目的探索小兒肺熱咳喘顆粒抗冠狀病毒的潛在作用機(jī)制。方法在TCMIP數(shù)據(jù)庫(kù)中查找小兒肺熱咳喘顆粒的各藥材-成分-靶點(diǎn)信息,同時(shí)檢索全方的候選靶基因,在Genecards數(shù)據(jù)庫(kù)中以"coronavirus"為關(guān)鍵詞搜索冠狀病毒相關(guān)靶點(diǎn),與小兒肺熱咳喘顆粒全方活性靶點(diǎn)映射篩選出共同靶點(diǎn)作為研究靶點(diǎn)。將篩選出的共同靶點(diǎn)在已經(jīng)總結(jié)的各藥材-成分-靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)中查找到對(duì)應(yīng)的成分及所屬藥材。將共同靶點(diǎn)導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫(kù)中構(gòu)建靶點(diǎn)相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,利用Cytoscape3.3.0軟件進(jìn)行可視化處理,篩選出核心靶點(diǎn)。借助OmicsBean分析平臺(tái)與STRING數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)靶點(diǎn)進(jìn)行基因本體(geneontology,GO)分析和KEGG信號(hào)通路富集分析。結(jié)果總結(jié)得到小兒肺熱咳喘顆粒342個(gè)化學(xué)成分,全方靶基因共有737個(gè)。Venny映射后的共同靶點(diǎn)48個(gè),對(duì)應(yīng)173個(gè)化合物,核心靶點(diǎn)19個(gè),主要化合物27個(gè)。GO生物過(guò)程(BP)條目3420個(gè),細(xì)胞組成(CC)條目239個(gè),分子功能(MF)條目343個(gè)。KEGG富集分析得到與小兒肺熱咳喘顆粒治療作用相關(guān)的信號(hào)通路160條。構(gòu)建了小兒肺熱咳喘顆粒核心靶點(diǎn)的"藥材...

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圖1小兒肺熱咳喘顆粒相關(guān)蛋白靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò)

將小兒肺熱咳喘顆粒48個(gè)冠狀病毒相關(guān)靶點(diǎn)蛋白輸入至STRING數(shù)據(jù)庫(kù)，構(gòu)建靶蛋白PPI網(wǎng)絡(luò)。該網(wǎng)絡(luò)共有47個(gè)節(jié)點(diǎn)，276條相互作用關(guān)系，平均度值為11.7。將在STRING平臺(tái)中構(gòu)建的PPI網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)導(dǎo)入Cytoscape3.3.0中（圖1），度值降序排列篩選出大于平均度值12的....

圖2小兒肺熱咳喘顆粒相關(guān)蛋白靶點(diǎn)的GO富集分析

分析富集的通路發(fā)現(xiàn)，主要有腫瘤壞死因子信號(hào)通路（TNFsignalingpathway）、乙型肝炎病毒（HepatitisB）、阿米巴類感染（Amoebiasis）、查加斯�。绹�(guó)錐蟲(chóng)病）（Chagasdisease(Americantrypanosomiasis)）；....

圖3小兒肺熱咳喘顆粒相關(guān)蛋白靶點(diǎn)KEGG通路富集分析的前10條通路

圖2小兒肺熱咳喘顆粒相關(guān)蛋白靶點(diǎn)的GO富集分析2.5小兒肺熱咳喘顆粒“藥材-成分-靶點(diǎn)-通路”網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

圖4小兒肺熱咳喘顆�！八幉�-成分-靶點(diǎn)-通路”網(wǎng)絡(luò)

將“2.3”項(xiàng)得到的19個(gè)核心靶點(diǎn)在已經(jīng)總結(jié)的各單味藥材成分-靶基因數(shù)據(jù)庫(kù)中查找到對(duì)應(yīng)的化學(xué)成分及所屬藥材，在Excel表格中建立藥材-成分、成分-靶點(diǎn)、靶點(diǎn)-通路的相互對(duì)應(yīng)關(guān)系，然后導(dǎo)入Cytoscape3.3.0軟件中構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)（圖4）。通過(guò)拓?fù)鋵傩苑治霭l(fā)現(xiàn)，該網(wǎng)絡(luò)有102....

本文編號(hào)：3915643