基于毛干蛋白質(zhì)組的族群推斷技術(shù)的建立與驗(yàn)證
發(fā)布時(shí)間:2024-01-25 12:49
毛干是一種案件現(xiàn)場(chǎng)常見(jiàn)的生物物證,由于核DNA含量極少且高度降解,難以采用現(xiàn)有的短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat,STR)檢驗(yàn)方法進(jìn)行個(gè)人識(shí)別鑒定,目前僅使用線粒體DNA檢驗(yàn)進(jìn)行母系親緣關(guān)系的判定,利用率非常低.毛干中蛋白質(zhì)非常穩(wěn)定,而且具有遺傳多態(tài)性,表現(xiàn)為基因組中的非同義單核苷酸多態(tài)性(non-synonymous single nucleotide polymorphisms,ns SNPs),轉(zhuǎn)錄翻譯后形成蛋白質(zhì)序列中的單氨基酸多態(tài)性(single amino acid polymorphisms,SAPs).充分利用毛干蛋白質(zhì)中蘊(yùn)含的遺傳信息,為案件提供線索和證據(jù),是實(shí)際公安業(yè)務(wù)的迫切需求,具有重要的應(yīng)用價(jià)值.本文選取了104份中國(guó)漢族的毛干樣本進(jìn)行蛋白質(zhì)組的檢測(cè),共獲得了703個(gè)SAP位點(diǎn),位于460個(gè)蛋白質(zhì)上,共推導(dǎo)出552個(gè)nsSNP位點(diǎn).進(jìn)一步篩選在所有樣本中檢出率超過(guò)15%的位點(diǎn),獲得了88個(gè)nsSNP位點(diǎn),使用毛干樣本對(duì)應(yīng)的口腔拭子DNA對(duì)88個(gè)ns SNP位點(diǎn)進(jìn)行一代測(cè)序驗(yàn)證.為評(píng)估發(fā)現(xiàn)的nsSNP位點(diǎn)對(duì)于人群的區(qū)分能力,以千人數(shù)據(jù)庫(kù)(1 ...
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 毛干蛋白質(zhì)組提取
1.2 蛋白質(zhì)組質(zhì)譜檢測(cè)與SAP位點(diǎn)定位
1.3 反推nsSNP統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
1.4 nsSNP一代測(cè)序驗(yàn)證
1.5 人群推斷分析
2 結(jié)果
2.1 毛干蛋白質(zhì)組nsSNP檢出情況
2.2 一代測(cè)序驗(yàn)證毛干蛋白質(zhì)組nsSNP
2.3 基于千人基因組數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)毛干nsSNP人群推斷效力評(píng)估
2.4 19份測(cè)試樣本祖先來(lái)源分析
3 討論
本文編號(hào):3884848
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1 材料與方法
1.1 毛干蛋白質(zhì)組提取
1.2 蛋白質(zhì)組質(zhì)譜檢測(cè)與SAP位點(diǎn)定位
1.3 反推nsSNP統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
1.4 nsSNP一代測(cè)序驗(yàn)證
1.5 人群推斷分析
2 結(jié)果
2.1 毛干蛋白質(zhì)組nsSNP檢出情況
2.2 一代測(cè)序驗(yàn)證毛干蛋白質(zhì)組nsSNP
2.3 基于千人基因組數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)毛干nsSNP人群推斷效力評(píng)估
2.4 19份測(cè)試樣本祖先來(lái)源分析
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