基于反向分子對(duì)接理論探討黃連治療2型糖尿病效應(yīng)物質(zhì)群及其多成分多靶點(diǎn)的分子機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2022-01-11 08:18
目的:研究黃連治療2型糖尿病的效應(yīng)物質(zhì)群,探討其多成分多靶點(diǎn)的分子機(jī)制。方法:依據(jù)本課題前期蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)篩選出的血漿差異蛋白,利用生物信息學(xué)分析技術(shù)與多個(gè)數(shù)據(jù)庫及文獻(xiàn)篩選,采用反向分子對(duì)接技術(shù),探尋黃連治療2型糖尿病的有效成分群;同時(shí)運(yùn)用分子生物學(xué)技術(shù)(PCR及Western Blot)從細(xì)胞層面對(duì)效應(yīng)成分群進(jìn)行作用機(jī)制研究。結(jié)果:(1)選定從前期蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)研究出的黃連治療2型糖尿病密切相關(guān)靶點(diǎn)蛋白65個(gè);(2)確定與黃連中化學(xué)成分親和力較高的14個(gè)蛋白質(zhì)(Pla2g7、G6PD、PSMA6、C4、C2、APOC3、APOC1、PRDX2、PKM2、APOE、GPX3、IGF-1、IGFBP4、IGFBP6);(3)確定黃連治療2型糖尿病的有效成分可能有:Berberine、Coptisine、Epiberberine、Palmatine、Jatrorrhizine等5種化學(xué)成分。(4)通過分子生物學(xué)技術(shù)確定黃連5種效應(yīng)成分對(duì)親和力較高的14個(gè)靶標(biāo)中的10個(gè)蛋白(G6PD、PSMA6、PRDX2、PKM2、GPX3、IGF-1、IGFBP4、IGFBP6、APOC1、APOE)具...
【文章來源】:華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:95 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
黃連5種成分與磷脂酶A2(Pla2g7)的對(duì)接模式圖
成疏水作用,由于巴馬汀的共軛結(jié)構(gòu),還與G6PDA鏈的Phe253產(chǎn)生π-π堆積作用;黃連堿與表小檗堿與G6PD無相互作用。圖2.黃連 3 種成分與G6PD的對(duì)接模式圖。A:在3D示意圖中,黃連成分以綠色顯示,其余顏色表示靶蛋白;B:在平面示意圖中,綠色線條表示疏水作用,黑色虛線代表氫鍵。1.4.3.3 黃連5種成分與PSMA6的對(duì)接模式如圖3所示,黃連5種成分的羥基是形成氫鍵的作用位點(diǎn),這些氫鍵是穩(wěn)定效應(yīng)物質(zhì)與PSMA6活性位點(diǎn)相互作用的關(guān)鍵因素,效應(yīng)物質(zhì)與PSMA6之間另一個(gè)穩(wěn)定結(jié)合的作用力為疏水作用。黃連堿與PSMA6 I鏈活性位點(diǎn)上的殘基Ala49、Thr48形成疏水作用;表小檗堿與PSMA6 I鏈活性位點(diǎn)上的殘基Thr21、Ala49、Ala20、Thr48形成疏水作用;藥根堿與PSMA6無疏水作用建;巴馬汀與PSMA6 I鏈活性位點(diǎn)上的殘基Ala49、Ala20、Thr48形成疏水作用;這些作用力使得效應(yīng)物質(zhì)能夠與活性位點(diǎn)區(qū)域牢固的結(jié)合。黃連堿與表小檗堿與PSMA6無相互作用。
華 中 科 技 大 學(xué) 碩 士 學(xué) 位 論 文33圖3. 黃連5種成分與PSMA6的對(duì)接模式圖。A:在3D示意圖中,效應(yīng)物質(zhì)以綠色顯示,其余顏色表示靶蛋白;B:在平面示意圖中,綠色線條表示疏水作用,黑色虛線代表氫鍵。小檗堿與PSMA6無作用鍵。1.4.3.4 黃連5種成分與PKM2的對(duì)接模式如圖4所示,五種效應(yīng)物質(zhì)的羥基是形成氫鍵的作用位點(diǎn),這些氫鍵是穩(wěn)定效應(yīng)物質(zhì)與PKM2活性位點(diǎn)相互作用的關(guān)鍵因素,效應(yīng)物質(zhì)與PKM2之間另一個(gè)穩(wěn)定結(jié)合的作用力為疏水作用。如圖所示,小檗堿與PKM2A鏈活性位點(diǎn)上的殘基Leu394形成疏水作用,表小檗堿與PKM2A鏈活性位點(diǎn)上的殘基Phe26、Leu33、Leu353形成疏水作用;巴馬汀與PKM2 A鏈活性位點(diǎn)上的殘基Thr48、Ala49、Ala20形成疏水作用;黃連堿與藥根堿與PKM2鏈活性位點(diǎn)上的殘基未形成疏水作用;這些作用力使得效應(yīng)物質(zhì)能夠牢固的結(jié)合在活性位點(diǎn)區(qū)域。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于反向分子對(duì)接技術(shù)土貝母皂苷甲抗腫瘤機(jī)制研究[J]. 史海龍,黨琳,崔亞亞,王玉成,陳哲. 遼寧中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(07)
[2]基于反向?qū)臃ǖ狞S連堿抗炎機(jī)制分子模擬研究[J]. 徐佑?xùn)|,張艷,孟憲麗,曾勇,王平. 中藥與臨床. 2016(02)
[3]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的元胡止痛滴丸治療原發(fā)性痛經(jīng)的作用機(jī)制研究[J]. 韓彥琪,許浚,張喜民,張鐵軍,任一杰,劉昌孝. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2016(03)
[4]基于反向?qū)臃ǖ拇簏S酸抗炎作用的分子機(jī)制研究[J]. 徐佑?xùn)|,張艷,孟憲麗,曾勇,王平. 四川生理科學(xué)雜志. 2016(01)
[5]丹酚酸B對(duì)阿霉素誘導(dǎo)H9c2細(xì)胞毒性的保護(hù)作用及其作用靶點(diǎn)[J]. 卓賢進(jìn),申慧芳,方志潮,丁云崗,王滔,崔國禎. 廣東醫(yī)學(xué). 2015(24)
[6]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的逍遙散抗抑郁活性成分作用靶點(diǎn)研究[J]. 高耀,高麗,高曉霞,周玉枝,秦雪梅,田俊生. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2015(12)
[7]黃連抗氧化作用與糖尿病的研究進(jìn)展[J]. 張倩,梁曉春. 中國中藥雜志. 2015(12)
[8]反向分子對(duì)接法預(yù)測(cè)丹參醇A的潛在靶點(diǎn)[J]. 陳少軍,陳宏降,郭章華. 中藥藥理與臨床. 2014(05)
[9]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的清肺消炎丸抗炎機(jī)制的初步研究[J]. 程彬峰,侯媛媛,姜民,趙振營(yíng),董林毅,白鋼. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2013(05)
[10]反向分子對(duì)接-藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)和確認(rèn)的新途徑[J]. 范勝軍,李學(xué)軍. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2012(05)
本文編號(hào):3582449
【文章來源】:華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:95 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
黃連5種成分與磷脂酶A2(Pla2g7)的對(duì)接模式圖
成疏水作用,由于巴馬汀的共軛結(jié)構(gòu),還與G6PDA鏈的Phe253產(chǎn)生π-π堆積作用;黃連堿與表小檗堿與G6PD無相互作用。圖2.黃連 3 種成分與G6PD的對(duì)接模式圖。A:在3D示意圖中,黃連成分以綠色顯示,其余顏色表示靶蛋白;B:在平面示意圖中,綠色線條表示疏水作用,黑色虛線代表氫鍵。1.4.3.3 黃連5種成分與PSMA6的對(duì)接模式如圖3所示,黃連5種成分的羥基是形成氫鍵的作用位點(diǎn),這些氫鍵是穩(wěn)定效應(yīng)物質(zhì)與PSMA6活性位點(diǎn)相互作用的關(guān)鍵因素,效應(yīng)物質(zhì)與PSMA6之間另一個(gè)穩(wěn)定結(jié)合的作用力為疏水作用。黃連堿與PSMA6 I鏈活性位點(diǎn)上的殘基Ala49、Thr48形成疏水作用;表小檗堿與PSMA6 I鏈活性位點(diǎn)上的殘基Thr21、Ala49、Ala20、Thr48形成疏水作用;藥根堿與PSMA6無疏水作用建;巴馬汀與PSMA6 I鏈活性位點(diǎn)上的殘基Ala49、Ala20、Thr48形成疏水作用;這些作用力使得效應(yīng)物質(zhì)能夠與活性位點(diǎn)區(qū)域牢固的結(jié)合。黃連堿與表小檗堿與PSMA6無相互作用。
華 中 科 技 大 學(xué) 碩 士 學(xué) 位 論 文33圖3. 黃連5種成分與PSMA6的對(duì)接模式圖。A:在3D示意圖中,效應(yīng)物質(zhì)以綠色顯示,其余顏色表示靶蛋白;B:在平面示意圖中,綠色線條表示疏水作用,黑色虛線代表氫鍵。小檗堿與PSMA6無作用鍵。1.4.3.4 黃連5種成分與PKM2的對(duì)接模式如圖4所示,五種效應(yīng)物質(zhì)的羥基是形成氫鍵的作用位點(diǎn),這些氫鍵是穩(wěn)定效應(yīng)物質(zhì)與PKM2活性位點(diǎn)相互作用的關(guān)鍵因素,效應(yīng)物質(zhì)與PKM2之間另一個(gè)穩(wěn)定結(jié)合的作用力為疏水作用。如圖所示,小檗堿與PKM2A鏈活性位點(diǎn)上的殘基Leu394形成疏水作用,表小檗堿與PKM2A鏈活性位點(diǎn)上的殘基Phe26、Leu33、Leu353形成疏水作用;巴馬汀與PKM2 A鏈活性位點(diǎn)上的殘基Thr48、Ala49、Ala20形成疏水作用;黃連堿與藥根堿與PKM2鏈活性位點(diǎn)上的殘基未形成疏水作用;這些作用力使得效應(yīng)物質(zhì)能夠牢固的結(jié)合在活性位點(diǎn)區(qū)域。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]基于反向?qū)臃ǖ狞S連堿抗炎機(jī)制分子模擬研究[J]. 徐佑?xùn)|,張艷,孟憲麗,曾勇,王平. 中藥與臨床. 2016(02)
[3]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的元胡止痛滴丸治療原發(fā)性痛經(jīng)的作用機(jī)制研究[J]. 韓彥琪,許浚,張喜民,張鐵軍,任一杰,劉昌孝. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2016(03)
[4]基于反向?qū)臃ǖ拇簏S酸抗炎作用的分子機(jī)制研究[J]. 徐佑?xùn)|,張艷,孟憲麗,曾勇,王平. 四川生理科學(xué)雜志. 2016(01)
[5]丹酚酸B對(duì)阿霉素誘導(dǎo)H9c2細(xì)胞毒性的保護(hù)作用及其作用靶點(diǎn)[J]. 卓賢進(jìn),申慧芳,方志潮,丁云崗,王滔,崔國禎. 廣東醫(yī)學(xué). 2015(24)
[6]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的逍遙散抗抑郁活性成分作用靶點(diǎn)研究[J]. 高耀,高麗,高曉霞,周玉枝,秦雪梅,田俊生. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2015(12)
[7]黃連抗氧化作用與糖尿病的研究進(jìn)展[J]. 張倩,梁曉春. 中國中藥雜志. 2015(12)
[8]反向分子對(duì)接法預(yù)測(cè)丹參醇A的潛在靶點(diǎn)[J]. 陳少軍,陳宏降,郭章華. 中藥藥理與臨床. 2014(05)
[9]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的清肺消炎丸抗炎機(jī)制的初步研究[J]. 程彬峰,侯媛媛,姜民,趙振營(yíng),董林毅,白鋼. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2013(05)
[10]反向分子對(duì)接-藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)和確認(rèn)的新途徑[J]. 范勝軍,李學(xué)軍. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2012(05)
本文編號(hào):3582449
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