建立云南傣族人群法醫(yī)DNA基礎數(shù)據(jù)庫
發(fā)布時間:2017-09-05 09:12
本文關鍵詞:建立云南傣族人群法醫(yī)DNA基礎數(shù)據(jù)庫
更多相關文章: 短串聯(lián)重復序列 單核苷酸多態(tài)性 法醫(yī)物證學 云南傣族人群 法醫(yī)基礎DNA數(shù)據(jù)庫
【摘要】:目的人類的Y染色體和常染色體是法醫(yī)DNA分析最主要的研究對象,而X染色體的特殊遺傳方式也使得這種遺傳標記越來越受到關注。由于同一種遺傳標記在不同人群間存在差異,所以需要對不同的人群進行群體遺傳學調查,獲得人群等位基因頻率等基礎群體遺傳學數(shù)據(jù),建立各個人群基礎DNA數(shù)據(jù)庫,應用于法醫(yī)學實踐,本課題的目的是建立云南傣族人群法醫(yī)基礎DNA數(shù)據(jù)庫。依據(jù)Y染色體系統(tǒng)發(fā)生樹,選擇與東亞人群有關的Y-SNP位點,分析云南傣族男性人群的Y-SNP位點、Y-STR基因座、X-STR基因座及云南傣族人群常染色體STR基因座遺傳多態(tài)性,同時對云南德宏地區(qū)、云南版納地區(qū)傣族人群進行比較,更好地評估云南傣族男性人群法醫(yī)基礎DNA數(shù)據(jù)庫用于云南傣族人群的法醫(yī)學個人識別和親權鑒定的系統(tǒng)效能和證據(jù)價值,建立了云南傣族人群法醫(yī)基礎DNA數(shù)據(jù)庫,對相關人群的遺傳關系進行比較。方法在自愿者知情同意的原則下,在云南德宏州隴川縣采集231份云南傣族男性無關個體樣本,磁珠法提取DNA,采用MassARRAY分析技術檢測實驗樣本Y染色體上43個SNP位點,同時分析同一組人群樣本的38個Y-STR基因座、19個X-STR基因座的遺傳多態(tài)性,應用SPSS 21.0統(tǒng)計學軟件及人群遺傳學軟件進行統(tǒng)計學分析。另外,在自愿者知情同意的原則下,在云南德宏地區(qū)和版納地區(qū)采集790例云南傣族無關個體,對15個常染色體STR基因座遺傳多態(tài)性分析,并運用Powerstat軟件計算人群等位基因頻率及法醫(yī)學參數(shù)、人群遺傳學軟件進行群體遺傳學分析。結果1.Y染色體遺傳標記(1) Y-SNP位點構建了43個Y-SNP位點的兩個復合擴增分析體系,在這43個Y-SNP位點中,在25個Y-SNP位點發(fā)現(xiàn)突變型,獲得了云南傣族男性人群的Y-SNP位點等位基因頻率,其中O單倍群為云南傣族男性人群的主要單倍群,其中O3a2cla單倍群樣本占到總樣本數(shù)的40.44%,02a1單倍群占30.44%。(2)Y-STR基因座分析了38個Y-STR基因座多態(tài)性,有6個基因座存在空等位基因(NULL)現(xiàn)象,其中有3個NULL等位基因來自同一樣本。計算人群單倍型,共發(fā)現(xiàn)221個單倍群,頻率在0.01739-0.0043,累積單倍型多樣性為4.2373×10-1s,其中出現(xiàn)4次的單倍型有1例,3次的單倍型有2例,2次的單倍型有3例。2.X-STR多態(tài)性分析對完成Y染色體分析的云南傣族男性樣本進行19個X-STR基因座多態(tài)性分析,發(fā)現(xiàn)231種X-STR單倍型,累積PD值達1-2.4092×10-13,具有良好的個人識別能力。3.常染色體STR基因座對790例云南傣族人群樣本進行常染色體STR基因座分析,共觀察到184個等位基因和726種基因型,15個STR基因座累積PD值達1-2.2282x10-19;累積PE為0.999 999 655。根據(jù)法醫(yī)學參數(shù),發(fā)現(xiàn)在Amp(?)STR(?) SinofilerTM試劑盒中多態(tài)性最好的STR基因座為FGA基因座。4.人群遺傳關系分析對相關人群進行人群遺傳關系比較,在父系遺傳方面,發(fā)現(xiàn)云南傣族人群與其他侗臺語人群遺傳關系密切,進而漢藏語系人群關系較近,考慮在父系遺傳方面,云南傣族男性人群受到北方來源人群的影響;在常染色體STR方面,云南傣族人群與南方各原住少數(shù)民族、臺灣地區(qū)人群關系較近。由于目前對中國各少數(shù)民族人群Y染色體的研究較少,此結果也受到了人群數(shù)據(jù)來源的限制,且研究的樣本數(shù)也少,影響了人群的代表性,所以需要更多的人群數(shù)據(jù)來進行人群遺傳關系研究。結論以云南德宏傣族男性人群作為研究對象,分析同一批樣本Y染色體系統(tǒng)進化樹主干和分支共43個Y-SNP位點、38個Y-STR基因座以及19個X-STR基因座遺傳學多態(tài)性,獲得了云南德宏傣族男性人群Y染色體Y-SNP位點、Y-STR基因座、X-STR基因座基礎數(shù)據(jù)。分析了790例云南德宏和版納傣族人群的15個常染色體STR基因座的遺傳多態(tài)性,獲得云南傣族人群常染色體STR基礎DNA數(shù)據(jù)。建立了云南傣族人群基礎DNA數(shù)據(jù)庫,為法醫(yī)學、人類學等學科提供基礎數(shù)據(jù)。對所獲得的人群數(shù)據(jù)進行群體遺傳學分析后,發(fā)現(xiàn)云南傣族人群與侗臺語少數(shù)民族遺傳關系密切,父系遺傳標記受到北方人群的部分影響,而常染色體STR則顯示云南傣族人群與南方人群關系較近。
【關鍵詞】:短串聯(lián)重復序列 單核苷酸多態(tài)性 法醫(yī)物證學 云南傣族人群 法醫(yī)基礎DNA數(shù)據(jù)庫
【學位授予單位】:昆明醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:D919
【目錄】:
- 摘要5-8
- Abstract8-10
- 專業(yè)縮略詞英漢對照10-11
- 引言11-14
- 云南傣族男性人群Y染色體數(shù)據(jù)庫建設14-32
- 一、Y染色體遺傳標記的研究現(xiàn)狀14-16
- 二、云南傣族男性人群Y染色體數(shù)據(jù)庫的建設16-20
- 三、結果20-32
- 云南傣族男性人群X染色體數(shù)據(jù)庫建設32-37
- 一、X染色體在法醫(yī)學鑒定的運用32-33
- 二、云南傣族男性人群X染色體數(shù)據(jù)庫建設33-34
- 三、結果34-37
- 云南傣族人群常染色體STR數(shù)據(jù)庫建設37-46
- 一、常染色體STR人群數(shù)據(jù)庫建設現(xiàn)狀37
- 二、云南傣族男性人群常染色體數(shù)據(jù)庫的建設37-39
- 三、結果39-46
- 討論46-54
- 結論54-55
- 參考文獻55-60
- 附錄一:常用的Y-STR標準化試劑盒60-61
- 附錄二:常染色體STR標準化試劑盒一覽表61-64
- 附錄三:Y-SNP引物信息表64-66
- 附錄四:實驗儀器與試劑66-67
- 附錄五:圖表目錄67-69
- 綜述69-76
- 參考文獻74-76
- 攻讀學位期間發(fā)表的論文76-77
- 致謝77
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 李輝;;分子人類學所見歷史上閩越族群的消失[J];廣西民族大學學報(哲學社會科學版);2007年02期
2 單可人;何燕;齊曉嵐;劉p,
本文編號:797105
本文鏈接:http://sikaile.net/falvlunwen/fanzuizhian/797105.html