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27-plex SNP種族推斷方法的優(yōu)化及驗證

發(fā)布時間:2019-01-16 06:04
【摘要】:人類學(xué)中常將人群分為東亞黃種人、歐洲白種人和非洲黑種人。27-plex SNP種族推斷體系可針對來自東亞、歐洲、非洲及歐亞混合人群的樣本進(jìn)行分型檢測進(jìn)而推斷其祖先來源。本研究對該體系獲取樣本分型后的種族推斷分析方法進(jìn)行了進(jìn)一步優(yōu)化,建立了一種基于似然比、祖先成分和種族歸類的推斷分析方法,并對4個來自東亞、歐洲、非洲及其混合人群的測試樣本進(jìn)行種族來源推斷。使用基礎(chǔ)參考數(shù)據(jù)庫交叉驗證和1010份測試樣本驗證兩種方式進(jìn)行了種族推斷方法流程的評估研究。驗證結(jié)果表明該方法體系在東亞、歐洲、非洲及歐亞混合人群中的推斷準(zhǔn)確性均高于99%。本種族推斷方法可對DNA來源人的種族信息進(jìn)行刻畫,在人類分子遺傳學(xué)、法醫(yī)遺傳學(xué)等領(lǐng)域有重要的應(yīng)用價值。
[Abstract]:In anthropology, people are often divided into East Asian yellow, European white and African black. The 27-plex SNP racial inference system can be used to identify the origin of the ancestry of samples from the East Asian, European, African and Eurasian mixed populations. In this study, we further optimized the method of race inference analysis based on likelihood ratio, ancestor composition and race classification, and analyzed 4 samples from East Asia and Europe. Test samples from Africa and its mixed population were used to extrapolate ethnic origin. The basic reference database cross-validation and 1010 test samples were used to evaluate the process of race inference. The results show that the method is more accurate than 99% in East Asia, Europe, Africa and Eurasia. This method can depict human race information from DNA, and has important application value in the fields of human molecular genetics, forensic genetics and so on.
【作者單位】: 公安部物證鑒定中心北京市現(xiàn)場物證檢驗工程技術(shù)研究中心;法醫(yī)遺傳學(xué)公安部重點實驗室;
【基金】:“十二五”國家科技支撐計劃課題(編號:2012BAK02B01) 公安部物證鑒定中心基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項資金項目(編號:2015JB023,2016JB039)資助~~
【分類號】:D919

【參考文獻(xiàn)】

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1 聶昊;林子清;莫曉婷;魏以梁;孫啟凡;;DNA來源人種族推斷研究進(jìn)展[J];刑事技術(shù);2016年01期

2 魏麗;魏以梁;江麗;孫啟凡;王英元;李彩霞;;27-plex SNPs復(fù)合擴(kuò)增檢測體系構(gòu)建與應(yīng)用評價[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2016年01期

3 劉海渤;孫啟凡;陳健剛;魏以梁;李越;唐暉;程寶文;李平;迪力·夏提;張濤;馬泉;趙興春;李彩霞;;27重SNP種族推斷體系準(zhǔn)確性驗證研究[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2015年06期

4 孫啟凡;趙蕾;江麗;權(quán)養(yǎng)科;趙興春;李彩霞;;DNA來源人特征刻畫的法庭科學(xué)應(yīng)用研究[J];刑事技術(shù);2015年03期

5 孫啟凡;趙蕾;孫敬;趙興春;李彩霞;;利用SNP復(fù)合擴(kuò)增技術(shù)推斷骨骼所屬人種1例[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2015年02期

6 李彩霞;賈竟;魏以梁;萬立華;胡蘭;葉健;;30個祖先信息位點的篩選及應(yīng)用[J];遺傳;2014年08期

7 韓康信;;新疆古代居民的種族人類學(xué)研究和維吾爾族的體質(zhì)特點[J];西域研究;1991年02期

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 江麗;孫啟凡;馬泉;趙雯婷;劉京;趙蕾;季安全;李彩霞;;27-plex SNP種族推斷方法的優(yōu)化及驗證[J];遺傳;2017年02期

2 栗道清;潘習(xí)勇;;法醫(yī)DNA分析技術(shù)的拓展應(yīng)用[J];黑龍江科技信息;2016年36期

3 鐘大軍;;芻議法醫(yī)DNA分析技術(shù)的拓展應(yīng)用[J];法制博覽;2016年29期

4 徐黎麗;萬紅;;為什么絲綢之路在西漢“貫通”[J];青海師范大學(xué)學(xué)報(哲學(xué)社會科學(xué)版);2016年05期

5 楊鑫;胡萌;張子龍;駱繼懷;哈飛;馬麗英;孫紅兵;;藏漢人群EPAS1、EGLN1基因特異SNP位點遺傳多態(tài)性[J];刑事技術(shù);2016年04期

6 梅宏成;朱軍;權(quán)養(yǎng)科;王桂強(qiáng);;穩(wěn)定同位素檢驗推斷生物物證供體的生活時空信息[J];刑事技術(shù);2016年02期

7 聶昊;林子清;莫曉婷;魏以梁;孫啟凡;;DNA來源人種族推斷研究進(jìn)展[J];刑事技術(shù);2016年01期

8 劉海渤;孫啟凡;陳健剛;魏以梁;李越;唐暉;程寶文;李平;迪力·夏提;張濤;馬泉;趙興春;李彩霞;;27重SNP種族推斷體系準(zhǔn)確性驗證研究[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2015年06期

9 孫啟凡;趙蕾;徐穎;王瑋;龍源;馬紀(jì)強(qiáng);魏以梁;趙興春;葉健;李彩霞;;遺傳病推斷復(fù)合擴(kuò)增體系的構(gòu)建[J];刑事技術(shù);2015年05期

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【二級參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

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2 孫啟凡;趙蕾;孫敬;趙興春;李彩霞;;利用SNP復(fù)合擴(kuò)增技術(shù)推斷骨骼所屬人種1例[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2015年02期

3 李彩霞;賈竟;魏以梁;萬立華;胡蘭;葉健;;30個祖先信息位點的篩選及應(yīng)用[J];遺傳;2014年08期

4 李彩霞;胡蘭;;法醫(yī)遺傳學(xué)研究新進(jìn)展[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2013年02期

5 李彩霞;于子輝;賈竟;魏以梁;胡蘭;萬立華;;法醫(yī)SNP復(fù)合檢測體系的構(gòu)建及應(yīng)用[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2012年03期

6 侯光偉;劉利民;姜先華;賈菲;趙金玲;劉鋒;;常染色體21個SNPs多態(tài)性分型方法研究[J];中國法醫(yī)學(xué)雜志;2010年04期

7 于子輝;李彩霞;季安全;孫輝;蘇芹;嚴(yán)紅;胡蘭;;SNPlex系統(tǒng)檢測方法及在法醫(yī)遺傳學(xué)中的應(yīng)用前景[J];刑事技術(shù);2008年03期

8 張思仲;人類基因組的單核苷酸多態(tài)性及其醫(yī)學(xué)應(yīng)用[J];中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志;1999年02期

9 韓康信;;新疆哈密焉不拉克古墓人骨種系成分研究[J];考古學(xué)報;1990年03期

10 韓康信;新疆洛浦山普拉古墓人骨的種系問題[J];人類學(xué)學(xué)報;1988年03期

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本文編號:2409537

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