在過去的20年里,對(duì)基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)的分析一直以來是統(tǒng)計(jì)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、生物信息學(xué)相互交叉的重要研究方向之一。對(duì)基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析可以揭示基因組信息與表型之間的聯(lián)系,隨著高通量技術(shù)的進(jìn)一步發(fā)展,測量樣品中全部mRNA表達(dá)水平的成本越來越低,使得基因表達(dá)譜技術(shù)的應(yīng)用也越來越廣泛,由此,微陣列實(shí)驗(yàn)得到了大量的數(shù)據(jù)集,對(duì)基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)選擇合適的統(tǒng)計(jì)方法已經(jīng)成為一個(gè)相當(dāng)重要的課題。帕金森病是一種由黑質(zhì)中多巴胺能神經(jīng)元死亡引起的神經(jīng)退行性疾病,而胃癌是一種常見的癌癥,是由細(xì)胞異常生長引起的,也就是說,帕金森病具有細(xì)胞死亡的特點(diǎn),胃癌具有細(xì)胞增殖的特點(diǎn),因此帕金森病和胃癌是兩種截然不同的疾病。一項(xiàng)流行病學(xué)研究表明,帕金森病患者患胃癌的風(fēng)險(xiǎn)相對(duì)較低。本文旨在從兩個(gè)不同分析角度對(duì)基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析,以探討胃癌和帕金森病之間的關(guān)系。本文基于兩個(gè)不同的分析角度,首先,對(duì)胃癌和帕金森病基因表達(dá)譜進(jìn)行基因差異表達(dá)分析（使用limma包提供的穩(wěn)健t檢驗(yàn)）,其次對(duì)胃癌和帕金森病基因表達(dá)譜進(jìn)行加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（WGCNA）。前者是單基因分析方法,對(duì)數(shù)據(jù)集中的每個(gè)基因逐個(gè)進(jìn)行檢驗(yàn),后者是一種系統(tǒng)生物學(xué)... 

【文章來源】：吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

WGCNA分析一般流程

檢驗(yàn)m個(gè)假設(shè)的可能結(jié)果

ORA分析[52]

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[2]Mitogen-activated protein kinase signaling pathway and invasion and metastasis of gastric cancer[J]. Mei Yang,Chang-Zhi Huang.  World Journal of Gastroenterology. 2015(41)



本文編號(hào)：3313446