目的探討白花蛇舌草治療口腔癌的作用機(jī)制及其藥用價值。方法采用HIT、中藥綜合資源數(shù)據(jù)庫(TCMID)、PubMed、中藥系統(tǒng)藥理數(shù)據(jù)庫和分析平臺(TCMSP)數(shù)據(jù)庫檢索白花蛇舌草的化合物成分,根據(jù)毒藥物動力學(xué)(ADME)參數(shù)和里賓斯基五規(guī)則篩選具有成藥性的化合物成分,采用TCMSP,TargetNet,Pharmmapper數(shù)據(jù)庫檢索并篩選潛在靶點,采用DiseaseGene Network數(shù)據(jù)庫檢索口腔癌的相關(guān)靶點。采用STRING數(shù)據(jù)庫建立蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)關(guān)系,通過基因映射、拓?fù)浞治雠c富集分析的方法,預(yù)測白花蛇舌草治療口腔癌的核心靶點與通路,以及生物過程(BP)、細(xì)胞成分(CC)、分子功能(MF)。結(jié)果共收集到93種白花蛇舌草的化合物成分,經(jīng)ADME標(biāo)準(zhǔn)及里賓斯基五規(guī)則進(jìn)行篩選后共獲得32個化學(xué)結(jié)構(gòu)不同的化合物成分,353個不同的白花蛇舌草化合物的相關(guān)靶點;通過DiseaseGene Network數(shù)據(jù)庫,共收集到281個口腔癌的相關(guān)靶點;通過基因映射與拓?fù)浞治?共獲得200個白花蛇舌草治療口腔癌的作用靶點,75個具有拓?fù)渲匾缘陌悬c;通過富集分析獲得白花蛇舌草治療...

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【部分圖文】：

圖1口腔癌281個靶點的PPI網(wǎng)絡(luò)

基因映射:采用Cytoscape軟件，將353個白花蛇舌草預(yù)測靶點映射在以口腔癌PPI網(wǎng)絡(luò)為背景的網(wǎng)絡(luò)上，共獲得200個預(yù)測靶點，占口腔癌疾病靶點的71.17%。詳見圖2。拓?fù)浞治?白花蛇舌草治療口腔癌的200個預(yù)測靶點中，“Degree”中位數(shù)為23，“ClosenessCe....

圖2基因映射提取白花蛇舌草治療口腔癌的預(yù)測靶點

基于已獲得的200個白花蛇舌草治療口腔癌的預(yù)測靶點信息，建立PPI網(wǎng)絡(luò)，得1個具有200個節(jié)點、2604條邊的PPI網(wǎng)絡(luò)，選擇高置信度PPI，得1個具有200個節(jié)點、1204條邊的PPI網(wǎng)絡(luò)，詳見圖3。對預(yù)測靶點信息進(jìn)行富集分析，P<0.05時包括336個BP、38個CC、1....

圖3白花蛇舌草治療口腔癌的預(yù)測靶點高置信度PPI網(wǎng)絡(luò)

圖2基因映射提取白花蛇舌草治療口腔癌的預(yù)測靶點3討論

圖4白花蛇舌草治療口腔癌“靶點-通路”網(wǎng)絡(luò)圖

富集分析結(jié)果顯示，白花蛇舌草治療口腔癌主要作用于胞漿、核質(zhì)、細(xì)胞器膜、質(zhì)膜、細(xì)胞核等7個細(xì)胞成分，涉及了包括凋亡、增殖、炎性反應(yīng)、氧化應(yīng)激等51個生物過程及31個分子功能，這與已有的體內(nèi)外實驗研究結(jié)果一致[13-16]，其還參與如類固醇、單萜類、雜環(huán)類等多種物質(zhì)的生物代謝過程，這....

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