黑鸛(Ciconia nigra)是一種分布廣泛、體態(tài)優(yōu)美的大型遷徙性涉禽,我國僅有1000只左右,是重要的瀕危物種。目前我國動(dòng)物園中已經(jīng)建立了穩(wěn)定的人工飼養(yǎng)種群,成為這一個(gè)物種的活體基因庫。為了更好的對人工飼養(yǎng)的黑鸛種群進(jìn)行管理,本文從線粒體D-Loop區(qū)和微衛(wèi)星兩個(gè)方面對黑鸛種群的遺傳多樣性進(jìn)行探究。黑鸛雌雄同型,形態(tài)學(xué)難以進(jìn)行性別的區(qū)分,利用分子手段對黑鸛的性別進(jìn)行鑒定。分別取用CHD基因的 1對引物CHD-1F/CHD-1R和EE0.6的2對引物AWS05/NRD4和SINT-F/SINT-R來鑒定,兩組引物的鑒定結(jié)果相同,鑒定結(jié)果顯示該種群的性別比例為1:1。在對黑鸛種群的D-Loop區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增時(shí),發(fā)現(xiàn)該種群存在核拷貝現(xiàn)象,拷貝的片段長度在3400-4200bp之間,這種插入屬于中性突變,無不良影響。對D-Loop區(qū)的序列進(jìn)行分析,共得到10個(gè)單倍型,23個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),單倍型多樣性(Hd)為0.768,核苷酸多樣性(π)為0.00744,平均核苷酸差異數(shù)(k)為4.504,說明該種群中的個(gè)體存在著嚴(yán)重的單倍型分布不均衡的現(xiàn)象。中性檢驗(yàn)的結(jié)果顯示,該種群存在著不顯著的負(fù)選擇的壓...

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１黑鸛地理分布圖（來自世界自然保護(hù)聯(lián)盟瀕危物種紅色名錄）??Ｆｉｇｕｒｅ?１－１?Ｇｅｏｇｒａｐｈｉｃａｌ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｂｌａｃｋ?ｓｔｏｒｋ??（ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ．ｉｕｃｎｒｅｄｌｉｓｔ．Ｏｒｇ／ｓｐｅｃｉｅｓ／２２６９７６６９／ｌ?１１７４７８５７?）??

黑鸛種群的分布十分廣泛，亞歐非均有其分布的記載［１８］。國外黑鸛在北半球的繁殖??區(qū)域大致在Ｎ４０°￣６０°的古北界，國內(nèi)主要在東北、華北和新疆等地［Ｕ８，２７］，分布情況如??圖１－１。黑鸛種群大部分集中在歐洲，占全球黑鸛總數(shù)的６７％，據(jù)估計(jì)東歐有??６６００？９７００個(gè)繁殖對....

圖1一哺乳動(dòng)物、魚類、兩棲類線粒體D-助叩區(qū)位置

圖１－３鳥類線粒體Ｄ－Ｌ〇〇Ｐ區(qū)位置??Ｆｉｇｕｒｅ?１－３?Ｔｈｅ?ｌｏｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｄ－Ｌｏｏｐ?ｏｎ?ｔｈｅ?ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ?ｇｅｎｏｍｅ?ｏｆ?ｂｉｒｄｓ??１．３．１線粒體ＤＮＡ標(biāo)記在鳥類中的應(yīng)用??與核ＤＮＡ相比，ｍｔＤＮＡ的結(jié)構(gòu)簡單、提取容易、進(jìn)化....

圖３－１部分樣品中提取的總ＤＮＡ的電泳圖??Ｍ：?５Ｋ?ＤＮＡ?Ｍａｒｋｅｒ；?１￣７為７份隨機(jī)抽取樣品的總ＤＮＡ??

樣品是陸續(xù)采集的，從采集到開展實(shí)驗(yàn)之間時(shí)間跨度最長接近一年，雖然在－２０°Ｃ??條件下冷凍保存，但也不同程度發(fā)生ＤＮＡ的降解，保存時(shí)間越短的樣品提取的ＤＮＡ??質(zhì)量越好（圖３－１、表３－１）。因?yàn)楸狙芯恐饕冢校茫壹夹g(shù)，所提取得ＤＮＡ均能滿足??實(shí)驗(yàn)的需求。??■■■■??圖３....

圖３－３?ＥＥ０．６基因ＰＣＲ擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖及性別鑒定結(jié)果??？

易出現(xiàn)錯(cuò)誤，將未出現(xiàn)條帶的個(gè)體均判別為雄性，因此另外加入一對Ｚ染色體上的引物??ＳＩＮＴ－Ｆ／ＳＩＮＴ－Ｒ特異性擴(kuò)增１９０ｂｐ左右的條帶作為陽性控制，即雄性僅有一個(gè)１９０ｂｐ的??條帶，而雌性則會(huì)出現(xiàn)１９０ｂｐ和３８０ｂｐ兩條條帶（圖３－２和圖３－３）。??實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，兩個(gè)基因....

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