推導(dǎo)IBS評分在全同胞對人群中概率分布的計算公式
發(fā)布時間:2021-04-21 03:50
目的推導(dǎo)通過STR等位基因頻率計算生物學(xué)全同胞對間狀態(tài)一致性(identity by state,IBS)評分概率分布的通用計算公式。方法依據(jù)孟德爾遺傳規(guī)律和生物學(xué)全同胞(full sibling,FS)的父母為無關(guān)個體這一假設(shè),推導(dǎo)得到不同基因型組合的無關(guān)個體生育兩名子代時,子代不同基因型組合的IBS評分及所對應(yīng)的概率。結(jié)果以fi表示某STR基因座第i個等位基因的頻率(i=1,2,…,m),則生物學(xué)全同胞對在該基因座出現(xiàn)2個相同等位基因的概率(p2FS)的計算公式為:p2FS=1/4×[1+2∑i=1 m fi2+2(∑i=1 m fi2)2-∑i=1 m f<sup>4];在該基因座出現(xiàn)1個相同等位基因的概率(p1FS)的計算公式為:p1FS:1/2×[1+∑i=1 m fi2-2(∑i=1 m fi...
【文章來源】:法醫(yī)學(xué)雜志. 2019,35(06)CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 方法與結(jié)果
1.1 參數(shù)定義
1.2 生物學(xué)全同胞對中a2、a1、a0的概率
1.3 生物學(xué)全同胞間不同參數(shù)概率計算公式的推導(dǎo)
1.3.1 推導(dǎo)p2FS計算公式
1.3.1. 1 p2FS(HoHo)計算公式的推導(dǎo)
1.3.1. 2 p2FS(HeHe)計算公式的推導(dǎo)
1.3.2 推導(dǎo)p1FS計算公式
1.3.2. 1 p1FS(HoHe)計算公式的推導(dǎo)
1.3.2. 2 p1FS(HeHe)計算公式的推導(dǎo)
1.3.3 推導(dǎo)p0FS計算公式
1.3.3. 1 p0FS(HoHo)計算公式的推導(dǎo)
1.3.3. 2 p0FS(HoHe)計算公式的推導(dǎo)
1.3.3. 3 p0FS(HeHe)計算公式的推導(dǎo)
1.4 推導(dǎo)生物學(xué)全同胞對人群中IBS二項分布的特征參數(shù)
1.5 應(yīng)用示例
1.5.1 FGA等19個必檢STR基因座對應(yīng)各參數(shù)二項分布特征
1.5.2 全同胞鑒定中遺傳學(xué)證據(jù)價值評估示例
1.5.3 對《規(guī)范》中FGA等19個必檢STR基因座生物學(xué)全同胞檢驗系統(tǒng)效能的評估
2 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]推導(dǎo)IBS評分在無關(guān)個體對人群中概率分布的計算公式[J]. 趙煥東,趙書民,陳玉祥,李成濤. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2018(04)
[2]判別函數(shù)在同胞鑒定中的應(yīng)用[J]. 陳子翔,王福振,陸惠玲,章雅清. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2012(02)
[3]D6S1043和D12S391基因座在親權(quán)鑒定中的應(yīng)用[J]. 郭宏,林源,柳燕,闕庭志,嚴品華,趙珍敏,李成濤,李莉. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2007(05)
本文編號:3150998
【文章來源】:法醫(yī)學(xué)雜志. 2019,35(06)CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 方法與結(jié)果
1.1 參數(shù)定義
1.2 生物學(xué)全同胞對中a2、a1、a0的概率
1.3 生物學(xué)全同胞間不同參數(shù)概率計算公式的推導(dǎo)
1.3.1 推導(dǎo)p2FS計算公式
1.3.1. 1 p2FS(HoHo)計算公式的推導(dǎo)
1.3.1. 2 p2FS(HeHe)計算公式的推導(dǎo)
1.3.2 推導(dǎo)p1FS計算公式
1.3.2. 1 p1FS(HoHe)計算公式的推導(dǎo)
1.3.2. 2 p1FS(HeHe)計算公式的推導(dǎo)
1.3.3 推導(dǎo)p0FS計算公式
1.3.3. 1 p0FS(HoHo)計算公式的推導(dǎo)
1.3.3. 2 p0FS(HoHe)計算公式的推導(dǎo)
1.3.3. 3 p0FS(HeHe)計算公式的推導(dǎo)
1.4 推導(dǎo)生物學(xué)全同胞對人群中IBS二項分布的特征參數(shù)
1.5 應(yīng)用示例
1.5.1 FGA等19個必檢STR基因座對應(yīng)各參數(shù)二項分布特征
1.5.2 全同胞鑒定中遺傳學(xué)證據(jù)價值評估示例
1.5.3 對《規(guī)范》中FGA等19個必檢STR基因座生物學(xué)全同胞檢驗系統(tǒng)效能的評估
2 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]推導(dǎo)IBS評分在無關(guān)個體對人群中概率分布的計算公式[J]. 趙煥東,趙書民,陳玉祥,李成濤. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2018(04)
[2]判別函數(shù)在同胞鑒定中的應(yīng)用[J]. 陳子翔,王福振,陸惠玲,章雅清. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2012(02)
[3]D6S1043和D12S391基因座在親權(quán)鑒定中的應(yīng)用[J]. 郭宏,林源,柳燕,闕庭志,嚴品華,趙珍敏,李成濤,李莉. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2007(05)
本文編號:3150998
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