目的:基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探討牛蒡子的藥理作用機制。方法:本研究利用TCMSP、UniProt、CTD等數(shù)據(jù)庫分析牛蒡子的化學(xué)成分、靶點、疾病,并利用DAVID數(shù)據(jù)庫進行基因本體（gene ontology,GO）富集分析及基因組百科全書（kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路分析,并采用Cytoscape軟件繪圖。結(jié)果:檢索數(shù)據(jù)分析選出8個備選化合物、篩選出相關(guān)的50個靶蛋白,這些化合物及靶蛋白與354類疾病密切關(guān)聯(lián);GO富集分析顯示最為密切的生物過程與細胞炎癥、凋亡相關(guān);KEGG富集分析顯示最具顯著性的通路與心血管、糖尿病、腫瘤有關(guān)。結(jié)論:本研究系統(tǒng)地探討牛蒡子的主要成分最為相關(guān)的靶點及其作用機制,為臨床研究提供了新的思路。 

【文章來源】：中醫(yī)學(xué)報. 2020,35(09)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

化合物-靶點蛋白網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖

檢索與基因相關(guān)的疾病共有354種。度值靠前的基因為血管內(nèi)皮生長因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、白蛋白基因(albumin,ALB)、芳香烴受體(aryl hydrocarbon receptor,AHR)、BCL2、對氧磷酶1(paraoxonase1,PON1),度值分別為:71、67、54、51、50。在疾病中,度值靠前的是:前列腺腫瘤、乳腺腫瘤、糖尿病、高血壓、胃腫瘤,分別為:20、18、12、12、11,見圖2。2.4 構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(PPI)及hub蛋白的提取

將靶蛋白對應(yīng)的基因?qū)隨tring數(shù)據(jù)庫,以互作分數(shù)(interaction score)≥0.4為參照,獲取PPI網(wǎng)絡(luò),共獲取50個節(jié)點,280條邊,平均度值為11.2,見圖3。用cytohubba插件獲得hub蛋白,hub蛋白包括:ALB、VEGFA、MAPK8、AR、CASP3、ESR1、MYC、RELA、CTNNB1、AHR,見圖4。圖4 PPI網(wǎng)絡(luò)中的hub蛋白

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3510897