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PCR法檢測(cè)硅藻SSU基因在溺死鑒定中的應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2017-10-01 13:18

  本文關(guān)鍵詞:PCR法檢測(cè)硅藻SSU基因在溺死鑒定中的應(yīng)用


  更多相關(guān)文章: 法醫(yī)病理學(xué) 溺死 硅藻檢驗(yàn) SSU PCR DHPLC CE


【摘要】:目的:溺死(drowning)是機(jī)械性死亡的一種。我國(guó)河道水網(wǎng)密集,水中尸體多發(fā),在江河湖海中發(fā)現(xiàn)的尸體可能屬于意外溺水死亡,但也可能為自殺或他殺,也不排除死后拋尸入水偽造意外溺水身亡,因此水中尸體可能與刑事案件相關(guān),必須進(jìn)行法醫(yī)學(xué)鑒定。溺死的鑒定及對(duì)其實(shí)用性、科學(xué)性的評(píng)價(jià)是法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域長(zhǎng)期以來(lái)的重要課題之一。確定生前入水和死后入水是解決溺死類(lèi)案件的關(guān)鍵,由于其他生物學(xué)和尸體化學(xué)的溺死檢驗(yàn)指標(biāo)尚未得到科學(xué)的確認(rèn),因此,硅藻檢驗(yàn)仍是目前鑒定溺死的“金標(biāo)準(zhǔn)”。近年來(lái),對(duì)溺死的相關(guān)報(bào)道主要集中于不同水域溺死案件的鑒定或回顧性研究,且主要著重于尸體臟器中硅藻的檢出及檢出率比較,對(duì)傳統(tǒng)硅藻提取、檢測(cè)方法的改良及優(yōu)缺點(diǎn)比較,而忽略臟器內(nèi)硅藻種類(lèi)與溺死地點(diǎn)硅藻種類(lèi)的比較及新的、靈敏度高、特異性強(qiáng)的硅藻檢驗(yàn)方法的探索。本研究主要通過(guò)酶消化法分離硅藻,在保證操作者安全的同時(shí),減少硅藻的破壞和損失;硅藻DNA的提取使用MoBio強(qiáng)力土壤DNA提取試劑盒(PowerSoilTM DNA Isolation Kit),能高效提取硅藻基因組DNA,且DNA純度高,可直接用于下游實(shí)驗(yàn);選用硅藻特異性引物,通過(guò)PCR法擴(kuò)增硅藻SSU基因,通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳及PCR產(chǎn)物測(cè)序,驗(yàn)證引物特異性。DHPLC法不僅可以對(duì)PCR產(chǎn)物的片段大小進(jìn)行分析,還能對(duì)PCR產(chǎn)物的構(gòu)象及堿基組成比例進(jìn)行檢測(cè)分析,因此本研究采用DHPLC法(高效變性液相色譜法)對(duì)溺死人體臟器及溺死地點(diǎn)水樣中的硅藻進(jìn)行分析,區(qū)分不同水域硅藻種屬,為判斷溺死人體臟器內(nèi)硅藻種屬與溺死地點(diǎn)硅藻種屬是否相同提供依據(jù),具有靈敏度高、特異性強(qiáng)的優(yōu)點(diǎn)。此外,本研究中還應(yīng)用了毛細(xì)管電泳檢測(cè)硅藻SSU基因,此法也具有靈敏度高、特異性強(qiáng)的優(yōu)點(diǎn),毛細(xì)管電泳法因其應(yīng)用廣泛、操作簡(jiǎn)單,因此在溺死鑒定和溺死地點(diǎn)推斷中易普及推廣,為硅藻檢驗(yàn)提供了一種新方法、新思路。 方法:把實(shí)驗(yàn)動(dòng)物60只隨機(jī)分成3組,分別為生前溺死(水中溺斃)、死后入水(空氣栓塞致死后入水)、對(duì)照組(空氣栓塞致死后不做處理),每組20只;從廣州市刑事科學(xué)技術(shù)研究所獲取溺死診斷陽(yáng)性人體臟器組織30份,包括肺、肝、腎組織,提取各組織檢材硅藻DNA,PCR擴(kuò)增硅藻特異的核糖體小亞基(SSU)片段,用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)、PCR-DHPLC檢測(cè)、PCR-CE檢測(cè)分析,評(píng)估PCR-DHPLC法和PCR-CE檢測(cè)硅藻SSU基因在溺死鑒定中的應(yīng)用價(jià)值。 結(jié)果:在動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中,生前溺死組肺、肝、腎硅藻檢出率分別為100%、90%、85%,死后入水組僅肺檢出硅藻(15%),對(duì)照組各組織均為陰性;生前溺死組檢出率明顯高于死后入水組(P0.05)。通過(guò)PCR-CE法對(duì)20只溺死實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的肝、腎、肺進(jìn)行檢驗(yàn),結(jié)果發(fā)現(xiàn)隨著檢材量的增加,檢出的硅藻種類(lèi)數(shù)增加,且均存在正相關(guān);肺內(nèi)檢出硅藻種類(lèi)與檢材量的相關(guān)系數(shù)是0.433(P0.01),肝內(nèi)檢出硅藻種類(lèi)與檢材量的相關(guān)系數(shù)是0.623(P0.01),腎內(nèi)檢出硅藻種類(lèi)與檢材量的相關(guān)系數(shù)是0.613(P0.01)。當(dāng)檢材量大于0.9g時(shí),肺內(nèi)檢出硅藻種類(lèi)以2種及2種以上為主;當(dāng)檢材量大于1.5g時(shí),肝內(nèi)檢出硅藻種類(lèi)以1種及1種以上為主;當(dāng)檢材量大于2g時(shí),腎內(nèi)檢出硅藻種類(lèi)以1種及1種以上為主。20例溺死診斷陽(yáng)性的人體器官組織檢材用PCR-CE法檢出硅藻種類(lèi)明顯多于微波消解-掃描電鏡法(P0.05)。10例溺死診斷陽(yáng)性的人體器官組織檢材用DHPLC法檢出硅藻種類(lèi)明顯多于微波消解-掃描電鏡法(P0.05)。 結(jié)論:PCR-DHPLC法是一種新的診斷溺死的方法,此法具有靈敏度高、特異性強(qiáng)的優(yōu)勢(shì);PCR-DHPLC法可對(duì)不同硅藻種屬進(jìn)行分離和鑒定,不僅準(zhǔn)確性高、可信度強(qiáng),還能為判斷溺死人體臟器內(nèi)硅藻種屬與溺死地點(diǎn)硅藻種屬是否相同提供依據(jù),從而為溺死鑒定和溺死地點(diǎn)推斷提供較好的方法和平臺(tái)。通過(guò)PCR-CE法檢測(cè)硅藻SSU基因,具有很強(qiáng)的靈敏度和特異性,且具有較好的普及性和推廣性,為法醫(yī)學(xué)硅藻檢驗(yàn)提供了一條新思路。
【關(guān)鍵詞】:法醫(yī)病理學(xué) 溺死 硅藻檢驗(yàn) SSU PCR DHPLC CE
【學(xué)位授予單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類(lèi)號(hào)】:D919
【目錄】:
  • 摘要3-6
  • ABSTRACT6-12
  • 第一章 引言12-20
  • 1.1 溺死及溺死鑒定的意義12-13
  • 1.2 硅藻提取及檢測(cè)方法的分類(lèi)及發(fā)展13-15
  • 1.3 硅藻檢驗(yàn)的現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢(shì)15-17
  • 1.4 硅藻DNA檢驗(yàn)的優(yōu)勢(shì)17-18
  • 1.5 立項(xiàng)依據(jù)及研究思路18-20
  • 第二章 PCR-Agarose電泳檢測(cè)硅藻SSU基因方法建立20-29
  • 2.1 材料20-22
  • 2.1.1 主要儀器20-21
  • 2.1.2 主要試劑及耗材21-22
  • 2.1.3 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物分組22
  • 2.1.4 模型制作22
  • 2.1.5 樣本來(lái)源22
  • 2.2 方法22-26
  • 2.2.1 組織中硅藻分離方法22-23
  • 2.2.2 水樣硅藻分離方法23
  • 2.2.3 硅藻DNA提取23-24
  • 2.2.4 硅藻DNA純度檢測(cè)24-25
  • 2.2.5 PCR擴(kuò)增25
  • 2.2.6 瓊脂糖凝膠電泳25-26
  • 2.2.7 PCR產(chǎn)物測(cè)序26
  • 2.3 結(jié)果26-27
  • 2.3.1 硅藻DNA純度26
  • 2.3.2 硅藻及其對(duì)照樣本擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果26-27
  • 2.3.3 PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果27
  • 2.3.4 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物器官檢出率結(jié)果27
  • 2.4 討論27-29
  • 第三章 PCR-CE法檢測(cè)硅藻SSU基因29-40
  • 3.1 材料30-31
  • 3.1.1 主要儀器30
  • 3.1.2 主要試劑及耗材30-31
  • 3.1.3 樣本來(lái)源31
  • 3.2 方法31-34
  • 3.2.1 組織中硅藻分離方法31
  • 3.2.2 水樣硅藻分離方法31
  • 3.2.3 硅藻DNA提取31-33
  • 3.2.4 PCR擴(kuò)增33
  • 3.2.5 毛細(xì)管電泳33-34
  • 3.2.6 微波消解-掃描電鏡法檢驗(yàn)硅藻34
  • 3.3 結(jié)果34-39
  • 3.4 討論39-40
  • 第四章 PCR-DHPLC法檢測(cè)硅藻SSU基因40-51
  • 4.1 材料42-43
  • 4.1.1 主要儀器42
  • 4.1.2 主要試劑及耗材42-43
  • 4.1.3 樣本來(lái)源43
  • 4.2 方法43-47
  • 4.2.1 組織中硅藻分離方法43
  • 4.2.2 水樣硅藻分離方法43
  • 4.2.3 硅藻DNA提取43-45
  • 4.2.4 PCR擴(kuò)增45
  • 4.2.5 DHPLC溫度預(yù)測(cè)45
  • 4.2.6 配制DHPLC緩沖液45
  • 4.2.7 DHPLC儀操作流程45-46
  • 4.2.8 DHPLC異常峰型分析46-47
  • 4.2.9 微波消解-掃描電鏡法檢驗(yàn)硅藻47
  • 4.3 結(jié)果47-49
  • 4.3.1 DHPLC結(jié)果47-48
  • 4.3.2 DHPLC法與微波消解-掃描電鏡法硅藻檢出結(jié)果比較48-49
  • 4.4 討論49-51
  • 全文小結(jié)51
  • 存在的問(wèn)題和展望51-53
  • 參考文獻(xiàn)53-58
  • 附錄58-68
  • 研究生期間研究成果68-69
  • 致謝69-70

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前9條

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7 孫維琦,于曉軍,李坦;微波消解法檢驗(yàn)硅藻的實(shí)驗(yàn)研究[J];法醫(yī)學(xué)雜志;2002年03期

8 汪家文;于曉軍;王曉雁;;溺死法醫(yī)學(xué)鑒定的研究新進(jìn)展[J];法醫(yī)學(xué)雜志;2008年04期

9 王磊,王杰,黃映康;生前硅藻空氣源性吸入肺最大值在溺死鑒定中的應(yīng)用[J];貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2005年04期

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本文編號(hào):953663

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