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基于DNA條形碼ITS2序列對(duì)阿魏屬藥用植物的鑒別研究

發(fā)布時(shí)間:2018-08-17 09:41
【摘要】:目的:建立一種快速、準(zhǔn)確和標(biāo)準(zhǔn)化的中藥材阿魏屬植物DNA條形碼鑒別方法。方法:提取新疆阿魏(Ferula sinkiangensis K.M.Shen)和阜康阿魏(Ferula fukanensis K.M.Shen)基因組DNA,擴(kuò)增ITS2序列并測(cè)序;運(yùn)用分析相似性搜索法,下載Gen Bank數(shù)據(jù)庫(kù)中阿魏屬植物13個(gè)物種26個(gè)樣本基因ITS2序列并進(jìn)行比對(duì)分析,計(jì)算種間種內(nèi)遺傳距離并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)進(jìn)行聚類分析。結(jié)果:通過(guò)計(jì)算,15個(gè)物種遺傳距離分布范圍為0.009~0.230,平均遺傳距離為0.018;聚類分析結(jié)果顯示DNA條形碼ITS2序列能夠?qū)⑽簩?2種植物聚為不同的類。結(jié)論:建立的阿魏藥材DNA條形碼ITS2序列鑒別方法可準(zhǔn)確、快速地鑒別出阿魏屬藥材的正品和混淆品。
[Abstract]:Objective: to establish a rapid, accurate and standardized DNA bar code method for identification of ferulic plants. Methods: the genomic DNAs of (Ferula sinkiangensis K.M.Shen and (Ferula fukanensis K.M.Shen from Xinjiang and Fukang were extracted, the ITS2 sequence was amplified and sequenced. The ITS2 sequences of 26 samples of 13 species of Ferula were downloaded from Gen Bank database and compared with each other. The genetic distance between species was calculated and phylogenetic tree was constructed for cluster analysis. Results: the genetic distance of 15 species ranged from 0.009 to 0.230, and the average genetic distance was 0.018.The result of cluster analysis showed that DNA barcode ITS2 sequence could cluster 32 species of Ferula into different classes. Conclusion: the established DNA barcode ITS2 sequence identification method can be used to identify the authentic and admixture of Ferula.
【作者單位】: 石河子大學(xué)藥學(xué)院;新疆維吾爾自治區(qū)藥物研究所/新疆維吾爾藥重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(No.81560714)
【分類號(hào)】:R29

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本文編號(hào):2187212

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