新型冠狀病毒肺炎合并高血壓靶點基因分析以及治療中藥預測
發(fā)布時間:2021-12-29 15:29
目的:篩選并分析新型冠狀病毒肺炎合并高血壓靶點基因同時探索潛在治療中藥。方法:篩選出新型冠狀病毒肺炎合并高血壓共同靶點基因并進行蛋白互作,分析出高度值和血管緊張素轉換酶2(ACE2)相關的兩個模塊的重要靶點基因。根據(jù)兩個模塊的重點靶點基因預測相關中醫(yī)癥狀以及中藥;根據(jù)兩個模塊的重要靶點基因進行GO功能分析和KEGG通路分析。結果:獲得新型冠狀病毒肺炎合并高血壓共同靶點基因197個,獲得高度值靶點基因18個和ACE2及其相關靶點基因共14個兩個重要靶點基因模塊,獲得發(fā)熱、頭痛等中醫(yī)癥狀和鉤藤、麻黃、苦杏仁、青蒿、葛根等中藥。兩個模塊的GO功能分析的細胞組分的前5個過程中的4個過程具有明顯的一致性,KEGG通路分析有共同的8個信號通路。結論:獲得了新型冠狀病毒肺炎合并高血壓靶點基因,并篩選和分析出重要靶點基因,同時也預測了具有潛在治療作用的中藥,為臨床用藥提供了參考。
【文章來源】:中國醫(yī)院藥學雜志. 2020,40(13)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
COVID-19與高血壓靶點基因交集韋恩圖
交集靶點基因蛋白互作網(wǎng)絡圖
將兩個模塊的COVID-19合并高血壓的重要靶點基因去除3個重復靶點基因后,獲得29個靶點基因,分別輸入SymMap數(shù)據(jù)庫,獲得了P<0.05的中藥3 999項(未去重),對其歸類統(tǒng)計,含有≥80項中藥的中藥分類見圖5。通過圖可以看出大部分中藥集中歸類于化濕藥、清熱解毒藥、清熱瀉火藥、活血祛瘀藥、補益藥、化痰藥、止咳平喘藥等藥;將3 999項中藥條目按中藥名稱篩選,中藥出現(xiàn)頻率≥10的獲得了197味,進一步篩選出常用常見的中藥100味,見圖6。此外,在SymMap數(shù)據(jù)庫中還獲得了ACE2靶點基因對應的中藥,為柴胡、川牛膝、葛根、葛花、貫眾、海桐皮、松子仁、委陵菜、萱草根。同時獲得P<0.05的中醫(yī)癥狀426項,出現(xiàn)頻率≥7的中醫(yī)癥狀見圖7。通過圖可以看出中醫(yī)癥狀集中于發(fā)熱、發(fā)燒、頭痛、頭項痛、肌肉痛等癥狀。此外,載脂蛋白E(apolipoprotein E,APOE)等9個靶點基因所對應的癥狀未能統(tǒng)計在圖7中,但這個9靶點基因對應的中醫(yī)癥狀也同等重要,其對應癥狀見圖8。圖4 14個靶點基因蛋白互作圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]托珠單抗在新型冠狀病毒治療中的臨床藥學指引[J]. 張建紅,朱立勤,劉子艷,劉玉媛. 中國醫(yī)院藥學雜志. 2020(10)
[2]指南推薦中藥注射劑在新型冠狀病毒肺炎治療的應用及藥學監(jiān)護[J]. 王曉陽. 中國醫(yī)院藥學雜志. 2020(08)
[3]肝脾辨治在新型冠狀病毒肺炎診治中的思考[J]. 杜宏波,張耀圣,王彤,梁騰霄,孟捷,吳華陽,楊先照,吳崢嶸,葉永安. 世界中醫(yī)藥. 2020(03)
[4]苦參多路徑抗冠狀病毒的機制探究[J]. 李振,俞科賢. 中草藥. 2020(04)
[5]中西醫(yī)結合治療新型冠狀病毒肺炎作用的思考[J]. 劉清泉,夏文廣,安長青,李旭成,王玉光,苗青,楊豐文,張伯禮. 中醫(yī)雜志. 2020(06)
[6]Clinical and biochemical indexes from 2019-nCoV infected patients linked to viral loads and lung injury[J]. Yingxia Liu,Yang Yang,Cong Zhang,Fengming Huang,Fuxiang Wang,Jing Yuan,Zhaoqin Wang,Jinxiu Li,Jianming Li,Cheng Feng,Zheng Zhang,Lifei Wang,Ling Peng,Li Chen,Yuhao Qin,Dandan Zhao,Shuguang Tan,Lu Yin,Jun Xu,Congzhao Zhou,Chengyu Jiang,Lei Liu. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[7]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[8]盧尚嶺對高血壓的病機認識與臨證經驗總結[J]. 丁元慶. 山東中醫(yī)雜志. 2020(01)
[9]SARS冠狀病毒對血液系統(tǒng)的影響及可能的機制(英文)[J]. 楊默,韓錦倫,李桂霞,霍泰輝,李志光. 中國實驗血液學雜志. 2003(03)
本文編號:3556400
【文章來源】:中國醫(yī)院藥學雜志. 2020,40(13)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
COVID-19與高血壓靶點基因交集韋恩圖
交集靶點基因蛋白互作網(wǎng)絡圖
將兩個模塊的COVID-19合并高血壓的重要靶點基因去除3個重復靶點基因后,獲得29個靶點基因,分別輸入SymMap數(shù)據(jù)庫,獲得了P<0.05的中藥3 999項(未去重),對其歸類統(tǒng)計,含有≥80項中藥的中藥分類見圖5。通過圖可以看出大部分中藥集中歸類于化濕藥、清熱解毒藥、清熱瀉火藥、活血祛瘀藥、補益藥、化痰藥、止咳平喘藥等藥;將3 999項中藥條目按中藥名稱篩選,中藥出現(xiàn)頻率≥10的獲得了197味,進一步篩選出常用常見的中藥100味,見圖6。此外,在SymMap數(shù)據(jù)庫中還獲得了ACE2靶點基因對應的中藥,為柴胡、川牛膝、葛根、葛花、貫眾、海桐皮、松子仁、委陵菜、萱草根。同時獲得P<0.05的中醫(yī)癥狀426項,出現(xiàn)頻率≥7的中醫(yī)癥狀見圖7。通過圖可以看出中醫(yī)癥狀集中于發(fā)熱、發(fā)燒、頭痛、頭項痛、肌肉痛等癥狀。此外,載脂蛋白E(apolipoprotein E,APOE)等9個靶點基因所對應的癥狀未能統(tǒng)計在圖7中,但這個9靶點基因對應的中醫(yī)癥狀也同等重要,其對應癥狀見圖8。圖4 14個靶點基因蛋白互作圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]托珠單抗在新型冠狀病毒治療中的臨床藥學指引[J]. 張建紅,朱立勤,劉子艷,劉玉媛. 中國醫(yī)院藥學雜志. 2020(10)
[2]指南推薦中藥注射劑在新型冠狀病毒肺炎治療的應用及藥學監(jiān)護[J]. 王曉陽. 中國醫(yī)院藥學雜志. 2020(08)
[3]肝脾辨治在新型冠狀病毒肺炎診治中的思考[J]. 杜宏波,張耀圣,王彤,梁騰霄,孟捷,吳華陽,楊先照,吳崢嶸,葉永安. 世界中醫(yī)藥. 2020(03)
[4]苦參多路徑抗冠狀病毒的機制探究[J]. 李振,俞科賢. 中草藥. 2020(04)
[5]中西醫(yī)結合治療新型冠狀病毒肺炎作用的思考[J]. 劉清泉,夏文廣,安長青,李旭成,王玉光,苗青,楊豐文,張伯禮. 中醫(yī)雜志. 2020(06)
[6]Clinical and biochemical indexes from 2019-nCoV infected patients linked to viral loads and lung injury[J]. Yingxia Liu,Yang Yang,Cong Zhang,Fengming Huang,Fuxiang Wang,Jing Yuan,Zhaoqin Wang,Jinxiu Li,Jianming Li,Cheng Feng,Zheng Zhang,Lifei Wang,Ling Peng,Li Chen,Yuhao Qin,Dandan Zhao,Shuguang Tan,Lu Yin,Jun Xu,Congzhao Zhou,Chengyu Jiang,Lei Liu. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[7]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[8]盧尚嶺對高血壓的病機認識與臨證經驗總結[J]. 丁元慶. 山東中醫(yī)雜志. 2020(01)
[9]SARS冠狀病毒對血液系統(tǒng)的影響及可能的機制(英文)[J]. 楊默,韓錦倫,李桂霞,霍泰輝,李志光. 中國實驗血液學雜志. 2003(03)
本文編號:3556400
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