基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討真武湯治療慢性心力衰竭的作用機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2023-04-02 06:42
目的基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討真武湯治療慢性心力衰竭(chronic heart failure,CHF)的作用機(jī)制。方法通過(guò)中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析平臺(tái)(TCMSP)獲取真武湯中候選化合物,利用SwissTargetPrediction平臺(tái)進(jìn)行候選靶標(biāo)預(yù)測(cè),并將TCMSP中相應(yīng)化合物的靶點(diǎn)作為補(bǔ)充,利用Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)將靶點(diǎn)蛋白轉(zhuǎn)化成基因名;通過(guò)CTD和TTD數(shù)據(jù)庫(kù)獲取CHF的相關(guān)基因,將真武湯靶標(biāo)(基因)與CHF相關(guān)基因取交集作為真武湯治療CHF的潛在靶標(biāo),將交集基因提交至STRING11.0在線數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行蛋白互做分析,并借助網(wǎng)絡(luò)可視化軟件Cytoscape3.7.1繪制蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,利用Excel構(gòu)建真武湯中藥-潛在化合物-潛在靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò),并利用Cytoscape 3.7.1進(jìn)行可視化;通過(guò)RStudio的clusterProfiler包進(jìn)行通路富集分析;利用分子對(duì)接技術(shù)對(duì)關(guān)鍵靶點(diǎn)和化合物的相互作用進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果通過(guò)設(shè)置OB和DL值篩選得到真武湯化合物59種,在獲得交集基因36個(gè)后,剔除不含交集基因(靶標(biāo))的化學(xué)成分,最終篩得化合物49種,KEGG富集分析共獲得36條,其中13條與CH...
【文章頁(yè)數(shù)】:11 頁(yè)
【文章目錄】:
1 資料與方法
1.1 真武湯活性化學(xué)成分篩選
1.2 活性成分靶點(diǎn)預(yù)測(cè)
1.3 CHF相關(guān)基因的獲取
1.4 可視化網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
1.5 KEGG通路富集分析
1.6 關(guān)鍵活性成分與關(guān)鍵靶點(diǎn)的分子對(duì)接驗(yàn)證
2 結(jié)果
2.1 中藥候選化合物篩選結(jié)果
2.2 候選化合物靶標(biāo)預(yù)測(cè)
2.3 CHF相關(guān)基因收集
2.4 可視化網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
2.4.1 真武湯HB-pC-pT網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
2.4.2 CHF相關(guān)基因PPI網(wǎng)絡(luò)
2.5 KEGG通路富集結(jié)果
2.6 分子對(duì)接結(jié)果
3 討論
本文編號(hào):3778755
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1 資料與方法
1.1 真武湯活性化學(xué)成分篩選
1.2 活性成分靶點(diǎn)預(yù)測(cè)
1.3 CHF相關(guān)基因的獲取
1.4 可視化網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
1.5 KEGG通路富集分析
1.6 關(guān)鍵活性成分與關(guān)鍵靶點(diǎn)的分子對(duì)接驗(yàn)證
2 結(jié)果
2.1 中藥候選化合物篩選結(jié)果
2.2 候選化合物靶標(biāo)預(yù)測(cè)
2.3 CHF相關(guān)基因收集
2.4 可視化網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
2.4.1 真武湯HB-pC-pT網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
2.4.2 CHF相關(guān)基因PPI網(wǎng)絡(luò)
2.5 KEGG通路富集結(jié)果
2.6 分子對(duì)接結(jié)果
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