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半柔性分子對(duì)接預(yù)測(cè)并篩選中藥治療SLE的活性成分

發(fā)布時(shí)間:2023-02-26 14:29
  目的:運(yùn)用半柔性分子對(duì)接和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)技術(shù),預(yù)測(cè)并篩選出中藥中對(duì)治療系統(tǒng)性紅斑狼瘡疾病的活性成分,建立中藥-活性成分-SLE靶蛋白的網(wǎng)絡(luò)圖,探討中藥中活性成分的功效,以及和SLE靶標(biāo)結(jié)合的作用機(jī)制,從而更好的更精準(zhǔn)的指導(dǎo)臨床中醫(yī)藥診治SLE,并拓展新藥研發(fā)及其他疾病的中醫(yī)藥診治。方法:統(tǒng)計(jì)中國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(CBM)近20年有關(guān)中藥治療SLE的文獻(xiàn),收集完整的處方,統(tǒng)計(jì)各味中藥出現(xiàn)頻次,提取前10位高頻中藥,通過Reaxys數(shù)據(jù)庫收集中藥小分子化合物,下載三維結(jié)構(gòu);并通過TTD數(shù)據(jù)庫調(diào)研收集與SLE疾病相關(guān)的靶蛋白,從PDB數(shù)據(jù)庫中下載所有蛋白質(zhì)靶標(biāo)結(jié)構(gòu),采用半柔性分子對(duì)接和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)技術(shù),運(yùn)用Discovery Studio(2.5 version,Accerlrys)軟件對(duì)前10位中藥的所含化學(xué)分子和治療SLE相關(guān)的靶蛋白進(jìn)行分子構(gòu)建和分子對(duì)接,用DS Ligand Fit模塊進(jìn)行半柔性分子對(duì)接,以靶標(biāo)與抑制劑復(fù)合物中的配體分子搜索活性位點(diǎn),以靶標(biāo)蛋白與抑制劑復(fù)合物中的小分子配體對(duì)接分?jǐn)?shù)為閾值,得分大于此閾值的中藥小分子認(rèn)為有活性,得出匹配分值較高的中藥活性分子和SLE靶標(biāo),通過...

【文章頁數(shù)】:47 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
致謝
中文摘要
abstract
注釋表
引言
歷史回顧
    1、半柔性分子對(duì)接技術(shù)在中醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用概述
        1.1 半柔性分子對(duì)接技術(shù)的理論基礎(chǔ)
        1.2 分子對(duì)接方法分類
        1.3 半柔性分子對(duì)接技術(shù)在中醫(yī)藥領(lǐng)域的探索
        1.4 半柔性分子對(duì)接技術(shù)在中藥作用機(jī)制研究中的應(yīng)用
    2、系統(tǒng)性紅斑狼瘡的中醫(yī)診療概述
        2.1 中醫(yī)病因探討
        2.2 中醫(yī)病機(jī)探討
        2.3 中醫(yī)辨證分型論治
    3、總結(jié)
1、前言
2、實(shí)驗(yàn)方法
    2.1 中藥小分子三維結(jié)構(gòu)庫的建立
    2.2 與SLE相關(guān)的靶標(biāo)的選擇
    2.3 中藥化學(xué)成分與靶標(biāo)蛋白的分子對(duì)接及網(wǎng)絡(luò)分析
3、實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    3.1 出現(xiàn)頻率最高的10 味中藥
    3.2 10味中藥化學(xué)成分分析
    3.3 系統(tǒng)性紅斑狼瘡治療靶標(biāo)PPI網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果
    3.4 中藥治療SLE活性成分預(yù)測(cè)
    3.5 中藥治療SLE的作用機(jī)制預(yù)測(cè)
4、實(shí)驗(yàn)討論
    4.1 SLE靶標(biāo)作用機(jī)制分析
    4.2 10味中藥藥性歸經(jīng)討論
    4.3 SLE的中醫(yī)辨證治療與計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的探討
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
答辯委員會(huì)名單
作者簡(jiǎn)歷



本文編號(hào):3750478

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