新疆地區(qū)少數(shù)民族Y-SNP與Y-STR的多態(tài)性研究及其在法醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用
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更多相關(guān)文章: Y-SNP Y-STR 法醫(yī)學(xué) 維吾爾族 柯爾克孜 塔吉克族 哈薩克族
【摘要】:[目的]Y染色體因其非重組區(qū)域的DNA多態(tài)呈穩(wěn)定的父系遺傳而帶有家族特征,所以又被稱為“譜系標記”。這種“譜系標記”在法醫(yī)學(xué)混合斑分析、涉男性嫌疑人案件的排查中,能夠?qū)⑾右扇伺c某個特定家族相關(guān)聯(lián),從而縮小偵查范圍,極大的減少了工作量,提高效率。本課題研究了新疆地區(qū)維吾爾族、柯爾克孜、塔吉克族、哈薩克族4個具有中亞特異性的少數(shù)民族14個Y-SNP位點和Yfiler(?) Plus試劑盒27個Y-STR基因座基因分型檢測,獲得了Y-SNP與Y-STR兩種遺傳標記的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分布特點,用于新疆地區(qū)少數(shù)民族遺傳成分描述及案件現(xiàn)場遺留的男性檢材個體種族來源推斷。[方法]由公安部物證鑒定中心提供新疆地區(qū)維吾爾族(132例)、柯爾克孜(26例)、塔吉克族(25例)、哈薩克族(32例)共215例無關(guān)男性個體作為研究對象。采用飽和酚-氯仿法提取核基因組DNA。先利用第一組由7個Y-SNP位點(包括O*-M175、O3*-M122、O1a-M119、K-R*-M9、C-M130、D-M174、O2a1-M95)的復(fù)合擴增體系和SNaPsho檢測技術(shù)進行初篩,對具有K-R*-M9突變和非K-M9單倍群的樣本進行本實驗中第二組7個Y-SNP位點(D-M145、I-M258、Q-M242、 N-M231、R-M207、R1a1-M17、J-M304)進行分型檢測,并與北方漢族和歐洲人群[1-4]做頻率對比:用Yfiler(?) Plus試劑盒進行27個Y-STR基因座的復(fù)合擴增檢測,并與河南漢族[5]和意大利人群[6]作對照;應(yīng)用Arlequin3.5、SPSS17.0軟件、Network4.5.1.6等軟件進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析。[結(jié)果]所檢測的14個Y-SNP單倍群中,維吾爾族在I-M258、Q-M242、N-M231、 R*-M207、R1a1-M17和J-M304中均有頻率分布;柯爾克孜在R*-M207、R1a1-M17和J-M304單倍群中有分布;塔吉克族分布在單倍群R*-M207、R1a1-M17和J-M304單倍群中;哈薩克族主要分布在R*-M207、R1a1-M17單倍群中;單倍群DE*-M145在四種民族中均未檢出分型,但在北方漢族和歐洲人群均有存在:其中R*-M207在維吾爾族、柯爾克孜中的頻率分別為0.0606、0.1154;Rlal-M17在六個人群中的頻率分別為分別為0.2273、0.3846、0.2400、0.0625、0、0.3947;J-M304分別為0.1212、0.0769、0.1600、0、0.0040、0.1600;Q-M 242僅在維吾爾族、北方漢族和歐洲人群中檢出;Ⅰ-M 258僅在維族樣本中檢出一例。27個Y-STR基因座構(gòu)成的單倍型在維吾爾族、柯爾克孜、塔吉克族、哈薩克族、河南漢族和意大利人群中分別檢出235種、120種、110種、125種、321種和183種;DYS635在塔吉克族和哈薩克族上的高頻等位基因為22和19;DYS38911*32在柯爾克孜族中頻率分布較高;DYS458*15為柯爾克孜族主要單倍型;DYS448在柯爾克孜、意大利人群的高頻等位基因為21和18;DYS390*26僅在河南漢族中有頻率;DYS392*7、DYS518*30僅在維吾爾族中有分布;DYS570在維吾爾族和塔吉克族的高頻等位基因為19和16/18;DYS385在維吾爾族中8,17/12,32/14,24/16,21/17,17這五個單倍型是特有的;在DYF387S1基因座上六個民族分別檢出34種、10種、9種、13種、50種和12種單倍型,具有很好的多樣性,個體識別率高。維吾爾族27個Y-STR基因座在R*-M207、Rlal-M17、J-M304、Q-M242四個單倍群中均有高頻率的等位基因分布,在DYS576、DYS38911、DYS391、 DYS460、DYS391、DYS456、DYS390、DYS437、DYS533這9個基因座中高頻等位基因分布無明顯差異,DYS627、DYS448在Rlal-M17的分布明顯與Q-M242、R*-M207、J-M304不同,其特征單倍型是17-20;基因座DYS392.DYS570在R*-M207高頻等位基因分布明顯與其他三個單倍群不同,其特征單倍型是13-16/20;基因座DYS481在單倍群J-M304的高頻等位基因分布明顯有區(qū)別;DYS458、DYS518、DYS385、DYS449、DYF387S1在各單倍群中分布明顯不均,差異性較大;蜃鵇YS627、DYS570、DYS533在Rlal-M17單倍群中柯爾克孜族與維吾爾族的分布有明顯的差異。Rlal-M17單倍群的網(wǎng)絡(luò)圖中,維吾爾族和柯爾克孜族有較明顯的地理特異性聚類,單倍型個體分散且被較長的支長分開,說明Rlal-M17是個古老的單倍群,沒有經(jīng)歷擴張效應(yīng)或奠基者效應(yīng),經(jīng)歷了較長時間的變異,遺傳結(jié)構(gòu)復(fù)雜。柯爾克孜族的單倍型位于外周,并且具有一個較小的類似星狀放射形狀,提示柯爾克孜族在Rlal-M17單倍群個體中經(jīng)歷了一定的擴張效應(yīng)或奠基者效應(yīng)。維吾爾族在J-M304單倍群中分散到中介網(wǎng)絡(luò)圖的中央并且沒有形成星狀放射形狀,表明在J-M304單倍群分支多樣性且沒有發(fā)生擴張。[結(jié)論]本課題研究獲取了新疆地區(qū)維吾爾族、柯爾克孜、塔吉克族和哈薩克族Y-SNP和Y-STR的群體遺傳學(xué)基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。本課題研究了新疆地區(qū)少數(shù)民族父系遺傳特點,Y-SNP和Y-STR基因分型來源于歐洲和東亞兩部分人群,各民族在父系遺傳結(jié)構(gòu)多樣性中存在著基因交流,與之前相關(guān)研究結(jié)果相符。能夠為法醫(yī)生物檢材所屬個體種族來源的推斷提供參考。
【關(guān)鍵詞】:Y-SNP Y-STR 法醫(yī)學(xué) 維吾爾族 柯爾克孜 塔吉克族 哈薩克族
【學(xué)位授予單位】:昆明醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:D919
【目錄】:
- 英漢縮略詞語名詞對照5-6
- 中文摘要6-9
- 英文摘要9-13
- 引言13-20
- 材料與方法20-29
- 結(jié)果與分析29-50
- 討論50-58
- 結(jié)論58-59
- 參考文獻59-64
- 綜述64-72
- 參考文獻70-72
- 碩士在讀期間發(fā)表文章72-73
- 致謝73
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,本文編號:971202
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