本文關(guān)鍵詞：建立云南傣族人群法醫(yī)DNA基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫

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【摘要】：目的人類的Y染色體和常染色體是法醫(yī)DNA分析最主要的研究對象,而X染色體的特殊遺傳方式也使得這種遺傳標(biāo)記越來越受到關(guān)注。由于同一種遺傳標(biāo)記在不同人群間存在差異,所以需要對不同的人群進(jìn)行群體遺傳學(xué)調(diào)查,獲得人群等位基因頻率等基礎(chǔ)群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù),建立各個人群基礎(chǔ)DNA數(shù)據(jù)庫,應(yīng)用于法醫(yī)學(xué)實(shí)踐,本課題的目的是建立云南傣族人群法醫(yī)基礎(chǔ)DNA數(shù)據(jù)庫。依據(jù)Y染色體系統(tǒng)發(fā)生樹,選擇與東亞人群有關(guān)的Y-SNP位點(diǎn),分析云南傣族男性人群的Y-SNP位點(diǎn)、Y-STR基因座、X-STR基因座及云南傣族人群常染色體STR基因座遺傳多態(tài)性,同時對云南德宏地區(qū)、云南版納地區(qū)傣族人群進(jìn)行比較,更好地評估云南傣族男性人群法醫(yī)基礎(chǔ)DNA數(shù)據(jù)庫用于云南傣族人群的法醫(yī)學(xué)個人識別和親權(quán)鑒定的系統(tǒng)效能和證據(jù)價值,建立了云南傣族人群法醫(yī)基礎(chǔ)DNA數(shù)據(jù)庫,對相關(guān)人群的遺傳關(guān)系進(jìn)行比較。方法在自愿者知情同意的原則下,在云南德宏州隴川縣采集231份云南傣族男性無關(guān)個體樣本,磁珠法提取DNA,采用MassARRAY分析技術(shù)檢測實(shí)驗(yàn)樣本Y染色體上43個SNP位點(diǎn),同時分析同一組人群樣本的38個Y-STR基因座、19個X-STR基因座的遺傳多態(tài)性,應(yīng)用SPSS 21.0統(tǒng)計學(xué)軟件及人群遺傳學(xué)軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。另外,在自愿者知情同意的原則下,在云南德宏地區(qū)和版納地區(qū)采集790例云南傣族無關(guān)個體,對15個常染色體STR基因座遺傳多態(tài)性分析,并運(yùn)用Powerstat軟件計算人群等位基因頻率及法醫(yī)學(xué)參數(shù)、人群遺傳學(xué)軟件進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析。結(jié)果1.Y染色體遺傳標(biāo)記(1) Y-SNP位點(diǎn)構(gòu)建了43個Y-SNP位點(diǎn)的兩個復(fù)合擴(kuò)增分析體系,在這43個Y-SNP位點(diǎn)中,在25個Y-SNP位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)突變型,獲得了云南傣族男性人群的Y-SNP位點(diǎn)等位基因頻率,其中O單倍群為云南傣族男性人群的主要單倍群,其中O3a2cla單倍群樣本占到總樣本數(shù)的40.44%,02a1單倍群占30.44%。(2)Y-STR基因座分析了38個Y-STR基因座多態(tài)性,有6個基因座存在空等位基因(NULL)現(xiàn)象,其中有3個NULL等位基因來自同一樣本。計算人群單倍型,共發(fā)現(xiàn)221個單倍群,頻率在0.01739-0.0043,累積單倍型多樣性為4.2373×10-1s,其中出現(xiàn)4次的單倍型有1例,3次的單倍型有2例,2次的單倍型有3例。2.X-STR多態(tài)性分析對完成Y染色體分析的云南傣族男性樣本進(jìn)行19個X-STR基因座多態(tài)性分析,發(fā)現(xiàn)231種X-STR單倍型,累積PD值達(dá)1-2.4092×10-13,具有良好的個人識別能力。3.常染色體STR基因座對790例云南傣族人群樣本進(jìn)行常染色體STR基因座分析,共觀察到184個等位基因和726種基因型,15個STR基因座累積PD值達(dá)1-2.2282x10-19；累積PE為0.999 999 655。根據(jù)法醫(yī)學(xué)參數(shù),發(fā)現(xiàn)在Amp(?)STR(?) SinofilerTM試劑盒中多態(tài)性最好的STR基因座為FGA基因座。4.人群遺傳關(guān)系分析對相關(guān)人群進(jìn)行人群遺傳關(guān)系比較,在父系遺傳方面,發(fā)現(xiàn)云南傣族人群與其他侗臺語人群遺傳關(guān)系密切,進(jìn)而漢藏語系人群關(guān)系較近,考慮在父系遺傳方面,云南傣族男性人群受到北方來源人群的影響；在常染色體STR方面,云南傣族人群與南方各原住少數(shù)民族、臺灣地區(qū)人群關(guān)系較近。由于目前對中國各少數(shù)民族人群Y染色體的研究較少,此結(jié)果也受到了人群數(shù)據(jù)來源的限制,且研究的樣本數(shù)也少,影響了人群的代表性,所以需要更多的人群數(shù)據(jù)來進(jìn)行人群遺傳關(guān)系研究。結(jié)論以云南德宏傣族男性人群作為研究對象,分析同一批樣本Y染色體系統(tǒng)進(jìn)化樹主干和分支共43個Y-SNP位點(diǎn)、38個Y-STR基因座以及19個X-STR基因座遺傳學(xué)多態(tài)性,獲得了云南德宏傣族男性人群Y染色體Y-SNP位點(diǎn)、Y-STR基因座、X-STR基因座基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。分析了790例云南德宏和版納傣族人群的15個常染色體STR基因座的遺傳多態(tài)性,獲得云南傣族人群常染色體STR基礎(chǔ)DNA數(shù)據(jù)。建立了云南傣族人群基礎(chǔ)DNA數(shù)據(jù)庫,為法醫(yī)學(xué)、人類學(xué)等學(xué)科提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。對所獲得的人群數(shù)據(jù)進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析后,發(fā)現(xiàn)云南傣族人群與侗臺語少數(shù)民族遺傳關(guān)系密切,父系遺傳標(biāo)記受到北方人群的部分影響,而常染色體STR則顯示云南傣族人群與南方人群關(guān)系較近。
【關(guān)鍵詞】：短串聯(lián)重復(fù)序列 單核苷酸多態(tài)性 法醫(yī)物證學(xué) 云南傣族人群 法醫(yī)基礎(chǔ)DNA數(shù)據(jù)庫
【學(xué)位授予單位】：昆明醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：D919
【目錄】：

• 摘要5-8
• Abstract8-10
• 專業(yè)縮略詞英漢對照10-11
• 引言11-14
• 云南傣族男性人群Y染色體數(shù)據(jù)庫建設(shè)14-32
• 一、Y染色體遺傳標(biāo)記的研究現(xiàn)狀14-16
• 二、云南傣族男性人群Y染色體數(shù)據(jù)庫的建設(shè)16-20
• 三、結(jié)果20-32
• 云南傣族男性人群X染色體數(shù)據(jù)庫建設(shè)32-37
• 一、X染色體在法醫(yī)學(xué)鑒定的運(yùn)用32-33
• 二、云南傣族男性人群X染色體數(shù)據(jù)庫建設(shè)33-34
• 三、結(jié)果34-37
• 云南傣族人群常染色體STR數(shù)據(jù)庫建設(shè)37-46
• 一、常染色體STR人群數(shù)據(jù)庫建設(shè)現(xiàn)狀37
• 二、云南傣族男性人群常染色體數(shù)據(jù)庫的建設(shè)37-39
• 三、結(jié)果39-46
• 討論46-54
• 結(jié)論54-55
• 參考文獻(xiàn)55-60
• 附錄一：常用的Y-STR標(biāo)準(zhǔn)化試劑盒60-61
• 附錄二：常染色體STR標(biāo)準(zhǔn)化試劑盒一覽表61-64
• 附錄三：Y-SNP引物信息表64-66
• 附錄四：實(shí)驗(yàn)儀器與試劑66-67
• 附錄五：圖表目錄67-69
• 綜述69-76
• 參考文獻(xiàn)74-76
• 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的論文76-77
• 致謝77

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 李輝;;分子人類學(xué)所見歷史上閩越族群的消失[J];廣西民族大學(xué)學(xué)報(哲學(xué)社會科學(xué)版);2007年02期

2 單可人;何燕;齊曉嵐;劉p，

本文編號：797105