基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接探討四妙丸治療痛風(fēng)的分子機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2024-03-17 06:36
目的基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及分子對(duì)接初步探討四妙丸治療痛風(fēng)的作用機(jī)制。方法通過中藥系統(tǒng)藥理數(shù)據(jù)庫(kù)和分析平臺(tái)(TCMSP)和中藥分子機(jī)制的生物信息學(xué)在線分析工具(BATMAN-TCM)數(shù)據(jù)庫(kù)篩選四妙丸所含的活性化合物及作用靶點(diǎn);檢索GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)獲取痛風(fēng)相關(guān)的疾病靶點(diǎn);將藥物和疾病靶點(diǎn)導(dǎo)入Bioinformatics & Evolutionary Genomics取交集,即藥物(四妙丸)與疾病(痛風(fēng))的共同靶點(diǎn),并利用Cytoscape 3.7.1軟件構(gòu)建四妙丸-化合物-靶點(diǎn)-痛風(fēng)網(wǎng)絡(luò)圖;通過STRING數(shù)據(jù)庫(kù)和R軟件分別繪制PPI網(wǎng)絡(luò)圖和進(jìn)行基因本體論(GO)和京都基因與基因組百科全書(KEGG)富集分析;另外選取部分化合物和靶點(diǎn)通過MOE軟件進(jìn)行分子對(duì)接驗(yàn)證;最后通過單鈉尿酸鹽(MSU)結(jié)晶誘導(dǎo)人髓系白血病單核細(xì)胞(THP-1)復(fù)制痛風(fēng)細(xì)胞模型以進(jìn)一步驗(yàn)證上述結(jié)果。結(jié)果本研究共篩選出四妙丸相關(guān)活性化合物65個(gè),藥物相關(guān)靶點(diǎn)724個(gè),四妙丸與痛風(fēng)的共同靶點(diǎn)20個(gè);網(wǎng)絡(luò)圖提示槲皮素和山柰酚,環(huán)加氧酶 1(PTGS1)可能分別是四妙丸治療痛風(fēng)的有效化合物和靶點(diǎn);GO富集分析提示四...
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
本文編號(hào):3930655
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圖7不同劑量槲皮素對(duì)MAPK8蛋白表達(dá)影響的比較
干預(yù)24h后,通過Westernbolt檢測(cè)MAPK8蛋白表達(dá),結(jié)果表明:與空白組比較,模型組THP-1細(xì)胞MAPK8蛋白表達(dá)顯著升高(P<0.01);與模型組比較,槲皮素不同濃度組MAPK8蛋白表達(dá)水平明顯降低(P<0.05)(見圖7)。3討論
圖1四妙丸治療痛風(fēng)的靶點(diǎn)的Venn圖
2.6四妙丸對(duì)痛風(fēng)預(yù)測(cè)靶點(diǎn)的富集分析圖2四妙丸(SM)-化合物-靶點(diǎn)-痛風(fēng)(gout)網(wǎng)絡(luò)圖
圖2四妙丸(SM)-化合物-靶點(diǎn)-痛風(fēng)(gout)網(wǎng)絡(luò)圖
圖1四妙丸治療痛風(fēng)的靶點(diǎn)的Venn圖通過R3.6.0軟件及相關(guān)R軟件包,以Fisher檢驗(yàn)P<0.05,q<0.05為條件,進(jìn)行GO和KEGG富集分析,q值越小,富集程度越高。GO分析共包括62個(gè)條目,將富集程度最高的前20個(gè)條目繪制成條形圖,主要包括:轉(zhuǎn)錄輔因子結(jié)合、激活....
圖3四妙丸治療痛風(fēng)靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò)圖
2.7分子對(duì)接結(jié)果圖4四妙丸治療痛風(fēng)GO富集分析圖
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