本文關(guān)鍵詞：基于XML的種豬遺傳評(píng)估系統(tǒng)的應(yīng)用研究

  更多相關(guān)文章： XML文檔 遺傳評(píng)估 種豬管理 親緣關(guān)系 種豬譜系

【摘要】：養(yǎng)豬業(yè)在畜牧業(yè)中占據(jù)著核心地位,豬肉是肉食品中蛋白質(zhì)的主要來源,養(yǎng)豬業(yè)的生產(chǎn)效益影響著整個(gè)國家畜牧業(yè)的經(jīng)濟(jì)效益乃至人民的生活水平。隨著飼料、人工、防疫和物流成本的提高,養(yǎng)豬業(yè)已經(jīng)進(jìn)入高投入、高成本、高風(fēng)險(xiǎn)、微利的發(fā)展時(shí)期,有效提高養(yǎng)豬業(yè)的產(chǎn)量和豬的質(zhì)量成為科研人員的一個(gè)重要研究課題。目前世界上養(yǎng)豬業(yè)發(fā)達(dá)的國家都在大力發(fā)展遺傳育種技術(shù),通過改良豬的遺傳基因,持續(xù)地選擇出優(yōu)良的遺傳個(gè)體繁殖后代,從而提高養(yǎng)豬業(yè)的生產(chǎn)效益。與其他遺傳育種方法相比,Henderson提出的BLUP法能夠充分利用候選個(gè)體及父母、同胞、后代等所有親屬信息,顯著提高種豬遺傳育種進(jìn)展�，F(xiàn)有的大多數(shù)種豬遺傳評(píng)估系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫基于關(guān)系模式,但關(guān)系模式在養(yǎng)豬管理存在如下不足之處:(1)每頭豬的管理內(nèi)容整齊劃一,難以滿足個(gè)體精細(xì)化管理;(2)基于數(shù)據(jù)表結(jié)構(gòu)的操作,一頭豬的有關(guān)數(shù)據(jù)分布在不同的數(shù)據(jù)表中,訪問某頭豬的數(shù)據(jù)需要通過多重連接,嚴(yán)重影響了數(shù)據(jù)操作的效率。隨著互聯(lián)網(wǎng)的快速發(fā)展,XML廣泛應(yīng)用于數(shù)據(jù)交換、電子商務(wù)交易和Internet信息傳輸?shù)阮I(lǐng)域,已成為Web上信息表示和數(shù)據(jù)交換的一個(gè)重要標(biāo)準(zhǔn)。與傳統(tǒng)關(guān)系數(shù)據(jù)庫相比,XML的簡(jiǎn)易性、靈活性和自我描述性使其易于在任何應(yīng)用程序中讀寫數(shù)據(jù),更適合于半結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的存取。本研究對(duì)基于關(guān)系模式的種豬遺傳評(píng)估系統(tǒng)進(jìn)行分析,針對(duì)關(guān)系模式在種豬數(shù)據(jù)管理方面的不足之處,提出了采用XML文檔取代關(guān)系數(shù)據(jù)庫的方案。一個(gè)XML文檔集中保存一頭豬從出生至死亡的所有數(shù)據(jù),通過外部DTD定義XML文檔結(jié)構(gòu)的規(guī)則,同時(shí)引入樹形種豬譜系,設(shè)計(jì)出基于XML的種豬遺傳評(píng)估系統(tǒng)。通過設(shè)計(jì)XML文檔集的樹形目錄管理,并且構(gòu)建標(biāo)志號(hào)生成器生成唯一的標(biāo)志號(hào)作為XML文檔的文件名,加快在XML文檔集的索引速度。并且向XML文檔中引入種豬譜系信息,在使用BLUP方法計(jì)算種豬遺傳育種估計(jì)值過程中,利用樹形譜系能夠加快數(shù)據(jù)提取速度和改進(jìn)分子血緣相關(guān)矩陣的計(jì)算方法。本研究根據(jù)用戶的需求,采用B/S開發(fā)模式與XML技術(shù),結(jié)合MVC三層架構(gòu)思想,開發(fā)出基于XML的種豬遺傳評(píng)估系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)種豬信息管理、譜系查詢、親緣關(guān)系查詢、數(shù)據(jù)傳輸、遺傳評(píng)估等基本功能。本研究主要通過采用XML文檔集管理種豬數(shù)據(jù),簡(jiǎn)化管理員管理數(shù)據(jù)難度,實(shí)現(xiàn)個(gè)體精細(xì)化管理以及提高育種計(jì)算效率。
【關(guān)鍵詞】：XML文檔 遺傳評(píng)估 種豬管理 親緣關(guān)系 種豬譜系
【學(xué)位授予單位】：華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：TP311.52
【目錄】：

• 摘要3-4
• Abstract4-9
• 1 緒論9-14
• 1.1 研究背景和意義9-10
• 1.2 國內(nèi)外相關(guān)研究10-12
• 1.2.1 國外相關(guān)研究10-11
• 1.2.2 國內(nèi)相關(guān)研究11-12
• 1.3 主要研究?jī)?nèi)容12-13
• 1.4 章節(jié)安排13-14
• 2 種豬遺傳育種相關(guān)研究14-25
• 2.1 遺傳育種理論14-20
• 2.1.1 遺傳評(píng)估方法14
• 2.1.2 動(dòng)物模型BLUP14-15
• 2.1.3 方差組分估計(jì)15-17
• 2.1.4 分子血緣相關(guān)矩陣17-19
• 2.1.5 近交系數(shù)19-20
• 2.2 種豬數(shù)據(jù)管理20-24
• 2.2.1 種豬數(shù)據(jù)管理模式20-21
• 2.2.2 關(guān)系數(shù)據(jù)庫21-23
• 2.2.3 關(guān)系數(shù)據(jù)庫在養(yǎng)豬應(yīng)用及其不足之處23-24
• 2.3 本章小結(jié)24-25
• 3 系統(tǒng)關(guān)鍵技術(shù)研究25-36
• 3.1 XML技術(shù)25-30
• 3.1.1 XML25
• 3.1.2 XML文檔結(jié)構(gòu)25-26
• 3.1.3 XML文檔驗(yàn)證26-27
• 3.1.4 XML解析27-29
• 3.1.5 XML的優(yōu)勢(shì)29-30
• 3.2 XML在種豬管理的應(yīng)用30-31
• 3.3 Web開發(fā)技術(shù)31-35
• 3.3.1 Java EE應(yīng)用31-32
• 3.3.2 MVC模式32-34
• 3.3.3 Web技術(shù)在本系統(tǒng)中的應(yīng)用34-35
• 3.4 本章小結(jié)35-36
• 4 基于XML的種豬遺傳評(píng)估系統(tǒng)的分析與設(shè)計(jì)36-54
• 4.1 系統(tǒng)需求分析36-39
• 4.1.1 業(yè)務(wù)需求36
• 4.1.2 用戶需求36-37
• 4.1.3 開發(fā)規(guī)程37-38
• 4.1.4 系統(tǒng)性能需求38
• 4.1.5 系統(tǒng)功能需求38-39
• 4.2 系統(tǒng)總框架設(shè)計(jì)39-42
• 4.2.1 系統(tǒng)架構(gòu)分析39-40
• 4.2.2 系統(tǒng)架構(gòu)設(shè)計(jì)40-41
• 4.2.3 系統(tǒng)特點(diǎn)41-42
• 4.3 系統(tǒng)功能設(shè)計(jì)42-43
• 4.4 數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)43-50
• 4.4.1 XML文檔集管理43-44
• 4.4.2 數(shù)據(jù)庫概念設(shè)計(jì)44-46
• 4.4.3 DTD設(shè)計(jì)46-47
• 4.4.4 XML文檔標(biāo)志號(hào)47-48
• 4.4.5 XML文檔設(shè)計(jì)48-49
• 4.4.6 XML譜系設(shè)計(jì)49-50
• 4.5 在遺傳育種方面應(yīng)用XML50-53
• 4.5.1 動(dòng)物模型BLUP法計(jì)算過程50-51
• 4.5.2 基于XML改進(jìn)的數(shù)據(jù)提取51-52
• 4.5.3 基于XML改進(jìn)的分子血緣相關(guān)矩陣求法52-53
• 4.6 本章小結(jié)53-54
• 5 基于XML的種豬遺傳評(píng)估系統(tǒng)的實(shí)現(xiàn)54-62
• 5.1 系統(tǒng)環(huán)境54
• 5.2 系統(tǒng)功能實(shí)現(xiàn)54-59
• 5.2.1 系統(tǒng)管理模塊54
• 5.2.2 種豬管理模塊54-57
• 5.2.3 遺傳育種模塊57-59
• 5.2.4 XML文檔實(shí)現(xiàn)59
• 5.3 系統(tǒng)測(cè)試59-61
• 5.4 本章小結(jié)61-62
• 6 結(jié)論62-64
• 6.1 總結(jié)62-63
• 6.2 展望63-64
• 致謝64-65
• 參考文獻(xiàn)65-69
• 附錄69
• 附錄A 參加研究項(xiàng)目69
• 附錄B 攻讀學(xué)位期間研究成果69

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

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4 葉小平;湯庸;張智博;陳釗瀅;林衍崇;;語義協(xié)同時(shí)態(tài)XML索引研究與實(shí)現(xiàn)[J];計(jì)算機(jī)學(xué)報(bào);2014年09期

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本文編號(hào)：682681