缺血性腦損傷是世界范圍內(nèi)致死和致殘的主要原因之一,針對該疾病的藥物開發(fā)也引起了越來越多的關(guān)注。腦缺血通常是由血栓或血栓栓塞性動脈閉塞引起的短暫或永久性的腦血流減少引起的。及時得恢復腦部血液的灌注而設(shè)計的溶栓治療被認為是缺血性腦損傷的主要合理治療策略。然而,溶栓治療后再灌注往往導致病灶周邊一系列的細胞、生化和代謝后果,包括細胞內(nèi)活性氧(ROS)生成、鈣超載、興奮性細胞損傷和炎癥,最終導致不可逆性腦損傷。腦缺血再灌注損傷的發(fā)病機制十分復雜,單一藥物的治療效果不佳,而聯(lián)合給藥很容易導致交叉反應(yīng)和未知的副作用。中藥保護劑的開發(fā)是腦缺血再灌注損傷及相關(guān)神經(jīng)退行性疾病治療的一個很有前途的方向。但因中藥成分復雜導致其用傳統(tǒng)研究方式難以闡明其作用機制及作用靶點。代謝組學和轉(zhuǎn)錄組學的結(jié)合是一種強有力的分析工具,通過鑒定出一系列的基因及代謝產(chǎn)物,可以揭示表型相關(guān)的基因功能和代謝途徑。因此,本文旨在通過代謝組與轉(zhuǎn)錄組結(jié)合的方式揭示兩種組學結(jié)果之間的聯(lián)系和聯(lián)合后的功能信息,從而闡明刺五加提取物治療腦缺血再灌注損傷的機制。1.刺五加提取物治療大鼠腦缺血再灌注的藥效學研究為了研究研究刺五加提取物(ASE)對wis...

【文章頁數(shù)】：95 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
致謝
中文摘要
abstract
引言
縮略詞表
文獻綜述
    1.單一組學概述
        1.1 基因組學
        1.2 轉(zhuǎn)錄組學
        1.3 代謝組學
        1.4 蛋白組學
        1.5 組學技術(shù)的延伸
    2.多組學數(shù)據(jù)處理與分析發(fā)展現(xiàn)狀
        2.1 數(shù)據(jù)處理方面
        2.2 數(shù)據(jù)處理平臺
        2.3 在線數(shù)據(jù)庫
    3 應(yīng)用
        3.1 生物功能的開發(fā)利用
        3.2 新藥研發(fā)
        3.3 疾病診斷與防治
        3.4 精準醫(yī)學
    4 多基因組技術(shù)面臨的挑戰(zhàn)與機遇
第一章 刺五加提取物對腦缺血再灌注損傷的藥效學研究
    1 實驗材料與方法
        1.1 藥物的提取與制備
        1.2 實驗材料與設(shè)備
    2 腦缺血再灌注模型建立方法
    3 樣品處理方法
        3.1 行為學評分標準與梗死面積計算
        3.2 HE染色與TUNEL檢測
        3.3 生化指標測定
        3.4 統(tǒng)計學方法
    4 實驗結(jié)果
        4.1 ASE治療后對大鼠行為學評分和腦梗死面積百分比的影響
        4.2 ASE治療后大鼠腦切片組織病理學變化
        4.3 ASE治療作用對大鼠腦組織中SOD,GSH-Px活性和MDA含量的影響
        4.4 ASE治療作用對大鼠腦組織中IL-6,IL-1β和 TNF-α水平的影響
    5 討論
第二章 刺五加提取物治療大鼠腦缺血再灌注損傷的血漿代謝組學研究
    1.實驗材料
        1.1 實驗儀器
        1.2 實驗試劑
        1.3 提取物制備
    2.實驗方法
        2.1 實驗動物處理與樣本收集
        2.2 血漿樣本前處理及LC-MS條件
        2.3 數(shù)據(jù)處理及模式識別方法
        2.4 代謝通路的富集分析
    3.實驗結(jié)果
        3.1藥效實驗
        3.2 代謝組學方法驗證
        3.3 代謝輪廓分析
        3.4 潛在生物標志物的篩選與鑒定
        3.5 代謝通路富集分析
    4.討論
第三章 刺五加提取物治療大鼠腦缺血再灌注損傷的轉(zhuǎn)錄組學研究
    1.材料與儀器
        1.1 實驗材料與試劑
        1.2 實驗樣品采集與前處理
    2.實驗方法
        2.1 Total RNA提取、質(zhì)檢
        2.2 序列分析文庫的構(gòu)建
        2.3 RNA-seq樣品測序與篩選
        2.4 參考序列比對分析
        2.5 基因表達水平分析
        2.6 基因表達差異分析與差異表達基因功能分析
        2.7 代謝組學與轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)聯(lián)合分析
    3.實驗結(jié)果
        3.1 大鼠腦組織中RNA質(zhì)檢結(jié)果
        3.2 RNA-seq樣品篩選后結(jié)果
        3.3 參考序列比對分析
        3.4 基因表達水平分析
        3.5 基因表達差異分析與篩選
        3.6 差異表達基因聚類分析
        3.7 差異表達基因功能分析
        3.8 代謝組學與轉(zhuǎn)錄組學聯(lián)合分析結(jié)果
    4.討論
總結(jié)
參考文獻
附錄
    附錄1
    附錄2
學位論文答辯委員會成員名單
作者簡介



本文編號：3781259