目的基于網(wǎng)絡(luò)藥理學探討真武湯治療慢性心力衰竭(chronic heart failure,CHF)的作用機制。方法通過中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學分析平臺(TCMSP)獲取真武湯中候選化合物,利用SwissTargetPrediction平臺進行候選靶標預(yù)測,并將TCMSP中相應(yīng)化合物的靶點作為補充,利用Uniprot數(shù)據(jù)庫將靶點蛋白轉(zhuǎn)化成基因名;通過CTD和TTD數(shù)據(jù)庫獲取CHF的相關(guān)基因,將真武湯靶標(基因)與CHF相關(guān)基因取交集作為真武湯治療CHF的潛在靶標,將交集基因提交至STRING11.0在線數(shù)據(jù)庫進行蛋白互做分析,并借助網(wǎng)絡(luò)可視化軟件Cytoscape3.7.1繪制蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,利用Excel構(gòu)建真武湯中藥-潛在化合物-潛在靶標網(wǎng)絡(luò),并利用Cytoscape 3.7.1進行可視化;通過RStudio的clusterProfiler包進行通路富集分析;利用分子對接技術(shù)對關(guān)鍵靶點和化合物的相互作用進行驗證。結(jié)果通過設(shè)置OB和DL值篩選得到真武湯化合物59種,在獲得交集基因36個后,剔除不含交集基因(靶標)的化學成分,最終篩得化合物49種,KEGG富集分析共獲得36條,其中13條與CH...

【文章頁數(shù)】：11 頁

【文章目錄】：
1 資料與方法
    1.1 真武湯活性化學成分篩選
    1.2 活性成分靶點預(yù)測
    1.3 CHF相關(guān)基因的獲取
    1.4 可視化網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
    1.5 KEGG通路富集分析
    1.6 關(guān)鍵活性成分與關(guān)鍵靶點的分子對接驗證
2 結(jié)果
    2.1 中藥候選化合物篩選結(jié)果
    2.2 候選化合物靶標預(yù)測
    2.3 CHF相關(guān)基因收集
    2.4 可視化網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
        2.4.1 真武湯HB-pC-pT網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
        2.4.2 CHF相關(guān)基因PPI網(wǎng)絡(luò)
    2.5 KEGG通路富集結(jié)果
    2.6 分子對接結(jié)果
3 討論



本文編號：3778755