(tǒng)測試59-61
• 5.4 本章小結61-62
• 6 結論62-64
• 6.1 總結62-63
• 6.2 展望63-64
• 致謝64-65
• 參考文獻65-69
• 附錄69
• 附錄A 參加研究項目69
• 附錄B 攻讀學位期間研究成果69

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 張勤;丁向東;陳瑤生;;種豬遺傳評估技術研發(fā)與評估系統(tǒng)應用[J];中國畜牧雜志;2015年08期

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本文編號：682681