基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的西紅花治療動脈粥樣硬化作用機(jī)制探討
發(fā)布時間:2021-11-21 15:59
目的:基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探究西紅花對治療動脈粥樣硬化的潛在作用靶點(diǎn)。方法:運(yùn)用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析平臺(TCMSP)篩選西紅花有效成分的作用靶點(diǎn);運(yùn)用GeneCards、OMIM數(shù)據(jù)庫篩選動脈粥樣硬化的藥物靶點(diǎn)構(gòu)建疾病靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),進(jìn)而構(gòu)建藥物-成分-疾病-靶點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò)圖并進(jìn)行蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)互作、GO功能分析、KEGG通路等分析。運(yùn)用AutoDock對有效成分和關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行分子對接。結(jié)果:選擇生物利用度(OB)>30%,且類藥性(DL)>0.18作為西紅花中的有效成分篩選條件,共得到5個主要成分和272個靶點(diǎn);通過對藥物-成分-疾病-靶點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò)圖進(jìn)行分析,得到多化合物共同作用靶點(diǎn)26個,單化合物作用靶點(diǎn)50個;通過蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)互作分析對蛋白質(zhì)靶點(diǎn)基因進(jìn)行篩選(degree>50),共篩選出19個相關(guān)靶點(diǎn)基因; GO分析共包含99條富集結(jié)果,KEGG數(shù)據(jù)庫中共包含116條通路對動脈粥樣硬化有治療作用。西紅花的5個主要成分均可與Fluid shear stress and atherosclerosis重要信號通路中的關(guān)鍵蛋白VCAM-1和eNOS進(jìn)行對接,其中異鼠李素與VCA...
【文章來源】:中國臨床藥理學(xué)與治療學(xué). 2020,25(06)CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 藥物化學(xué)成分篩選及靶點(diǎn)預(yù)測
1.2疾病靶點(diǎn)預(yù)測
1.3 網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建與分析
1.4 蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(protein-protein inter-actions,PPI)的構(gòu)建
1.5 靶點(diǎn)基因功能的Gene Ontology(GO)分析與Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析
1.6 分子對接驗(yàn)證
2 結(jié)果
2.1 西紅花有效成分篩選結(jié)果
2.2 疾病靶點(diǎn)預(yù)測結(jié)果
2.3 網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建與分析結(jié)果
2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)互作結(jié)果
2.5 GO功能分析結(jié)果
2.6 KEGG富集分析結(jié)果
2.7 分子對接驗(yàn)證結(jié)果
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的虎杖抗高血脂作用及信號通路研究[J]. 鄭麗,莫娟芬,吳加元,郭麗,鮑軼. 中國臨床藥理學(xué)與治療學(xué). 2019(10)
[2]西紅花及其活性成分的國內(nèi)、外臨床研究概況[J]. 李顏,郭澄. 中國藥房. 2019(17)
[3]西紅花酸對PDGF-BB誘導(dǎo)下血管平滑肌細(xì)胞增殖、遷移的抑制作用[J]. 鐘子君,吳一洲,許方方,蘇松偉,李巖. 現(xiàn)代中西醫(yī)結(jié)合雜志. 2019(25)
[4]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究丹參治療帕金森病的作用機(jī)制[J]. 章水晶,杜仲燕. 中國臨床藥理學(xué)與治療學(xué). 2019(06)
[5]雌激素對心血管系統(tǒng)的細(xì)胞作用機(jī)制的探討[J]. 陳建,洪秀琴. 中華老年心腦血管病雜志. 2019(03)
[6]小窩蛋白1在血管重塑中的研究進(jìn)展[J]. 馮祺論,唐曉鴻. 中華高血壓雜志. 2019(02)
[7]人參皂苷Rb1通過Caveolin-1/eNOS/NO通路抗人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞衰老[J]. 周彬,余舒杰,劉定輝,王敏,柯世業(yè),錢孝賢. 中藥材. 2019(01)
[8]西紅花HPLC指紋圖譜建立及成分分析[J]. 邢越陽,高崎,張雪,司睿蓉,吳佩穎. 中成藥. 2019(01)
[9]冠心病“痰瘀滯虛”理論內(nèi)涵與外延[J]. 王階,邢雁偉,姚魁武,李軍,陳光,董艷,熊興江,劉詠梅,李洪崢,張振鵬. 中醫(yī)雜志. 2019(04)
[10]西紅花苷保護(hù)心血管疾病藥理研究進(jìn)展[J]. 朱安運(yùn),鄧亮,孫琳,夏嬙,王雅溶,李小波,杜聯(lián)峰,張浩,陳陽. 中華中醫(yī)藥學(xué)刊. 2018(02)
本文編號:3509802
【文章來源】:中國臨床藥理學(xué)與治療學(xué). 2020,25(06)CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 藥物化學(xué)成分篩選及靶點(diǎn)預(yù)測
1.2疾病靶點(diǎn)預(yù)測
1.3 網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建與分析
1.4 蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(protein-protein inter-actions,PPI)的構(gòu)建
1.5 靶點(diǎn)基因功能的Gene Ontology(GO)分析與Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析
1.6 分子對接驗(yàn)證
2 結(jié)果
2.1 西紅花有效成分篩選結(jié)果
2.2 疾病靶點(diǎn)預(yù)測結(jié)果
2.3 網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建與分析結(jié)果
2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)互作結(jié)果
2.5 GO功能分析結(jié)果
2.6 KEGG富集分析結(jié)果
2.7 分子對接驗(yàn)證結(jié)果
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的虎杖抗高血脂作用及信號通路研究[J]. 鄭麗,莫娟芬,吳加元,郭麗,鮑軼. 中國臨床藥理學(xué)與治療學(xué). 2019(10)
[2]西紅花及其活性成分的國內(nèi)、外臨床研究概況[J]. 李顏,郭澄. 中國藥房. 2019(17)
[3]西紅花酸對PDGF-BB誘導(dǎo)下血管平滑肌細(xì)胞增殖、遷移的抑制作用[J]. 鐘子君,吳一洲,許方方,蘇松偉,李巖. 現(xiàn)代中西醫(yī)結(jié)合雜志. 2019(25)
[4]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究丹參治療帕金森病的作用機(jī)制[J]. 章水晶,杜仲燕. 中國臨床藥理學(xué)與治療學(xué). 2019(06)
[5]雌激素對心血管系統(tǒng)的細(xì)胞作用機(jī)制的探討[J]. 陳建,洪秀琴. 中華老年心腦血管病雜志. 2019(03)
[6]小窩蛋白1在血管重塑中的研究進(jìn)展[J]. 馮祺論,唐曉鴻. 中華高血壓雜志. 2019(02)
[7]人參皂苷Rb1通過Caveolin-1/eNOS/NO通路抗人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞衰老[J]. 周彬,余舒杰,劉定輝,王敏,柯世業(yè),錢孝賢. 中藥材. 2019(01)
[8]西紅花HPLC指紋圖譜建立及成分分析[J]. 邢越陽,高崎,張雪,司睿蓉,吳佩穎. 中成藥. 2019(01)
[9]冠心病“痰瘀滯虛”理論內(nèi)涵與外延[J]. 王階,邢雁偉,姚魁武,李軍,陳光,董艷,熊興江,劉詠梅,李洪崢,張振鵬. 中醫(yī)雜志. 2019(04)
[10]西紅花苷保護(hù)心血管疾病藥理研究進(jìn)展[J]. 朱安運(yùn),鄧亮,孫琳,夏嬙,王雅溶,李小波,杜聯(lián)峰,張浩,陳陽. 中華中醫(yī)藥學(xué)刊. 2018(02)
本文編號:3509802
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