Rotor-Gene鏈融解曲線法甲基化標(biāo)記篩選技術(shù)的建立
本文選題:DNA甲基化 切入點(diǎn):鏈融解曲線法 出處:《鄭州大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)》2008年01期 論文類(lèi)型:期刊論文
【摘要】:目的:建立基于Rotor-Gene的鏈融解曲線法的甲基化標(biāo)記篩選技術(shù),分析各種影響因素,評(píng)估其實(shí)用性。方法:克隆Hela細(xì)胞雄激素受體基因外顯子-1的Bisulfite-PCR產(chǎn)物,挑出經(jīng)測(cè)序證實(shí)的可以代表不同甲基化程度的一組質(zhì)粒,并以之為模板,在Rotor-Gene3000實(shí)時(shí)定量PCR儀進(jìn)行擴(kuò)增和鏈融解,分析融鏈溫度、鏈融解曲線與甲基化程度、甲基化模式的相關(guān)性及各種影響因素。結(jié)果:基于Rotor-Gene的鏈融解曲線法,不僅可以區(qū)分甲基化與非甲基化,而且能夠鑒別片段內(nèi)細(xì)微的甲基化差異;主要的影響因素有升溫幅度、緩沖液離子強(qiáng)度、產(chǎn)物濃度等。結(jié)論:基于Rotor-Gene的鏈融解曲線法,可以集擴(kuò)增和鏈融解于一體,是一種經(jīng)濟(jì)簡(jiǎn)便的甲基化分析技術(shù),可用于樣品的甲基化篩選。
[Abstract]:Aim: to establish a methylation marker screening technique based on Rotor-Gene chain fusion curve, analyze various influencing factors and evaluate its practicability. Methods: Bisulfite-PCR products of androgen receptor gene exon 1 were cloned from Hela cells. A group of plasmids identified by sequencing as representing different levels of methylation were selected and used as templates for amplification and chain fusion using Rotor-Gene3000 real-time quantitative PCR apparatus to analyze the melting chain temperature, chain melting curve and methylation degree. Results: the chain fusion curve method based on Rotor-Gene could not only distinguish methylation from demethylation, but also distinguish the slight difference of methylation within segments. Conclusion: the chain melting curve method based on Rotor-Gene can integrate amplification and chain fusion. It is an economical and simple methylation analysis technique and can be used for methylation screening of samples.
【作者單位】: 華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院法醫(yī)學(xué)系 河南科技大學(xué)法醫(yī)學(xué)院 河南科技大學(xué)法醫(yī)學(xué)院 華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院法醫(yī)學(xué)系 華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院法醫(yī)學(xué)系
【分類(lèi)號(hào)】:D919
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1611802
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