肺癌組織中STR基因座變異規(guī)律的研究
本文選題:法醫(yī)物證學 + 肺癌 ; 參考:《重慶醫(yī)科大學》2017年碩士論文
【摘要】:目的:本研究目的為探索20個常染色體STR基因座及Amel基因座在人肺癌組織中的變異規(guī)律,為肺癌組織的個人識別及親緣鑒定提供依據(jù)。方法:1.樣本采集:肺癌患者手術(shù)切除的癌組織和癌旁正常肺組織,并統(tǒng)計相關(guān)臨床資料(包含患者性別、年齡、病理分型及分期等)。2.DNA提取:使用組織基因組DNA提取試劑盒分別對腫瘤組織及癌旁正常組織進行DNA提取。3.PCR擴增及分型:使用MicroreaderTM21 Direct ID System人類熒光標記STR復合擴增檢驗試劑盒對提取的DNA樣本進行PCR擴增,然后用3130序列分析儀進行毛細管電泳;采用Gene Mapper ID V3.2基因分析軟件進行基因分型。4.統(tǒng)計學分析:通過Excel對基因分型結(jié)果進行變異率及變異類型統(tǒng)計,采用SPSS18.0軟件對變異分布與肺癌的病理分型、分期及患者的年齡、性別進行chi-square test檢驗及Cochran-Armitage趨勢檢驗。結(jié)果:1.出現(xiàn)變異的次數(shù)統(tǒng)計在75例肺癌樣本中有24例檢出不同于癌旁正常組織的變異,占肺癌組織樣本總數(shù)的32%。在21個常用STR基因座上共發(fā)現(xiàn)55次等位基因變異。D5S818基因座發(fā)生變異最多(7次),其次為D3S1358、D12S391基因座(5次),D2S441、Penta E基因座未檢出變異。2.出現(xiàn)變異的類型統(tǒng)計在出現(xiàn)等位基因變異的類型中,等位基因增加10次,雜合性等位基因完全丟失10次,部分性丟失35次。并且在同一肺癌組織中多個基因座可同時發(fā)生多種變異。3肺癌組織樣本的相關(guān)臨床資料統(tǒng)計結(jié)合目前實驗結(jié)果與肺癌患者的臨床資料分析,發(fā)現(xiàn)STR位點的變異與肺癌的分型、患者性別無聯(lián)系(P0.05),與肺癌的分期及患者年齡正相關(guān),各組間比較有統(tǒng)計學差異(P0.05)。結(jié)論:肺癌組織中STR基因座較常發(fā)生變異,并且變異更可能在年齡大、惡性程度高的肺癌中發(fā)生;本實驗檢出D2S441、Penta E基因座無變異,在今后的研究中可加大樣本量,進一步驗證可否將其納入穩(wěn)定的STR基因座范圍,為腫瘤組織等特殊檢材的個人識別及親緣關(guān)系鑒定提供依據(jù)。
[Abstract]:Objective: to explore the variation of 20 autosomal STR loci and Amel loci in human lung cancer tissues and to provide evidence for individual identification and genetic identification of lung cancer tissues. Method 1: 1. Sample collection: cancer tissues and adjacent normal lung tissues were surgically resected from lung cancer patients, and relevant clinical data were collected (including patient's sex, age, age). Pathological typing and staging. 2. DNA extraction: using tissue genomic DNA extraction kit to extract DNA from tumor tissues and adjacent normal tissues respectively. 3. PCR amplification and typing: MicroreaderTM21 Direct ID System human fluorescent labeled STR amplification test The extracted DNA samples were amplified by PCR with the kit. Then capillary electrophoresis was carried out with 3130 sequence analyzer and genotyping. 4. 4 with Gene Mapper ID V3.2 gene analysis software. Statistical analysis: the variation rate and variation type of genotyping results were analyzed by Excel. Chi-square test and Cochran-Armitage trend test were used to analyze the variation distribution and pathological classification, stage and age and sex of patients with lung cancer by SPSS18.0 software. The result is 1: 1. The frequency of mutation in 75 cases of lung cancer samples 24 cases were different from the adjacent normal tissues, accounting for 32% of the total samples of lung cancer tissue. A total of 55 alleles. D5S818 loci were detected in 21 common STR loci. The most frequent mutations occurred in the alleles of D5S818 loci, followed by D3S1358-D12S391 loci. No mutation was detected in D2S441penta E loci. Statistical analysis of the types of variation in alleles, alleles increased 10 times, heterozygosity alleles lost 10 times, partial alleles lost 35 times. And in the same lung cancer tissues, multiple loci can produce multiple variants at the same time. 3. The relevant clinical data of lung cancer tissue samples. 3. Combined with the current experimental results and the analysis of clinical data of lung cancer patients, we found that the variation of STR loci was associated with the classification of lung cancer. There was a positive correlation between the sex of the patients and the stage of lung cancer and the age of the patients. Conclusion: the mutation of STR locus in lung cancer tissues is more frequent, and the variation is more likely to occur in older lung cancer with high malignancy, and there is no mutation in D2S441penta E locus in this study, which can increase the sample size in future studies. To further verify whether it can be included in the stable STR locus to provide the basis for individual identification and phylogenetic identification of special samples such as tumor tissue.
【學位授予單位】:重慶醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:D919.4
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,本文編號:1933342
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