基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討半夏治療直腸癌的作用機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2022-02-28 19:31
[目的]分析半夏的有效活性化合物及其對(duì)直腸癌靶點(diǎn)的作用機(jī)制。[方法]應(yīng)用中藥系統(tǒng)藥理數(shù)據(jù)庫與分析平臺(tái)(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)篩選出半夏中的潛在化學(xué)活性物質(zhì)及相關(guān)靶點(diǎn)蛋白,采用基因組注釋數(shù)據(jù)庫平臺(tái)(genome annotation database platform,Gene Cards)預(yù)測直腸癌的作用靶點(diǎn),并運(yùn)用Uniprot數(shù)據(jù)庫查詢與之相對(duì)應(yīng)的基因名稱,借助Cytoscape 3.7.2軟件,構(gòu)建"藥物-疾病-靶點(diǎn)"的網(wǎng)絡(luò)圖,通過String數(shù)據(jù)庫平臺(tái)構(gòu)建蛋白間相互作用(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò),再利用Bioconductor平臺(tái)和R語言(The R programming language)進(jìn)行基因本體(gene ontology,GO)富集分析和京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。[結(jié)果]通過...
【文章來源】:浙江中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,44(08)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 資料和方法
1.1 篩選半夏的關(guān)鍵化學(xué)成分
1.2 篩選半夏-直腸癌共同作用靶點(diǎn)
1.3 藥物-關(guān)鍵化學(xué)成分-疾病靶點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò)可視化
1.4 蛋白間相互作用(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
1.5 基因本體(gene ontology,GO)和京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopediaof Genes and Genomes,KEGG)富集分析
2 結(jié)果
2.1 半夏中化學(xué)成分的篩選
2.2 藥物-疾病靶點(diǎn)預(yù)測
2.3 藥物-關(guān)鍵化學(xué)成分-疾病網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)分析
2.5 GO功能富集分析
2.6 KEGG通路富集分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃芩苷藥理作用及新劑型的研究進(jìn)展[J]. 龍宇,向燕,譚裕君,李楠,楊啟悅. 中草藥. 2019(24)
[2]黃芩苷口腔緩釋膜聯(lián)合米諾環(huán)素對(duì)2型糖尿病牙周炎患者炎癥指標(biāo)的影響[J]. 郭常青. 光明中醫(yī). 2019(24)
[3]Baicalein attenuates neuroinflammation in LPS-activated BV-2 microglial cells through suppression of pro-inflammatory cytokines,COX2/NF-κB expressions and regulation of metabolic disorder[J]. YAN Jiao-jiao,GAO Li,QIN Xue-mei. 中國藥理學(xué)與毒理學(xué)雜志. 2019(10)
[4]小細(xì)胞肺癌關(guān)鍵基因及信號(hào)通路分析[J]. 毛昀,李林潞,薛鵬,徐芃芃,褚雪鐳,姜朋媛,蔡亞芳,朱世杰. 腫瘤防治研究. 2019(08)
[5]結(jié)直腸癌流行病學(xué)特征回顧性研究[J]. 武雪亮,王立坤,黃先濤,韓磊,孫光源,史永興,楊東東,薛軍. 中國醫(yī)藥導(dǎo)報(bào). 2019(20)
[6]β-谷甾醇誘導(dǎo)人胃癌細(xì)胞自噬與凋亡的作用及機(jī)制研究[J]. 孫玉成,劉曉巍,片光哲. 中國醫(yī)師雜志. 2019(06)
[7]一種新的MDM2-p53信號(hào)通路抑制劑的研究[J]. 涂瀟,李雷,張海波,劉揚(yáng),肖智雄,張渝君,曹洋. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2019(02)
[8]尤松鑫治療結(jié)直腸癌經(jīng)驗(yàn)探析[J]. 李瀟瀟,傅淑平,樊威,杜斌. 江蘇中醫(yī)藥. 2019(03)
[9]王晞星教授運(yùn)用健脾疏肝和胃方治療結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移經(jīng)驗(yàn)[J]. 殷杰,王晞星. 中醫(yī)臨床研究. 2019(01)
[10]王明福主任運(yùn)用補(bǔ)中益氣湯治療疑難雜病經(jīng)驗(yàn)[J]. 趙海燕,何昌生,王明福. 光明中醫(yī). 2018(22)
本文編號(hào):3645454
【文章來源】:浙江中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,44(08)
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 資料和方法
1.1 篩選半夏的關(guān)鍵化學(xué)成分
1.2 篩選半夏-直腸癌共同作用靶點(diǎn)
1.3 藥物-關(guān)鍵化學(xué)成分-疾病靶點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò)可視化
1.4 蛋白間相互作用(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
1.5 基因本體(gene ontology,GO)和京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopediaof Genes and Genomes,KEGG)富集分析
2 結(jié)果
2.1 半夏中化學(xué)成分的篩選
2.2 藥物-疾病靶點(diǎn)預(yù)測
2.3 藥物-關(guān)鍵化學(xué)成分-疾病網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)分析
2.5 GO功能富集分析
2.6 KEGG通路富集分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃芩苷藥理作用及新劑型的研究進(jìn)展[J]. 龍宇,向燕,譚裕君,李楠,楊啟悅. 中草藥. 2019(24)
[2]黃芩苷口腔緩釋膜聯(lián)合米諾環(huán)素對(duì)2型糖尿病牙周炎患者炎癥指標(biāo)的影響[J]. 郭常青. 光明中醫(yī). 2019(24)
[3]Baicalein attenuates neuroinflammation in LPS-activated BV-2 microglial cells through suppression of pro-inflammatory cytokines,COX2/NF-κB expressions and regulation of metabolic disorder[J]. YAN Jiao-jiao,GAO Li,QIN Xue-mei. 中國藥理學(xué)與毒理學(xué)雜志. 2019(10)
[4]小細(xì)胞肺癌關(guān)鍵基因及信號(hào)通路分析[J]. 毛昀,李林潞,薛鵬,徐芃芃,褚雪鐳,姜朋媛,蔡亞芳,朱世杰. 腫瘤防治研究. 2019(08)
[5]結(jié)直腸癌流行病學(xué)特征回顧性研究[J]. 武雪亮,王立坤,黃先濤,韓磊,孫光源,史永興,楊東東,薛軍. 中國醫(yī)藥導(dǎo)報(bào). 2019(20)
[6]β-谷甾醇誘導(dǎo)人胃癌細(xì)胞自噬與凋亡的作用及機(jī)制研究[J]. 孫玉成,劉曉巍,片光哲. 中國醫(yī)師雜志. 2019(06)
[7]一種新的MDM2-p53信號(hào)通路抑制劑的研究[J]. 涂瀟,李雷,張海波,劉揚(yáng),肖智雄,張渝君,曹洋. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2019(02)
[8]尤松鑫治療結(jié)直腸癌經(jīng)驗(yàn)探析[J]. 李瀟瀟,傅淑平,樊威,杜斌. 江蘇中醫(yī)藥. 2019(03)
[9]王晞星教授運(yùn)用健脾疏肝和胃方治療結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移經(jīng)驗(yàn)[J]. 殷杰,王晞星. 中醫(yī)臨床研究. 2019(01)
[10]王明福主任運(yùn)用補(bǔ)中益氣湯治療疑難雜病經(jīng)驗(yàn)[J]. 趙海燕,何昌生,王明福. 光明中醫(yī). 2018(22)
本文編號(hào):3645454
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