哈蟆油與蟾蜍油蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析
發(fā)布時間:2022-02-18 00:56
旨在篩選哈蟆油和蟾蜍油中特異性的蛋白質(zhì),發(fā)現(xiàn)這些差異蛋白與生長環(huán)境、冬眠及發(fā)育的關(guān)系。采用i TRAQ結(jié)合質(zhì)譜技術(shù)建立哈蟆油和蟾蜍油蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫,通過比較兩個蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫,對篩選的差異蛋白進行Gene ontology功能注釋和生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,差異表達蛋白的總數(shù)為68個,其中上調(diào)蛋白61個,下調(diào)蛋白7個。哈蟆油中含量較高的7個差異蛋白主要分為五大類,黏蛋白類(PREDICTED:mucin-5AC-like,PREDICTED:similar to mucin,mCG142254, partial)、膠原蛋白(collagen alpha-1(Ⅲ) chain)、α激酶錨定蛋白13樣(PREDICTED:a-kinase anchor protein 13-like)、免疫球蛋白Fc段連接蛋白樣(PREDICTED:IgGFc-binding protein-like)、膜聯(lián)蛋白(annexin A1),以上蛋白主要參與免疫調(diào)節(jié)、生長發(fā)育等過程;同時發(fā)現(xiàn)哈蟆油中抗凍成分主要為黏蛋白類,而蟾蜍油中主要為凝集素。哈蟆油中含量較高的7個差異蛋白質(zhì)可作為哈蟆油區(qū)別于蟾蜍油的重要成...
【文章來源】:中國農(nóng)學(xué)通報. 2020,36(26)
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 樣品采集
1.2 儀器和試劑
1.3 方法
1.3.1 蛙油提取
1.3.2 蛋白質(zhì)提取
1.3.3 iTRAQ定量
1.3.4 差異蛋白篩選
1.3.5 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 蟾蜍油與哈蟆油差異蛋白篩選結(jié)果
2.1.1 蟾蜍油中含量較高的特異性成分(上調(diào)蛋白)
2.1.2 哈蟆油中含量較高的特異性成分(下調(diào)蛋白)
2.2 WEGO注釋分析結(jié)果
2.2.1 細(xì)胞組分分析
2.2.2 分子功能分析
2.2.3 生物學(xué)過程分析
2.3 KEGG代謝通路分析
3 討論與結(jié)論
3.1 生活習(xí)性的差異
3.2 抗凍成分差異
3.3 哈蟆油特異性膨脹度
3.4 結(jié)論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]膜聯(lián)蛋白A1生理功能研究進展[J]. 郭宇含,張紅. 貴州醫(yī)藥. 2019(04)
[2]應(yīng)用iTRAQ結(jié)合2D LC-MS/MS技術(shù)分析哈蟆油與偽品蛙油的差異蛋白質(zhì)組[J]. 魏星華,王銘,張玉堯,潘黛安,蘇航,齊濱,張鶴,趙大慶. 遼寧中醫(yī)雜志. 2019(03)
[3]東北林蛙的陸地生活期和冬眠期生態(tài)[J]. 佟慶,王闖,崔立勇. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2015(12)
[4]中國林蛙的生態(tài)習(xí)性[J]. 尹冬冬,鞠丹,吳新宇. 養(yǎng)殖技術(shù)顧問. 2013(09)
[5]應(yīng)用iTRAQ結(jié)合2D LC-MS/MS技術(shù)分析草菇同核和異核菌絲蛋白質(zhì)組[J]. 劉靖宇,江玉姬,謝寶貴,陳炳智,廖偉,鄧優(yōu)錦,劉朋虎. 食用菌學(xué)報. 2012(01)
[6]粘蛋白研究進展[J]. 彭志紅,汪榮泉. 胃腸病學(xué)和肝病學(xué)雜志. 2010(10)
[7]糖蛋白的研究進展[J]. 郭慧,鄧文星,張映. 生物技術(shù)通報. 2009(03)
[8]中國林蛙油鑒別方法研究進展及建議[J]. 崔巖,侯曉東,崔春月,劉亞明. 林業(yè)實用技術(shù). 2007(10)
[9]糖鏈-細(xì)胞表面蛋白質(zhì)的信號天線[J]. 紀(jì)洪濤,劉國振,李莉云. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2006(05)
[10]糖蛋白的結(jié)構(gòu)與功能[J]. 韓益飛,徐世清,朱江,沈衛(wèi)德,鄭必平. 生物學(xué)雜志. 2001(02)
碩士論文
[1]牛蛙、中華大蟾蜍及東北林蛙輸卵管理化特性的比較研究[D]. 蔡鳳坤.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[2]桑螟越冬幼蟲抗寒性及有效積溫的研究[D]. 陳永杰.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
本文編號:3630333
【文章來源】:中國農(nóng)學(xué)通報. 2020,36(26)
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 樣品采集
1.2 儀器和試劑
1.3 方法
1.3.1 蛙油提取
1.3.2 蛋白質(zhì)提取
1.3.3 iTRAQ定量
1.3.4 差異蛋白篩選
1.3.5 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 蟾蜍油與哈蟆油差異蛋白篩選結(jié)果
2.1.1 蟾蜍油中含量較高的特異性成分(上調(diào)蛋白)
2.1.2 哈蟆油中含量較高的特異性成分(下調(diào)蛋白)
2.2 WEGO注釋分析結(jié)果
2.2.1 細(xì)胞組分分析
2.2.2 分子功能分析
2.2.3 生物學(xué)過程分析
2.3 KEGG代謝通路分析
3 討論與結(jié)論
3.1 生活習(xí)性的差異
3.2 抗凍成分差異
3.3 哈蟆油特異性膨脹度
3.4 結(jié)論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]膜聯(lián)蛋白A1生理功能研究進展[J]. 郭宇含,張紅. 貴州醫(yī)藥. 2019(04)
[2]應(yīng)用iTRAQ結(jié)合2D LC-MS/MS技術(shù)分析哈蟆油與偽品蛙油的差異蛋白質(zhì)組[J]. 魏星華,王銘,張玉堯,潘黛安,蘇航,齊濱,張鶴,趙大慶. 遼寧中醫(yī)雜志. 2019(03)
[3]東北林蛙的陸地生活期和冬眠期生態(tài)[J]. 佟慶,王闖,崔立勇. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2015(12)
[4]中國林蛙的生態(tài)習(xí)性[J]. 尹冬冬,鞠丹,吳新宇. 養(yǎng)殖技術(shù)顧問. 2013(09)
[5]應(yīng)用iTRAQ結(jié)合2D LC-MS/MS技術(shù)分析草菇同核和異核菌絲蛋白質(zhì)組[J]. 劉靖宇,江玉姬,謝寶貴,陳炳智,廖偉,鄧優(yōu)錦,劉朋虎. 食用菌學(xué)報. 2012(01)
[6]粘蛋白研究進展[J]. 彭志紅,汪榮泉. 胃腸病學(xué)和肝病學(xué)雜志. 2010(10)
[7]糖蛋白的研究進展[J]. 郭慧,鄧文星,張映. 生物技術(shù)通報. 2009(03)
[8]中國林蛙油鑒別方法研究進展及建議[J]. 崔巖,侯曉東,崔春月,劉亞明. 林業(yè)實用技術(shù). 2007(10)
[9]糖鏈-細(xì)胞表面蛋白質(zhì)的信號天線[J]. 紀(jì)洪濤,劉國振,李莉云. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2006(05)
[10]糖蛋白的結(jié)構(gòu)與功能[J]. 韓益飛,徐世清,朱江,沈衛(wèi)德,鄭必平. 生物學(xué)雜志. 2001(02)
碩士論文
[1]牛蛙、中華大蟾蜍及東北林蛙輸卵管理化特性的比較研究[D]. 蔡鳳坤.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[2]桑螟越冬幼蟲抗寒性及有效積溫的研究[D]. 陳永杰.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
本文編號:3630333
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